FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4074.ptfa, 1099 aa vs ./tmplib.26680 library 1767918 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9346+/-0.00737; mu= -5.8766+/- 0.486 mean_var=306.6980+/-74.194, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0732 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0440 ( 1510 res) mbg05561 (1510) 1589 182 4.7e-46 mKIAA1389 ( 1185 res) mbh01631 (1185) 1312 153 2.5e-37 mKIAA0474 ( 726 res) mbe00481 ( 726) 632 81 7.6e-16 mKIAA0545 ( 886 res) mpm03375 ( 886) 326 49 4.7e-06 mKIAA1272 ( 467 res) mic25008 ( 467) 217 37 0.0087 >>mKIAA0440 ( 1510 res) mbg05561 (1510 aa) initn: 2025 init1: 1042 opt: 1589 Z-score: 919.2 bits: 182.3 E(): 4.7e-46 Smith-Waterman score: 2131; 43.122% identity (48.886% ungapped) in 916 aa overlap (157-987:41-933) 130 140 150 160 170 180 mKIAA4 PRARAHSHEDASRPAATPTRLFTDPLALLGLPAEEPEPTFPPVLEPRWFAHYDVQSLLFD : .. : . : :. ::::::::.::: mKIAA0 KRRSKSETGDSSIFRKLRNAKGEELGKSSDLEDNRSEDSVRPWTCPKCFAHYDVQSILFD 20 30 40 50 60 70 190 200 mKIAA4 WAP-----------RPRGTG--------------SHTEA-----------NS-GTLA--E : :: ::. . :: :.:. . mKIAA0 LNEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLGMDQ 80 90 100 110 120 130 210 220 230 240 250 mKIAA4 GQTTTSDLLLGAPGFVSELGGEGEL----------GLGGPISPPVPPALP----NAAVSV :. ...:... : : .:.::::: ...: : :: ::.:.: mKIAA0 GDDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESTSFESALSSHCTNAGVAV 140 150 160 170 180 190 260 270 280 290 300 mKIAA4 LEEPQT-------RTTAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGLDEALGPVAVSLRREE :: :. :. :..::.:::: ::::.:: ::: :.:: :: :::::::.:::. mKIAA0 LEVPKESLMLHLDRVKRYTVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREK 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 KEG-SGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSPRKLLEHVAPRLS : . .:. ..::.: ::..: ::::.. :::.: . ::: ...:::: :.:. mKIAA0 PEDMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVIPELN 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 mKIAA4 PTCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGAAFMQFL ::::. .::: . :. :::: :..:.::::.::.:::..:::::::. :: :: .:: mKIAA0 VQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFL 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 TLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLR :::. :::::::.:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::.::::: mKIAA0 QLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLR 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 KRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHAPCTPHTSYRVAVSRTQDTP :::::::::::::::::..:: : .:::::::::..:::: ::: . : :::.:..:.: mKIAA0 KRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRAHNPCTESVCYSVAVTRSRDVP 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 AFGPALPEGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEV .::: .:.: : . :: :::::..:.:.:: ....:.::::::::.::.::: ..: mKIAA0 SFGPPIPKGV-TFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAEKNV 500 510 520 530 540 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 TTTSLDSASRFGLPSLGGRRRATPRS-PGAELQAAGALMWGVRAAPGARVAAGAETSGPD :.: .: ...: . ::..... . :::::.. ::..:.::: .. mKIAA0 TNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAVRAKDYNKAM--------- 550 560 570 580 590 600 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 DAEVPCLLGISAETLVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEHQLDLYHGRGEAITLRLDG : ::::::.: .::. . :.:::.::::..:: :. .: ... ::: .... . mKIAA0 --EFDCLLGISSEFIVLIEQETKSVAFNCSCRDVIGWTSSDTSLKIFYERGECVSVE-SF 610 620 630 640 650 730 740 750 760 770 780 mKIAA4 APGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFITHVERFTFAETTGLR :. . :.: :::.::.:::. :..: :.: :.:::.:. ::... :: . .: .::: mKIAA0 ISGEDIKEIVRRLQFVSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVNYEGIVADVEPYGYAWQAGLR 660 670 680 690 700 710 790 800 810 820 830 840 mKIAA4 PGARLLRVCGQTLPKLGPETAAQMLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYMLSLKEPS :.::...: .. :. : ..::.. : :...:: .. :::: :: : . . : . mKIAA0 QGSRLVEICKVAVATLSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHDDCTPRRSCSETYRMPVMEYQ 720 730 740 750 760 770 850 860 870 880 mKIAA4 RRGG-------P----EPVQDETGKLVILPPTKQLLHFCLKDSSSPPGPGDLTEERTEFL : : . : ...: . : . . :. . : : :: : mKIAA0 MNEGISYEFKFPFRNNNKWQRNASKGAHSPQVPSQLQSPMT-SRLNAGKGDGKMPPPE-- 780 790 800 810 820 830 890 900 910 920 930 940 mKIAA4 RSHNSLSSGSSLSDEAPVLPNTTP--DLLLVTTANPSAPGTDRETPPSQDQSGSPSSHED :. : : :: : :. .: :. ..... : . :..: . ..:. .: mKIAA0 RAANIPRSISS--DGRPLERRLSPGSDIYVTVSSMALARSQCRNSPSNLSSSSETGSGGG 840 850 860 870 880 890 950 960 970 980 990 1000 mKIAA4 T--SDSGPE----LRASILPRTLSLRNSISKIMSEAGSETLEDEWQSISEIASTCNTILE : . : :: : : : ... .:. : : .:: :: mKIAA0 TYRQKSMPEGFGVSRRS--PASIDRQNTQSDI---SGSGKSTPSWQRSEDSLADQMEPTC 900 910 920 930 940 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA4 SLSREGQPISESGDPKEALKCDSEPEPGSLSEKVSHLESMLWKLQEDLQREKADRAALEE mKIAA0 HLPAVSKVLPAFRESPSGRLMRQDPVVHLSPNKQGHSDSHYSSHSSSNTLSSNASSAHSD 950 960 970 980 990 1000 >>mKIAA1389 ( 1185 res) mbh01631 (1185 aa) initn: 1883 init1: 1004 opt: 1312 Z-score: 762.4 bits: 153.0 E(): 2.5e-37 Smith-Waterman score: 1774; 46.761% identity (49.333% ungapped) in 633 aa overlap (324-943:1-613) 300 310 320 330 340 mKIAA4 ALGPVAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSP :..: ::::.: :::.: : ::: mKIAA1 TSELTTLRGAILEDAVPSTARHGTARGLPL 10 20 30 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 RKLLEHVAPRLSPTCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYN ...::.: :.:: ::: .. :::::. :: :::: ::::.:.:::::::::..:::::: mKIAA1 KEVLEYVIPELSIQCLRQAANSPKVPEQLLKLDEQGLSFQHKIGILYCRAGQSTEEEMYN 40 50 60 70 80 90 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 NQEAGAAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTML :. :: :: .:: :::. :::::: .::::::.::::::::::::::.: :.::::::.: mKIAA1 NETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTGTHSLYTTYKDFELMFHVSTLL 100 110 120 130 140 150 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 PYTPNNQQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHAPCTPHTS :: :::.::::::::::::::::::::::. :: : .:::::::::..:..: ::: .. mKIAA1 PYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKNIRSHFQHVFVIVKVHNPCTENVC 160 170 180 190 200 210 530 540 550 560 570 580 mKIAA4 YRVAVSRTQDTPAFGPALPEGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTR : :.:::..:.: ::: .:.: : .: :: :::::..:.:.:: ....:.::::::: mKIAA1 YSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGV-TFPKSAVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTR 220 230 240 250 260 590 600 610 620 630 640 mKIAA4 QQYLQDLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRR--RATPRSPGAELQAAGALMWGVRAAPG :.::.::: : :::...:....:.. .::... :. ::. :.: . ::.:: : : mKIAA1 QEYLKDLAENFVTTATVDTSAKFSFITLGAKKKERVKPRKD-AHLFSIGAIMWHVVARDF 270 280 290 300 310 320 650 660 670 680 690 700 mKIAA4 ARVAAGAETSGPDDAEVPCLLGISAETLVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEHQLDLY .. .:.. :::::: : ..:. . :::::.::::..:: . .. . mKIAA1 GQ-----------SADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTSGLVSIKAF 330 340 350 360 370 710 720 730 740 750 760 mKIAA4 HGRGEAITLRLDGAPGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFITH . ::: . : .. . :.: :: .:.::::: :..: :.: :.:::.:. ::... mKIAA1 YERGECLLLSSVDNRSEDIREIVQRLLIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVAD 380 390 400 410 420 430 770 780 790 800 810 820 mKIAA4 VERFTFAETTGLRPGARLLRVCGQTLPKLGPETAAQMLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRS :: : :: .::: :.::...: .. : : ..::.. : :... : :.: :::. mKIAA1 VEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVATLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHEDGSPRRG 440 450 460 470 480 490 830 840 850 860 870 880 mKIAA4 FSELYMLSLKEP--SRRGGP----EPVQDETGKLVILPPTKQLLHFCLKDSSSP-PGPGD ::: . . : . .: : : . .: . :. : . . .:: :: : mKIAA1 CSELCRIPMVEYKLDSEGTPCEYKTPFRRNTTWHRVPTPALQPV-----SRASPVPGTPD 500 510 520 530 540 550 890 900 910 920 930 940 mKIAA4 LTEERTEFLRSHNSLSSGSSLSDEAPVLPNTTPDLLLVTTANPSAPGTDRETPPSQDQSG . . . ... .. ..:.. . : ..:. ....:. :: . :. .: mKIAA1 RLQCQPLLQQAQAAIPRSTSFDRKLPDGTRSSPSNQ-SSSSDPG-PGGSGPWRPQVGYDG 560 570 580 590 600 610 950 960 970 980 990 1000 mKIAA4 SPSSHEDTSDSGPELRASILPRTLSLRNSISKIMSEAGSETLEDEWQSISEIASTCNTIL :: mKIAA1 CPSPLLLEHQGPGSVECDGTGEQEDLLEGGRLPETKWHGPPSKVLSSYKERVLQKDGSCK 620 630 640 650 660 670 >>mKIAA0474 ( 726 res) mbe00481 (726 aa) initn: 755 init1: 430 opt: 632 Z-score: 376.9 bits: 80.9 E(): 7.6e-16 Smith-Waterman score: 733; 38.606% identity (41.143% ungapped) in 373 aa overlap (248-616:123-476) 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 GAPGFVSELGGEGELGLGGPISPPVPPALPNAAVSVLEE--P-QTRTTAYSLEHADLGAG : .: : : : :. :: .:: . : mKIAA0 YPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTNHEISSLPETEPLQSPTTKVKLE-CNPTAR 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 YYRKYFYGKEHQNFFGLDEALGPVAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTI :::.: :::: :...:: ::: .. ::. . : . :...:: . :: . .: mKIAA0 IYRKHFLGKEHFNYYSLDTALGHLVFSLKYDVI-----GDQEHLRLLLRT-KCRTHHDVI 160 170 180 190 200 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 SEDALPPGPPRGLSPRKLLEHV-APRLSPTCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVG . : : . . : : . :. :. ::. : ..:.::.:.: . : : mKIAA0 PISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLY------PKASRLIVTFDEHVISNNFKFG 210 220 230 240 250 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 ILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGAAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLY ..: . :: ::::.....: . ::..:: .::. :.:. :...:. ::. .:::.:.: mKIAA0 VIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVY 260 270 280 290 300 310 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 TTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQH .....:::::::: :::: .. ::: ::::::::::..:::. .. :: : : :.: : mKIAA0 CNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENT-PFVPDMIASNFLH 320 330 340 350 360 370 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 VFLVVRAHAPCTPHTSYRVAVSRTQDTPAFGPALPEGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQ ...::.:.. :.:.:. .:.: ::: ::. . : . .:. :::.: .:.: mKIAA0 AYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPA-VFRKGPEFQEFLLTKLINAEY 380 390 400 410 420 430 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 AAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRATPRSPGAELQ : .:..: . ::: :. : . . : : .:: : mKIAA0 ACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEE----LHIHSQSMMGLGSDDDKMENGSGGGGFFES 440 450 460 470 480 490 640 650 660 670 680 690 mKIAA4 AAGALMWGVRAAPGARVAAGAETSGPDDAEVPCLLGISAETLVLVAPRDGRVVFNCACRD mKIAA0 FKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFTPNNPDLAKAAGISLIVPGKSPTRKKS 500 510 520 530 540 550 >>mKIAA0545 ( 886 res) mpm03375 (886 aa) initn: 545 init1: 325 opt: 326 Z-score: 201.0 bits: 48.7 E(): 4.7e-06 Smith-Waterman score: 334; 27.612% identity (29.482% ungapped) in 268 aa overlap (697-962:37-289) 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 LLGISAETLVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEHQLDLYHGRGEAITLRLDGAPGQAV :: . . ...:::. : :. . . . mKIAA0 RIQHGWEDVSTTHSPWPAASALSAPLSHRIWTPDSSTIKIFYGRGDHIFLQAAEGSVEDI 10 20 30 40 50 60 730 740 750 760 770 780 mKIAA4 GEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFITHVERFTFAETTGLRPGARLL ..: ::.... : :: ...: :.: :.:::.: .: ...:: . :: .::: :.::. mKIAA0 RDIVQRLKVMTNGWETVDMTLRRNGLGQLGFHVKYDGTVAEVEDYGFAWQAGLRQGSRLV 70 80 90 100 110 120 790 800 810 820 830 840 mKIAA4 RVCGQTLPKLGPETAAQMLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYMLSLKEPSRRGGPE ..: .. :. . ..::.. : :...:: :.: :::.. : : .. .::. mKIAA0 EICKVAVVTLSHDQMIDLLRTSVTVKVVIIPPFEDGTPRRGWPETYDMNASEPK------ 130 140 150 160 170 180 850 860 870 880 890 900 mKIAA4 PVQDETGKLVILPPTKQLLHFCLKDSSSPPGPGDLTEERTEFLRSHNSLSSGSSLSDEAP ...:: :: .. . . :.: . ..: . . . .: : : ..: mKIAA0 -TESETTTPGGRPPYRSNAPW---QWSGPASHNSLPATKWTTPATPGHAQSLSRLPKQTP 190 200 210 220 230 910 920 930 940 950 960 mKIAA4 VLP--NTTPDLLLVTTANPSAPGTDRETPPSQDQSGSPSSHEDTSDSGPELRASILPRTL :.: .. : : . .:: : ..: :. :.:..: . : . : mKIAA0 VVPFRESQP---LHSKRYAAAPHPLLSFDPHFMHDGMSSG--DSSSGGLTSQESTMERPK 240 250 260 270 280 290 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA4 SLRNSISKIMSEAGSETLEDEWQSISEIASTCNTILESLSREGQPISESGDPKEALKCDS mKIAA0 PEPLWHVPAQARLSAMTGSIGSKHPSRQDAAGKDSPNRHSKGEPQYSSHSSSNTLSSNAS 300 310 320 330 340 350 >>mKIAA1272 ( 467 res) mic25008 (467 aa) initn: 158 init1: 68 opt: 217 Z-score: 142.4 bits: 36.9 E(): 0.0087 Smith-Waterman score: 230; 25.342% identity (27.206% ungapped) in 292 aa overlap (333-616:179-458) 310 320 330 340 350 mKIAA4 RREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALP-PGPPRG--LSPRKLLEHVAPR :.. .. : : ::: : ::. .. mKIAA1 DQEKAIMEVILRQSAQEDEYVQRCNSDSSVTVTSQGQPSPVEPRGPFYFCRLLLDDLGMN 150 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 L--SPTCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGAAF ..: . . :. : : .:: . .:....: :: .. . :.... :. mKIAA1 SWDRRKNFHLLKKNSKLLRELKNLDSRQCRETHKIAVFYIAEGQEDKCSILANERGSQAY 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 MQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQ .:.. :: : :. .. . :. .. ::: . : . . :..::::: .: . ... mKIAA1 EDFVAGLGWEVDLSTHCGFMGGLQ-RNGSTGQTAPYYATSTVEVIFHVSTRMPSVSDDS- 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 QLLRK-RHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHAPCTPHTSYRVAVSR : .: ::.::: : ::..: :. . : . : : ... : : . ..... mKIAA1 -LTKKLRHLGNDEVHIVWSEH-SRDYRRGIIPTAFGDVSIIIY---PMKNHMFF-ITITK 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 TQDTPAFGPALPEGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDL ..: ::: . : .... . ... : .:. .:. .. . : ::. . mKIAA1 KPEVPFFGPLFD---GAIVSGKLLPSLICATCINASRAVKCLIPLYQSFYEERALYLEAI 390 400 410 420 430 600 610 620 630 640 650 mKIAA4 ATN--EVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRATPRSPGAELQAAGALMWGVRAAPGARVAAGA : :: : : :.. :: mKIAA1 IQNHREVMTFE-DFAAQVFSPSPSYSVSGTD 440 450 460 1099 residues in 1 query sequences 1767918 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:01:03 2006 done: Mon Mar 27 11:01:05 2006 Scan time: 1.060 Display time: 0.280 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]