FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0706.ptfa, 1120 aa vs ./tmplib.26680 library 1767897 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4728+/-0.00797; mu= -0.9844+/- 0.527 mean_var=301.6006+/-73.145, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 151 in 1/35 Lambda= 0.0739 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0591 ( 1162 res) mpm05364 (1162) 2098 238 8.1e-63 mKIAA4102 ( 1138 res) mbg06734 (1138) 1500 174 1.2e-43 mKIAA0359 ( 757 res) mbg06791 ( 757) 912 111 6.6e-25 mKIAA0531 ( 987 res) mbg05983 ( 987) 553 73 2.6e-13 mKIAA4086 ( 1158 res) mbg06649 (1158) 539 72 8.1e-13 mKIAA4058 ( 832 res) mic12051 ( 832) 405 57 1.3e-08 >>mKIAA0591 ( 1162 res) mpm05364 (1162 aa) initn: 3766 init1: 2097 opt: 2098 Z-score: 1220.1 bits: 237.7 E(): 8.1e-63 Smith-Waterman score: 4388; 64.885% identity (68.085% ungapped) in 1085 aa overlap (9-1085:13-1054) 10 20 30 40 50 mKIAA0 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