FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0128.ptfa, 449 aa vs ./tmplib.26680 library 1768568 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2299+/-0.00615; mu= 8.3112+/- 0.409 mean_var=222.7427+/-52.421, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.0859 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0202 ( 470 res) mbh00446 ( 470) 2058 268 1e-72 mKIAA4020 ( 391 res) mfj24359 ( 391) 964 132 6.4e-32 mKIAA0991 ( 605 res) mph02064 ( 605) 849 118 1.6e-27 mKIAA0158 ( 367 res) mpm05359 ( 367) 835 116 4e-27 mKIAA4169 ( 281 res) mbg08918 ( 281) 589 85 5.3e-18 >>mKIAA0202 ( 470 res) mbh00446 (470 aa) initn: 2051 init1: 2051 opt: 2058 Z-score: 1397.7 bits: 267.9 E(): 1e-72 Smith-Waterman score: 2058; 76.399% identity (76.773% ungapped) in 411 aa overlap (40-449:61-470) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 AEAPEAALADQGAMAAADIARQVGEDCRTVPLAGHVGFD-SLPDQLVNKSVSQGFCFNIL : :. .:. :: . : :::.::: :::: mKIAA0 PQPARPVRSSPWRPPTWNASRTQSLSPGACPWAAMLGLTASLTSWSV-KSVTQGFSFNIL 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 CVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLQSNTYDLQESNVGLKLTIVSTVGFG ::::::.::.:::.::::: :: : :.: . :.:. .::::::::: ::::::..:::: mKIAA0 CVGETGIGKATLMNTLFNTTFETEEASHHEECVRLRPQTYDLQESNVHLKLTIVDAVGFG 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 DQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHSYHDSRIHVCLYFIAPTGHSLKSLD :::::.:::.:::..:::::: :::::::::: : .:::.:::::::::.:::::::::: mKIAA0 DQINKDDSYRPIVDYIDAQFENYLQEELKIRRSLFDYHDTRIHVCLYFITPTGHSLKSLD 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 LVTMKKLDSKVNIIPVIAKSDAISKSELAKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVSEIN :::::::::::::::.:::.:.:::::: :::::: .:::::::::::::::::.:.::: mKIAA0 LVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEIN 210 220 230 240 250 260 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 GTMNAHLPFAVVGSTEEVKIGNKMMRARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDL ..:::::::::::::::::.:::..::::::::.:::::: ::::::::::::::::::: mKIAA0 AVMNAHLPFAVVGSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDL 270 280 290 300 310 320 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 REQTHARHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMF :::::.::::::::::::::::.:.: ::.::::::::::::.:::.:::.::::::::: mKIAA0 REQTHSRHYELYRRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMF 330 340 350 360 370 380 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 VQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQEEKKKLEDKKKCLDEEMNAFKQRKAAAELL :..::: : :::: :.::::::..::..:::::.:.:.:.. :.:: :::. :::: : : mKIAA0 VNKVKETELELKEKERELHEKFEHLKRIHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNCRKAAMEAL 390 400 410 420 430 440 430 440 mKIAA0 QSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN :::. .: ..: :..::.::: mKIAA0 QSQALHATSQQPLRKDKDKKN 450 460 470 >>mKIAA4020 ( 391 res) mfj24359 (391 aa) initn: 906 init1: 300 opt: 964 Z-score: 665.4 bits: 132.1 E(): 6.4e-32 Smith-Waterman score: 964; 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