# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj11296.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1074.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1074, 1043 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7893986 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4453+/-0.000208; mu= 7.8050+/- 0.011 mean_var=153.6828+/-30.076, 0's: 39 Z-trim: 163 B-trim: 67 in 1/66 Lambda= 0.103457 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|109940218|sp|Q811D2.2|ANR26_MOUSE RecName: Full (1581) 6638 1004.0 0 gi|124487433|ref|NP_001074581.1| ankyrin repeat do (1681) 2717 418.8 1.2e-113 gi|148667184|gb|EDK99600.1| mCG133435 [Mus musculu (1561) 2527 390.4 3.9e-105 gi|109472548|ref|XP_232319.4| PREDICTED: similar t (1666) 2273 352.5 1e-93 gi|109474114|ref|XP_001057458.1| PREDICTED: simila (1666) 2243 348.0 2.3e-92 gi|194227095|ref|XP_001495399.2| PREDICTED: ankyri (1733) 1902 297.2 5e-77 gi|118082262|ref|XP_416008.2| 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[Homo ( 992) 859 141.2 2.5e-30 gi|166898074|sp|Q8IVF6.3|AN18A_HUMAN RecName: Full ( 992) 855 140.6 3.8e-30 gi|114624668|ref|XP_520430.2| PREDICTED: ankyrin r (1191) 853 140.4 5.3e-30 gi|119578651|gb|EAW58247.1| hCG2010820, isoform CR (1084) 849 139.8 7.5e-30 gi|169179792|ref|XP_001717672.1| PREDICTED: simila (1087) 849 139.8 7.5e-30 >>gi|109940218|sp|Q811D2.2|ANR26_MOUSE RecName: Full=Ank (1581 aa) initn: 6638 init1: 6638 opt: 6638 Z-score: 5360.0 bits: 1004.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6638; 100.000% identity (100.000% similar) in 1043 aa overlap (1-1043:539-1581) 10 20 30 mKIAA1 AEPSGNLYSGAADGGADVKPQSGDTENQQS :::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 SVSREEQTRLSGSEDSQQKVEEKRKYKNNEAEPSGNLYSGAADGGADVKPQSGDTENQQS 510 520 530 540 550 560 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 PREGSEGRGSGPALLMKEAKKMENEKWVSREPARTAMSERTGLPTGGWPQMQDGSCWSDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 PREGSEGRGSGPALLMKEAKKMENEKWVSREPARTAMSERTGLPTGGWPQMQDGSCWSDT 570 580 590 600 610 620 100 110 120 130 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ankyrin repeat domain (1681 aa) initn: 4918 init1: 2572 opt: 2717 Z-score: 2196.8 bits: 418.8 E(): 1.2e-113 Smith-Waterman score: 6407; 91.156% identity (91.243% similar) in 1142 aa overlap (1-1043:539-1680) 10 20 30 mKIAA1 AEPSGNLYSGAADGGADVKPQSGDTENQQS :::::::::::::::::::::::::::::: gi|124 SVSREEQTRLSGSEDSQQKVEEKRKYKNNEAEPSGNLYSGAADGGADVKPQSGDTENQQS 510 520 530 540 550 560 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 PREGSEGRGSGPALLMKEAKKMENEKWVSREPARTAMSERTGLPTGGWPQMQDGSCWSDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|124 PREGSEGRGSGPALLMKEAKKMENEKWVSREPARTAMSERTGLPTGGWPQMQDGSCWSDT 570 580 590 600 610 620 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 DQSEARPTKKTSSKHNKDSGQTAAVDNLDDFTESSETASEDHELQGPDSESILCAIEHLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|124 DQSEARPTKKTSSKHNKDSGQTAAVDNLDDFTESSETASEDHELQGPDSESILCAIEHLR 630 640 650 660 670 680 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 LECKDTASLLKIRDAVYSYKRLIELKRSHCELLTGKLKRMENKYKGLQKEMSETEEVKSR 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:.:...::.: . : : .: gi|114 ASEEEQEREGSENNQPQVEEERKKHRNNEMEVSANIHDGATDDAEDDDDHDDGLIRKRKS 530 540 550 560 570 580 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 GDTENQQSPR-EGSEGRGSGPALLMKEAKKMENEKWVSREPARTAMSERTGLPTGGWPQM :.:. :: :: :..: .::::: :::.:. :.:: .:.: . . . ...: ::: :. gi|114 GETDRQQFPRKENKEYASSGPALQMKEVKRTEKEKRTSKESVNSPVFGKASLLTGGLLQV 590 600 610 620 630 640 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 QDGSCWSDTDQSEARPTKKTSSKHNKDSGQTAAVDNLDDFTESSETASEDHELQGPDSES .: : :.::..:.:::::: ...:: ..: ..:..::.:.:::::::: :: . .. gi|114 DDDSSLSETDEDEGRPTKKTFNEKNKVKNQIQSMDDVDDLTQSSETASEDCELPHSSYKN 650 660 670 680 690 700 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 ILCAIEHLRLECKDTASLLKIRDAVYSYKRLIELKRSHCELLTGKLKRMENKYKGLQKEM .. ::.: .::::..:::::.::. : .::.:::..:::::: :.:.::.: . ::.:. gi|114 FMLLIEQLGMECKDSVSLLKIQDAALSCERLLELKKNHCELLTVKIKKMEDKVNVLQREL 710 720 730 740 750 760 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 SETEEVKSRLEHEKVGWEQELCRLRFALKQEEEKRRSADQLSEKTMEQLRRKGEQCQSEV :::.:.::.:::.:: ::.::: :::.:.:::::::.::.: :: :::::: :: ..:: gi|114 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