FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1069.ptfa, 1289 aa vs ./tmplib.26680 library 1767728 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7255+/-0.00557; mu= 9.6524+/- 0.371 mean_var=156.0530+/-36.817, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1027 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0450 ( 1592 res) mbg09026 (1592) 2194 338 7.9e-93 mKIAA1092 ( 889 res) mbg09321 ( 889) 774 127 1.1e-29 mKIAA1964 ( 801 res) meh02207 ( 801) 720 119 2.6e-27 mKIAA1516 ( 1364 res) mbg09342 (1364) 514 89 5.8e-18 mKIAA0581 ( 962 res) mbg02025 ( 962) 500 87 1.9e-17 mKIAA4098 ( 1048 res) mpg00558 (1048) 499 87 2.2e-17 >>mKIAA0450 ( 1592 res) mbg09026 (1592 aa) initn: 2362 init1: 1397 opt: 2194 Z-score: 1758.9 bits: 338.0 E(): 7.9e-93 Smith-Waterman score: 2388; 39.056% identity (44.849% ungapped) in 1293 aa overlap (14-1255:407-1583) 10 20 30 40 mKIAA1 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.: :::::.:::..::: :.. mKIAA0 GTARQKKTMKLSRALSDLVKYTKSVGTHDVEIEVVSSWQVSSFSETKAHQILQQKPTQYL 620 630 640 650 660 670 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 IYNQKQLTRIYPSAYRIDSSNFNPLPYWNAGCQLVALNYQSEGRMMQINRAKFKANGNCG .::.::.:::::.::.::::.:: :.::::::.:::::::::::.:.:::::.:::.:: mKIAA0 RFNQHQLSRIYPSSYRVDSSNYNPQPFWNAGCQMVALNYQSEGRMLQLNRAKFSANGDCG 680 690 700 710 720 730 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 YILKPQQMCKGTFNPFSGDPLPANPKKQLILKVISGQQLPKPPDSMFGDRGEIIDPFVEV :.:::: ::.:.::: : ::::.. :::: :..::::::::: ::..::::::::::::: mKIAA0 YVLKPQCMCQGVFNPNSEDPLPGQLKKQLALRIISGQQLPKPRDSVLGDRGEIIDPFVEV 740 750 760 770 780 790 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 EIIGLPVDCCKDQTRVVDDNGFNPVWEETLTFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIGRDFVGQR :.::::::: :.::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::.::: mKIAA0 EVIGLPVDCSKEQTRVVDDNGFNPMWEETLVFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIGRDFIGQR 800 810 820 830 840 850 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 TVTFSSLVPGYRHVYLEGLTEASIFVHITINEIFGKNRQLQGLKGLFNKNPRHAS--SEN :..:::..::::::::::. :::::::.....: :: .: :::::: .. . .: :. 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: : .:.: . .. : : . : : : . mKIAA0 SSMSSNDTVIDLSL----PS-----LGLCRSRESIPGVSLGRLTSRPC----LASAARPD 1330 1340 1350 1360 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA1 IPGV-KNHSISHLTYQGAGFVYNHFSSSDAKTNQICEPQQPRAPDMHAPTPTPSTHAPLA .: : :..: .: : :. : . .: :: : : : : : :. mKIAA0 LPPVTKSKSNPNLRVAG-GL-------PTAPDELQPRPLAPRLTGHH-PRP-PWHHLTLV 1370 1380 1390 1400 1410 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA1 ALK-LPSPCKSKSLGDLTSEDIACNFESKYQCISRSFVTNGIRDKSVTMKTKSLEP---L .:. : :::::::::..:.: .:.. : : .. :. . .:. .. ::: mKIAA0 GLRDCPVSAKSKSLGDLTADDFAPSFQG-----STSSLSCGLGSLGVAHQV--LEPGIRR 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1140 1150 1160 1170 1180 1190 mKIAA1 DALTEQLRKLVSFDQED---SCQVLYSKQDVNQCPRALVRKLSSRSQSRVRNIASRAKEK :::::::: :..:.: : : : . ...:. :::.::::: :::::.. mKIAA0 DALTEQLRWLTGFQQAGDITSPTSLGPAGDGSVGGPSFLRRSSSRGQSRVRAIASRARQA 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1200 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA1 QEAGKQKAMAQSTRGGVVLRSKPPAPALAVNRHSTGSYIASYLRNMKAGGLEGRGIPEGA :: .:. .:..:: . : : .:.... . . ..: :: . mKIAA0 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:. : mKIAA1 PADCAEQRTKTVNQNGDAPIFDESFEFQINLPELAMVRFVVLDDDYIGDEFIGQYTIPFE 560 570 580 590 600 610 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 SLVPGYRHVYLEGLT-----EASIFVHITI-NEIFGKNRQLQGLKGLFNKNPRHASSENN : ::::: :..:: .::.:::..: :. : . . .::. .:. :. .: mKIAA1 CLQTGYRHVPLQSLTGEVLAHASLFVHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRT 620 630 640 650 660 670 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 SHYVRKRSIGDRILRRTASAPAKGRKKSKVGFQEMVEIKDSVSEASRDQDGVLRRTTRSL mKIAA1 LWIKTVDEVFKNAQPPIRDATDLRENMQNAVVSFKELCGLSSVANLMQCMLAVSPRFLGP 680 690 700 710 720 730 >>mKIAA1964 ( 801 res) meh02207 (801 aa) initn: 739 init1: 306 opt: 720 Z-score: 582.6 bits: 119.4 E(): 2.6e-27 Smith-Waterman score: 730; 33.951% identity (47.414% ungapped) in 486 aa overlap (14-483:435-798) 10 20 30 40 mKIAA1 AIDRPWLCCCSLRFPVILSIENHCSIQQQRKIAQYLKGILQDK .:::::.::::...:: .:..:..:: : mKIAA1 VIYHGHTLTSKILFRDVIQAVRDHAFTSSPYPVILSLENHCGLEQQAVMARHLRSILGDM 410 420 430 440 450 460 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 LDLSSVDTGECRQLPSP-QSLKGKILVKGKKLPYHLGDDAEEGEV-SDEDSADEIEDECK : ...:. . ..:::: :.:::.::::::::: . .:.:.. ::.. .: :.: mKIAA1 LVTQALDSQNPEELPSPEQQLKGRILVKGKKLP---AARSEDGRILSDREEEEEEEEE-- 470 480 490 500 510 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 FKLHYSNGTTEHQVESFIRKKLESLLKESQIRDKEDPDSFTVRALLKATDEGLNAHLKQN ..:.:.: . mKIAA1 ------------------------------------------------AEEALEAAEQ-- 520 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 LDVKESGKKSHGRSLMANFGKHKKATKSRSKSYSTDDEDDSLQNPGKEGGQLYRLGRRRR .::.:. : : mKIAA1 --------------------------RSRAKQIS----------P--------------- 530 230 240 250 260 270 mKIAA1 TMKLCRELSDLVVYTNSVAAQDIVDDGTTG-----NVLSFSETRAHQVVQQKSEQFMIYN ::: :.:: .. . . : . : .: :.:: .:.. ... . .:. .: mKIAA1 ------ELSALAVYCCATRLRTL--DPSPGPPQSCTVGSLSERKARKFTREAGTSFVRHN 540 550 560 570 580 590 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 QKQLTRIYPSAYRIDSSNFNPLPYWNAGCQLVALNYQSEGRMMQINRAKFKANGNCGYIL .::::.:: . :..:.:.:: .::.::::::::.:. : :..: ..: ::.:::.: mKIAA1 TQQLTRVYPLGLRMNSANYNPQEMWNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNTGRFLINGQCGYVL 600 610 620 630 640 650 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 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