FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0482.ptfa, 1331 aa vs ./tmplib.26680 library 1767686 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5049+/-0.00963; mu= -22.0266+/- 0.637 mean_var=532.8076+/-128.443, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0556 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0347 ( 1267 res) mbg06119 (1267) 1799 160 3e-39 >>mKIAA0347 ( 1267 res) mbg06119 (1267 aa) initn: 2783 init1: 1678 opt: 1799 Z-score: 797.1 bits: 159.8 E(): 3e-39 Smith-Waterman score: 3101; 45.105% identity (51.951% ungapped) in 1328 aa overlap (52-1278:2-1255) 30 40 50 60 70 mKIAA0 APVVASSPSLFRPPLYGPDMSGPLEGADGGGDPRPGEPFCPGGV---PSPGAPQHRP-CP :. :: : : ::: .: ..: : mKIAA0 RGEALIPEPDMNGYVDFSPSPTSPTKEPGAP 10 20 30 80 90 100 110 120 130 mKIAA0 GPS---LADDTDANSNGSSGNE--SNGPESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKS :. : .:.: .: :::::: :.: .:.: :. . :::. .: .:::.. 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