FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4109.ptfa, 801 aa vs ./tmplib.26680 library 1768216 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7654+/-0.00557; mu= 3.2839+/- 0.370 mean_var=184.9922+/-45.454, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 11 in 1/35 Lambda= 0.0943 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0639 ( 810 res) mbg16237 ( 810) 1246 182 2.1e-46 >>mKIAA0639 ( 810 res) mbg16237 (810 aa) initn: 920 init1: 660 opt: 1246 Z-score: 925.4 bits: 182.1 E(): 2.1e-46 Smith-Waterman score: 1375; 37.084% identity (40.055% ungapped) in 782 aa overlap (55-786:1-774) 30 40 50 60 70 80 mKIAA4 ELHQAKDVNTGGVFQLRQGHSRRVQVTVKPVQHSGTLPLMVEAILSVSIGCVTAR---ST ::.::::::: : ::::.:::: .: : mKIAA0 VQESGTLPLMEECILSVGIGCVKVRPLRSP 10 20 30 90 100 110 120 130 mKIAA4 KLQRG-------LDSYQEEDLNCVRERWSDALIKRREYLDEQIKKVSNKKEKTEDDMERE :.... .::::..::. .:..: .:: ::.::::.:..:. .:..::::: .:: mKIAA0 KIHENVHEEEEDMDSYQDRDLERLRRKWLNALTKRQEYLDQQLQKLVSKHDKTEDDADRE 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 mKIAA4 ARLVEQWVGLTEERNAVLVPAPGSGIPGAPADWVPPPGMETHIPVLFLDLNADDLSANEQ :.:.:. . ::::::::.::. :::::::::.:.: :::::::::.::::::::.:.... mKIAA0 AQLLEMRLTLTEERNAVMVPSAGSGIPGAPAEWTPVPGMETHIPVIFLDLNADDFSSQDN 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 mKIAA4 LVGPHASGVNSILPKEHGSQFFYLPIIKHSDDEVSATASWDSSVHDSLHLNRVTPQNERI : :.: : .. : :. .:: : :.:. : ::.: :::::.::. .:.. :: .::. mKIAA0 LDDPEA-GWDATLTGEEEEEFFELQIVKQHDGEVKAEASWDSAVHSCPQLSKGTPADERV 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 mKIAA4 YLIVKTTVQLSHPAAMELVLRKRIAANIYNKQSFTQSLKRRISLINICYSCGVTYEIVSN .::...:::::::: :.::::::: ......:.:.::: ...: . .::::.::::: mKIAA0 FLILRVTVQLSHPADMQLVLRKRICVHVHGRQGFAQSLLKKMSHRSSIPGCGVTFEIVSN 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 mKIAA4 IPKATEEIEDRETLALLAARSENEGTLDGETYIEKYTRGVLQVENILSLERLRQAVTVKE ::. .. .:.::.:: .:: :: .. :.:.::::: :.:: :::.:.:.:::: :.::: mKIAA0 IPEDAQGVEEREALARMAANVENPASADSEAYIEKYLRSVLAVENLLTLDRLRQEVAVKE 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 mKIAA4 ALSTKARHIRRSLSTPNVHNVSSSRPDLSGFDE--DDKGWPENQLDVSDYSSSYQDVACY :. :.. :::.:.:... .:.:: .:: ..:: :.: :::. : . .: mKIAA0 QLTGKGKLSRRSISSPSMNRLSGSRQELSPSHSLGSNKGRWESQQDVSQTLVS-RGIAPG 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 mKIAA4 GTLPRDSPRRSKEGCPSENPHALT-VSPFKAFSPQPPKFFKPLMPVKEEHKKR----LAL ::. .. . :. . : . ..: :.. :: ::..: :.::..... : :: mKIAA0 PPALSVSPQNNQSSDPGLGGVAASYLNPVKSLVPQMPKLLKSLFPVRDDRRGRHSSPLAH 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 EARP-LLSQESMPPSQAH--NPGCIVTPGSNGSSMPVEHSSKPEKKIDSEEEENELEALS . : .: : .. . : . . .:: .:. . . . : :: .. .. . mKIAA0 QPVPRILVQPTFSDTWATRTEEAQQGSPGPSGALESMVKMAAPAVKI--CDKPVKVSSPP 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 mKIAA4 RKLMLTQPY-------VPVEFADFSVYNASLENREWSSSKADLTDSRALEKAVSRSPTTS ...::: :. :. . .. :. . : . . :. .: . . :: . mKIAA0 SPMVVTQPPEGQDGPPSPLSEASSGYFSHSVSSATLSETLTLGLDTTGLGSQTPGSPPAL 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 mKIAA4 SLTS-----GYFSHSASNATLSDMA-VPSSDS-SDQLAVS----TKEVECAEPPGPSLAP .. ...: . :. . : ::.. . : .: : .: : : .: mKIAA0 CQVTPEPELAFLSCTLSHPPAPEEAHVPAAPTQSTELEVPRAPLLSEPASAVPTSPFRIR 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 mKIAA4 DVRRASNQELTEV--GRGSGKDETIAVPLEENSALPK--GTPSPQSIPEESSRMPCRTAS :: . . .: . : .:: .: . . ..: . : : :..:..: mKIAA0 KVRTSELKSFTGMLGGASSGAEEDPLASEDPSNARGQTLGRLEVTSDSEDASEVPEWLRE 630 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 760 mKIAA4 CSELDVGPSKDGHQAREFCPGEVTIEHTTNILEDHSFTEFMGVSDGKDFDGLADCSVG-- . :: .: : .: . : . .. : . : ::.. :. : mKIAA0 GEYVVVGTNKTG-IVRYIGPTDFQEGTWIGVELDLPAGKNDGSIGGKQY---FRCNPGYG 690 700 710 720 730 740 770 780 790 800 mKIAA4 ---EPSR-RRAL-TNETDHKGI-PERPPDADRLHPKIENDQEATATR .::: :::. :.. .:. :. :.. : mKIAA0 LLVRPSRVRRAVGTGRRRSSGLQPQGAPEVRRSATISGSATNLASLTAALAKGDRSYKNP 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 ENRKSWAS 810 801 residues in 1 query sequences 1768216 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:02:08 2006 done: Mon Mar 27 11:02:09 2006 Scan time: 0.930 Display time: 0.050 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]