FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4112.ptfa, 1261 aa vs ./tmplib.26680 library 1767756 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9416+/-0.00641; mu= 11.9613+/- 0.422 mean_var=366.5178+/-87.238, 0's: 0 Z-trim: 31 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0670 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0897 ( 1140 res) meh02302 (1140) 1368 148 1.1e-35 mKIAA1026 ( 808 res) mfj07295 ( 808) 435 57 1.3e-08 mKIAA1230 ( 990 res) mfj00035 ( 990) 382 52 5.2e-07 mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048) 291 44 0.00032 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 289 44 0.00035 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 270 42 0.0012 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 262 41 0.0018 mKIAA0445 ( 1598 res) mbg06476 (1598) 260 41 0.0023 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 241 39 0.0075 >>mKIAA0897 ( 1140 res) meh02302 (1140 aa) initn: 4258 init1: 1207 opt: 1368 Z-score: 732.8 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.::.:.::..:.. : :.:::.:. .:::::....:. .:. mKIAA1 REALQERRARCETQNTDPVVWTNQRVLKWVRDIDLKEYADNLTNSGVHGAVLVLEPTFNA 630 640 650 660 670 680 1160 1170 1180 1190 1200 1210 mKIAA4 SSLALLLQIPTQNTQARQILEREYNNLLALGTERRLDESDDKNFRRGSTWRRQFPPREVH ..: : ::. . :. : .:..... .. . ::. mKIAA1 EAMATALGIPSGKHILRRHLAEEMSTIFHPSNSTGIRESERFGTPPGRASSITRAGREDS 690 700 710 720 730 740 1220 1230 1240 1250 1260 mKIAA4 GISMMPGSSETLPAGFRLTTTSGQSRKMTTDVASSRLQRLDNSTVRTYSC mKIAA1 GGNSKHRAGRLPLGKIGRGFSSKEPDFHDDYGSLENEDCGDEDLQGRPEQCRLEGYGSLE 750 760 770 780 790 800 >>mKIAA1230 ( 990 res) mfj00035 (990 aa) initn: 473 init1: 251 opt: 382 Z-score: 218.3 bits: 52.2 E(): 5.2e-07 Smith-Waterman score: 609; 24.648% identity (29.805% ungapped) in 994 aa overlap (232-1191:9-864) 210 220 230 240 250 mKIAA4 SLERVSALEEELAAANQEIVALREQNVHIQRKMVSSEG---STESEHLEGMEAGQKVHEK .::.:. . .. :...:. ::.:. : mKIAA1 SWNLPLTSKKMMSDASDMLAAALEQMDGIIAGSKALE- 10 20 30 260 270 280 290 300 310 mKIAA4 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