FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1278.ptfa, 1271 aa vs ./tmplib.26680 library 1767746 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1911+/-0.00478; mu= 17.5342+/- 0.320 mean_var=105.6107+/-24.107, 0's: 0 Z-trim: 48 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1248 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1901 ( 1234 res) mpg03874 (1234) 510 103 2.5e-22 mKIAA4230 ( 408 res) mbg00138 ( 408) 497 101 6.2e-22 mKIAA4088 ( 652 res) mph00951 ( 652) 488 99 2.6e-21 mKIAA4207 ( 780 res) mph00550 ( 780) 485 99 4.2e-21 mKIAA1477 ( 771 res) mfj36325 ( 771) 467 95 3.9e-20 mKIAA0204 ( 1307 res) mbg01039 (1307) 465 95 7.1e-20 mKIAA0834 ( 453 res) mpg00938 ( 453) 452 92 1.8e-19 mKIAA4026 ( 986 res) mbg12171 ( 986) 452 93 3e-19 mKIAA0968 ( 487 res) mbg13747 ( 487) 443 91 5.8e-19 mKIAA4163 ( 536 res) mfj30170 ( 536) 433 89 2.2e-18 mKIAA1142 ( 597 res) mph00410 ( 597) 422 87 9.2e-18 mKIAA4256 ( 705 res) mfj04284 ( 705) 421 87 1.2e-17 mKIAA0096 ( 750 res) mbh04151 ( 750) 409 85 5.4e-17 mKIAA0369 ( 791 res) mbg01404 ( 791) 409 85 5.6e-17 mKIAA0537 ( 575 res) mfj00259 ( 575) 405 84 7.5e-17 mKIAA0881 ( 1070 res) mpm03231 (1070) 403 84 1.4e-16 mKIAA0175 ( 648 res) mpj02836 ( 648) 399 83 1.7e-16 mKIAA1995 ( 1005 res) meh01075 (1005) 388 81 8.9e-16 mKIAA1297 ( 1171 res) mbh00665 (1171) 376 79 4.4e-15 mKIAA0623 ( 1056 res) mbg01004 (1056) 375 79 4.7e-15 mKIAA4165 ( 674 res) mfj42151 ( 674) 370 78 6.5e-15 mKIAA4182 ( 225 res) mfj42218 ( 225) 354 74 2.4e-14 mKIAA1860 ( 634 res) mid04050 ( 634) 352 75 5.9e-14 mKIAA0722 ( 1004 res) mbg09316 (1004) 354 75 6.2e-14 mKIAA0135 ( 1389 res) mpm10011 (1389) 349 75 1.4e-13 mKIAA0213 ( 1502 res) mbg05341 (1502) 346 74 2.2e-13 mFLJ00263 ( 695 res) mnh05102 ( 695) 339 72 3.2e-13 mKIAA0787 ( 419 res) mbg06488 ( 419) 326 70 1.2e-12 mKIAA0344 ( 800 res) mpg00583 ( 800) 318 69 4.8e-12 mKIAA4107 ( 1176 res) mfj68342 (1176) 311 68 1.5e-11 mKIAA4203 ( 1062 res) mfj16282 (1062) 304 66 3.3e-11 mKIAA1459 ( 855 res) mfj58296 ( 855) 300 65 4.7e-11 mKIAA0904 ( 1051 res) mpg00351 (1051) 282 62 5.1e-10 mKIAA1791 ( 1452 res) mpm08259 (1452) 278 62 1e-09 mKIAA3023 ( 1305 res) mpm03294 (1305) 270 60 2.6e-09 mKIAA0687 ( 1310 res) mpg00180 (1310) 257 58 1.3e-08 mKIAA1028 ( 546 res) mbg03568 ( 546) 248 56 2.3e-08 mKIAA0472 ( 658 res) mbh01581 ( 658) 241 55 6.3e-08 mKIAA1790 ( 1898 res) mpf00986 (1898) 225 52 9.2e-07 mFLJ00113 ( 442 res) mtj02051 ( 442) 209 49 2.6e-06 mKIAA1101 ( 592 res) mpg00309 ( 592) 189 45 3.9e-05 mKIAA0807 ( 1432 res) mbg07407 (1432) 184 45 0.00013 mKIAA1804 ( 807 res) meh03138 ( 807) 177 43 0.00021 mKIAA4080 ( 1323 res) mfj01350 (1323) 175 43 0.00037 mKIAA0973 ( 1202 res) mbg08419 (1202) 174 43 0.0004 mKIAA0936 ( 503 res) mic27001 ( 503) 154 39 0.0027 mKIAA0847 ( 1247 res) mia12084 (1247) 157 40 0.0034 mKIAA1369 ( 635 res) mid17020 ( 635) 153 39 0.0036 >>mKIAA1901 ( 1234 res) mpg03874 (1234 aa) initn: 535 init1: 330 opt: 510 Z-score: 493.3 bits: 103.4 E(): 2.5e-22 Smith-Waterman score: 510; 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