FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4063.ptfa, 968 aa vs ./tmplib.26680 library 1768049 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7278+/-0.00589; mu= 10.7764+/- 0.394 mean_var=178.6228+/-41.401, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0960 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0384 ( 945 res) mbg07202 ( 945) 2229 321 3.6e-88 >>mKIAA0384 ( 945 res) mbg07202 (945 aa) initn: 2400 init1: 1178 opt: 2229 Z-score: 1675.2 bits: 321.4 E(): 3.6e-88 Smith-Waterman score: 2635; 48.247% identity (53.670% ungapped) in 970 aa overlap (7-936:29-940) 10 20 30 mKIAA4 AAGTLVMEDCNVHSAASILASVKEQEARFERLTRALEQ :.: .:.:.::::::::::::.::.::::::. mKIAA0 GDLLPPFYSLCGPPYFLSCPAAAPPLTFMDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEE 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 mKIAA4 ERRHVALQLERAQ-QPG-----MSSGGMVGSGQ------PLPMAWQQLV-LQEQSPGSQA :::::. ::::.. .: :..: .. : . :.. :. ..: .. mKIAA0 ERRHVSAQLERVRVSPQDANSLMANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHN 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 mKIAA4 SL--ATMP--EAPEVLEETVTVEEDPGTPTSHVSIVTSEDGTTRRTETKVTKTVKTVTTR : .:.: . : . :: : :::: : ::. :..::::::::: : :.:::.::: mKIAA0 HLLYSTIPRMQEPGQIVETYT-EEDPEGAMSVVSVETTDDGTTRRTETTVKKVVKTMTTR 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 mKIAA4 TVRQVPLGPDGLPLLDGGPPLGSFADGPLDRHYLLRGGGGPA--------ATLSRTYHSS ::. ::.::::::. :.. ... . : : . :.:::. ::: :..: mKIAA0 TVQPVPMGPDGLPV-DASAVSNNYIQ-TLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYP 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 mKIAA4 GGGF----PDG-PESRDIPSYGSLSRGLGV----RPPRTGLLGPGPGDGCFTLPGRREAF :. :: : . : .:::::: . :: : .:. : : : mKIAA0 PDGYGRHYEDGYPGGSD--NYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR--- 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 PMGSESGPPSGRSLPEH-FQAEPYGLEDDTRSLAADD-EGGPDLEPDYSTATRR-RPEYG .: : :. : :. :::::::: ::.. :: . : . ::.:: : : mKIAA0 -VG-------GSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYG--MMSDYGTARRTGTPSDP 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 RGLRARAFEDTADDAGELIEERPPFPAATAPLAQPERGSLGSLDRVVRRSPSVDSTRKEP : : :..:: :: :: ::::: :::::.::: . . : .. mKIAA0 RR-RLRSYEDMIG------EEVPPDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGMPPPSN----- 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 mKIAA4 RWRDPELPEVLAMLRHPVDPVKANAAAYLQHLCFENEGIKRRVRQLRGLPLLVALLDHPR ::.::::::.::: .: ::.::::::::::..:. .: ::.:.:.:.::.:::::. mKIAA0 -WRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPILVGLLDHPK 400 410 420 430 440 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 AEVRRRACGALRNLSYGRDTDNKAAIRDCGGVPALVRLLRAARDNEVRELVTGTLWNLSS ::. :::::.:.:.::: ::: ::..: :::::::::: ::: .. :..::::::::: mKIAA0 KEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSS 450 460 470 480 490 500 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 YEPLKMVIIDHGLQTLTHEVIVPHSGWEREPNEDSKPRDAEWTTVFKNTSGCLRNVSSDG .. .:: :.::.:..:: :::.:::::::::::: ::: :: .:. ::.::::::::. mKIAA0 HDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSER 510 520 530 540 550 560 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 AEARRRLRECEGLVDALLHALQSAVGRKDTDNKSVENCVCIMRNLSYHVHKEVPGADRYQ .::::.::::.::::::. .:. .:.::.:.: ::::::..:::::.::.:.: :.::: mKIAA0 SEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQ 570 580 590 600 610 620 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 EAEPGIPGSTTSQRRRKDDASCFGGKKAKEEWFHQGKKDAEMDRNFDTLDLPKRTEAAKG :: : . .:: . :::::.::.:.::: .::: .: : ::.:.:::: :.: mKIAA0 EALPTVANSTGPHA-----ASCFGAKKGKDEWFSRGKKPTEDPAN-DTVDFPKRTSPARG 630 640 650 660 670 680 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 FELLYQPEVVRLYLSLLTESRNFNTLEAAAGALQNLSAGNWTWATYIRATVRKERGLPVL .:::.::::::.:.::: ::.. :::.:::.::: :: ::.. :::...:.:..: .. mKIAA0 YELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAI 690 700 710 720 730 740 730 740 750 760 770 780 mKIAA4 VELLQSETDKVVRAVAIALRNLSLDQRNKDLIGSYAMTELVRNVRNAQAPAHPSAHLEED .::: :: ..::.:.. :::::..: :::.:::..:. .::.:. ..: . : .. :: mKIAA0 AELLTSEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQ--NSSWNFSED 750 760 770 780 790 800 790 800 810 820 830 840 mKIAA4 TVVAVLNTIHEIVSDSLDNARSLLQARGVPALVALVAS-SQSVREAKAASHVLQTVWSYK :::..::::.:.....:. :..: ...:. :: . : ..: .:..::. ::::.:.:: mKIAA0 TVVSILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYK 810 820 830 840 850 860 850 860 870 880 890 900 mKIAA4 ELRGALQRDGWTKSRFQSASTAKGPKGTPSSGGFDDSTLPLVDKSLDGEKSNTRDVIPMD ::: :...:: :: :: . .. . . :: ..:::::::.:.. .::. mKIAA0 ELRKPLEKEGWKKSDFQV--NLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRN---QKSD-------- 870 880 890 900 910 920 930 940 950 mKIAA4 TLGPDGYATVDRR--ERRTLGSDSTGDTSEKELLRPDPGRKAPPPGPSRPSVRLVDAVGD ..:.:...: . ::: : .:: .. : :. : mKIAA0 ----NNYSTLNERGDHNRTL--DRSGDLGDMEPLKGAPLMQKI 910 920 930 940 960 mKIAA4 TKPQPVDSWV 968 residues in 1 query sequences 1768049 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:00:46 2006 done: Mon Mar 27 11:00:48 2006 Scan time: 1.010 Display time: 0.090 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]