FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4134.ptfa, 1021 aa vs ./tmplib.26680 library 1767996 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4229+/-0.00456; mu= 8.7079+/- 0.304 mean_var=123.5204+/-28.011, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1154 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0911 ( 1035 res) mbg12625 (1035) 2245 386 1.7e-107 mKIAA0726 ( 959 res) mbh00847 ( 959) 1720 298 3.4e-81 mKIAA0811 ( 1654 res) mbg07446 (1654) 175 41 0.0014 mKIAA1400 ( 1098 res) mbh01141 (1098) 166 40 0.0029 mKIAA1621 ( 810 res) mbg08078 ( 810) 158 38 0.0057 >>mKIAA0911 ( 1035 res) mbg12625 (1035 aa) initn: 3441 init1: 2053 opt: 2245 Z-score: 2022.0 bits: 385.7 E(): 1.7e-107 Smith-Waterman score: 3628; 51.923% identity (54.990% ungapped) in 1040 aa overlap (3-1010:19-1032) 10 20 30 40 mKIAA4 VRAAAAAPEAHPAAPGRRRGRHRRTPADASGHRQARPARAVGGG :: : .: :: . : :: :. : 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:.:::.:.:.:. .: : ::: :::.. :.::.:. :.:::.:..:..::: ::: :. mKIAA0 NHALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQPDAPQILLS 590 600 610 620 630 640 700 710 720 730 740 750 mKIAA4 GTERFWRPAAQFESARGVTLFPDIKIVSTFA-KTEASGDMRATGTAPKSAVLEEMLHNLD :: .: :::..::. .:: ::::..:. ... ..::..: ::. . . .:..:::: mKIAA0 GTAHFARPAVDFEGPEGVPLFPDLQITCSISHQVEAKADESWQGTVTDTRMSDEIVHNLD 650 660 670 680 690 700 760 770 780 790 800 810 mKIAA4 FCDILVLGGDLDPRQECLELNHSELHQRHLDATNSTAGYSIYGVGSMNRYEQVLHHLRYR :.: ..: ::::..: : :. . :.:: :. ::..: .: :: ... ::..:.. ::. mKIAA0 GCEISLVGDDLDPERESLLLDMASLQQRGLELTNTSAYLTIAGVETITVYEEILRQARYQ 710 720 730 740 750 760 820 830 840 850 860 870 mKIAA4 NWHPTSLETRRFRIKCSELNGRYTSNEFNLEVSVLHEV-RVSDKEHVNHLIVQPPFLQSV : ..: .:.::..:::.::::.:::: .::.::: . ::. : .:.. . ::. mKIAA0 LRHGAALYARKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVA---HPSHVLSSQQFLHRG 770 780 790 800 810 820 880 890 900 910 920 mKIAA4 HHP------ETRSSIQRSSVVPSIATVVIIISVCMLVFVVAMGVYRVRIAHQHFIQE--- :.: .. .: .:.:.::: ::..:.. : .::..: .:. :.. :.. mKIAA0 HQPPPEMAGHSLASSHRNSMVPSAATLIIVVCVGFLVLMVILGLVRIHSLHRRVSGTGGP 830 840 850 860 870 880 930 940 950 960 970 980 mKIAA4 ---TEAAKEAEMDWDDSALTITVNPMEKHEGPGNGEDETTEVEEEEEAEEGSSSSSSGSD . :. .. :::::::: :::::... : . .. : .. :: ::.: .... mKIAA0 SGASTDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQ---NQQTCVAGVAGGQQEEEDSSDSEAADS 890 900 910 920 930 940 990 1000 1010 1020 mKIAA4 DSEEEEEEGMGRVRHGQSGTSSQSPERSTWNTAGVINIWK : .:. mKIAA0 PSSDERRIIESPPHRY 950 >>mKIAA0811 ( 1654 res) mbg07446 (1654 aa) initn: 116 init1: 87 opt: 175 Z-score: 156.8 bits: 41.3 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 205; 24.752% identity (27.574% ungapped) in 303 aa overlap (91-388:616-892) 70 80 90 100 110 mKIAA4 LCLVPLLLALGVGSGGGSGDGGDSRRRRLLVAKVNKHKPWIETSYHGV-ITENNDTVILD :. ::.:.: . . . : . :: ... : mKIAA0 FETNPKYFLSIECSRKSSSSLSDVTTIVINVTDVNEHHPRFTHDLYTVRVLEN--AIVGD 590 600 610 620 630 640 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 PPLVALDKDAPVPFAGEICAFKIHGQELPFEAVVLNKTSGEGRLRAKSPIDCELQKEYTF :.. .: : . : . :..: .. .: :.:.. . .: : :.. mKIAA0 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