# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj19322.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1344.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1344, 839 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920398 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9965+/-0.000181; mu= 13.9528+/- 0.010 mean_var=68.9487+/-13.516, 0's: 44 Z-trim: 56 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.154458 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148688739|gb|EDL20686.1| RIKEN cDNA 5730420B22, ( 838) 5431 1219.9 0 gi|81912006|sp|Q7TN22.1|TXD16_MOUSE RecName: Full= ( 820) 5332 1197.8 0 gi|26338115|dbj|BAC32743.1| unnamed protein produc ( 819) 5314 1193.8 0 gi|109502273|ref|XP_001072487.1| PREDICTED: hypoth ( 854) 4860 1092.6 0 gi|149033498|gb|EDL88296.1| similar to 5730420B22R ( 853) 4842 1088.6 0 gi|109501509|ref|XP_341302.3| PREDICTED: hypotheti ( 852) 4751 1068.4 0 gi|109083582|ref|XP_001103706.1| PREDICTED: simila ( 825) 4215 948.9 0 gi|152012498|gb|AAI50206.1| Thioredoxin domain con ( 825) 4192 943.8 0 gi|73963807|ref|XP_537446.2| PREDICTED: similar to ( 821) 4162 937.1 0 gi|219521271|gb|AAI44470.1| Unknown (protein for M ( 820) 4143 932.9 0 gi|112418480|gb|AAI21863.1| Hypothetical protein M ( 771) 2303 522.8 2.1e-145 gi|12856893|dbj|BAB30819.1| unnamed protein produc ( 354) 2284 518.3 2.2e-144 gi|224051972|ref|XP_002200455.1| PREDICTED: thiore ( 807) 1863 424.8 7.2e-116 gi|10434025|dbj|BAB14101.1| unnamed protein produc ( 357) 1639 374.6 4.1e-101 gi|20071984|gb|AAH27108.1| Txndc16 protein [Mus mu ( 225) 1513 346.4 8.1e-93 gi|125841541|ref|XP_685017.2| PREDICTED: similar t ( 747) 1098 254.3 1.4e-64 gi|210117516|gb|EEA65253.1| hypothetical protein B ( 620) 548 131.7 9.5e-28 gi|210116783|gb|EEA64525.1| hypothetical protein B ( 832) 455 111.0 2.1e-21 gi|115625659|ref|XP_788739.2| PREDICTED: hypotheti (1038) 336 84.6 2.4e-13 gi|115931013|ref|XP_001190577.1| PREDICTED: hypoth (1288) 336 84.7 2.8e-13 gi|198428968|ref|XP_002126329.1| PREDICTED: simila ( 457) 317 80.1 2.4e-12 gi|156206976|gb|EDO29138.1| predicted protein [Nem ( 226) 260 67.2 9.1e-09 gi|221101959|ref|XP_002169077.1| PREDICTED: simila ( 751) 227 60.2 3.8e-06 gi|189234306|ref|XP_971669.2| PREDICTED: similar t ( 384) 208 55.7 4.2e-05 gi|47214695|emb|CAG01048.1| unnamed protein produc ( 490) 202 54.5 0.00013 gi|28302197|gb|AAH46707.1| Grp58-prov protein [Xen ( 502) 202 54.5 0.00013 gi|190581240|gb|EDV21318.1| hypothetical protein T ( 929) 201 54.5 0.00025 gi|186511078|ref|NP_001118842.1| ATPDIL1-3 (PDI-LI ( 518) 198 53.6 0.00025 gi|4678297|emb|CAB41088.1| protein disulfide-isome ( 566) 198 53.6 0.00027 gi|18072841|emb|CAC81067.1| ERp72 [Arabidopsis tha ( 579) 198 53.7 0.00027 gi|3392892|emb|CAA12644.1| protein disulphide isom ( 489) 192 52.3 0.0006 gi|193290418|gb|ACF17572.1| protein disulphide iso ( 517) 192 52.3 0.00063 gi|13235614|emb|CAC33587.1| protein disulphide iso ( 517) 192 52.3 0.00063 gi|94468776|gb|ABF18237.1| thioredoxin/protein dis ( 397) 190 51.7 0.0007 gi|108882047|gb|EAT46272.1| protein disulfide isom ( 397) 189 51.5 0.00082 gi|157019026|gb|EAA06539.4| AGAP000044-PA [Anophel ( 424) 189 51.5 0.00086 gi|158592201|gb|EDP30803.1| probable protein disul ( 609) 190 51.9 0.00097 gi|66546657|ref|XP_623282.1| PREDICTED: similar to ( 490) 188 51.4 0.0011 gi|156213576|gb|EDO34590.1| predicted protein [Nem ( 359) 183 50.2 0.0019 gi|49257115|dbj|BAD24715.1| protein disulfide isom ( 362) 183 50.2 0.0019 gi|212002608|gb|EEB08268.1| disulfide-isomerase c ( 366) 183 50.2 0.0019 gi|167873642|gb|EDS37025.1| disulfide-isomerase ti ( 396) 182 50.0 0.0024 gi|121901086|gb|EAY06107.1| hypothetical protein T ( 451) 182 50.0 0.0027 gi|194210084|ref|XP_001915778.1| PREDICTED: simila ( 702) 183 50.4 0.0032 gi|187026455|emb|CAP34591.1| Hypothetical protein ( 616) 179 49.4 0.0054 gi|167865489|gb|EDS28872.1| disulfide-isomerase A6 ( 436) 176 48.7 0.0065 gi|193892968|gb|EDV91834.1| GH24386 [Drosophila gr ( 409) 174 48.2 0.0085 gi|145011514|gb|EDJ96170.1| hypothetical protein M ( 688) 176 48.8 0.0093 gi|194166969|gb|EDW81870.1| GK25489 [Drosophila wi ( 415) 173 48.0 0.01 >>gi|148688739|gb|EDL20686.1| RIKEN cDNA 5730420B22, iso (838 aa) initn: 5429 init1: 4838 opt: 5431 Z-score: 6533.3 bits: 1219.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 5431; 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