FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0618.ptfa, 971 aa vs ./tmplib.26680 library 1768046 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.9380+/-0.0104; mu= -32.5078+/- 0.687 mean_var=644.8386+/-154.290, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0505 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0023 ( 2112 res) mbg02458 (2112) 491 52 1.3e-06 mKIAA2032 ( 981 res) mfj03378 ( 981) 444 48 7.8e-06 mKIAA0697 ( 1119 res) mpm11062 (1119) 328 40 0.003 >>mKIAA0023 ( 2112 res) mbg02458 (2112 aa) initn: 331 init1: 150 opt: 491 Z-score: 211.1 bits: 51.6 E(): 1.3e-06 Smith-Waterman score: 635; 27.669% identity (32.817% ungapped) in 918 aa overlap (122-971:1177-2018) 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 TVLNALKEKKKRTVAEEDQLHLDGQENKRRRHDSGGSGHSAFEPLVANGVPAAFVPKPGS .:... . :... : :::. : :: mKIAA0 STLKTVPQVVNVQELRSNPSPPSAAMGSAVQHSAAKTPHAVLTP-VANSQA-----KQGS 1150 1160 1170 1180 1190 1200 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 LKRSLASQSSDDHLNKRSRTSSVSSLASACTGGIPSSSRNAITSSYSSTRGISQLWKRSG : :. .. . . ..:: .: : .....: ::. :.. ... .. .. mKIAA0 LINSFKPSGPT------AASCQLSSGDKAVGQGT-AKTESAATSTPSAAGQLNKPFSFAS 1210 1220 1230 1240 1250 220 230 240 250 260 mKIAA0 PTSSPFSS----PASSRSQTPER--PAKKTREEEPCQQSSSSPPLVTDKESPGEKVTDTT : . :.. :.:: . :: :.:. . : . .... :. .. ::.. . . mKIAA0 PGTFTFGTITPTPSSSFTATPGAGPPTKEPTQLEAFSFGGGGKPF--SEAIPGNSPATGA 1260 1270 1280 1290 1300 1310 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 TGKQQSSWTSPP---TPGSSGQRKRKIQLLPSRRGDQLTLPPPPELGYSITAEDLDMERK :. ..: :. . ::.. . : ...: :: .:: . .: : mKIAA0 TSAPSTSVTAASLEDSAPSSSKPAAPPETTVSSASSKLETPPS-KLGELLFPSSLAGETL 1320 1330 1340 1350 1360 1370 330 340 350 360 370 mKIAA0 ASLQWFN-KVLED--KPDDASASATDGPPSTSPPFTFTLPAVGPAASPASLPAPSSNPLL .:.. . :: :: . ..:.. . . . : ..: .. ..:. :: .:. mKIAA0 GSFSGLRVGQAEDSTKPVSKASSTNLAGAQPAKPSGVSFPNTSVLGKPVE-PAVTSSV-- 1380 1390 1400 1410 1420 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 ESLKKMQESPAPSSSEPAEAATVAAPSPPKTPSLLAPLVSPLAGPLASTSSDSKPAATFL ::::.. :: : .:.. : : .::.: ::: . : : mKIAA0 --------SPAPAA--PASALNVSTSSSSATVFGSVPLTS--AGPPGLIS--------FG 1430 1440 1450 1460 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 GLASASSITPLTDSKSSGVSQAEQSVSTPASTASSPT-PK--PSMLFG-MLSPPASSSSL : : ::: . .. .... .:.. : .::.::. .:. : :.. :: .:: :..:: mKIAA0 GAALASSKASFSFGNQQ-TSSSTASSATPTSTSVAPSLPASFPTLSFGGLLSSPSASS-- 1470 1480 1490 1500 1510 1520 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 ATPAPACASPMFKPIFPATPKSESDSPLPSSSSAATTASSSTAPPTAASTTPTFKPIFDK :. . : . ::.: ..::: : .::: : . : .. .. : :. : mKIAA0 -LPVSSGKSTE-EAAPPAVP-DKSDS----SEVSATTPSLPVQPQSTQASLQTSDPV--K 1530 1540 1550 1560 1570 560 570 580 590 600 mKIAA0 MEPFTAMPLSTPFSLKQTTATATTTATSAPLFTG--------LGTATSTVASGTAASASK :: .. .. : ..:. .... : :. : .. :.. .. : :: :. mKIAA0 KEPVLVQTTDSSPSRPASSASFVASTESMPVTLGAPDSKIEAVSPASTFAGPGQAAVATA 1580 1590 1600 1610 1620 1630 610 620 630 640 650 mKIAA0 PVFGFG--------VTTAASTASSTMTSTSQSVLFGGAPSSA------PALASIFQFGKP . : : . :.....::. ::......:: : :.. :: .: :.. mKIAA0 VLPGAGSAATEASGTPTTSTVSSSSPTSATETAVFGTATSGSSVFTQPPAASSSSAFSQL 1640 1650 1660 1670 1680 1690 660 670 680 690 700 mKIAA0 LAPAASAAGTS--FSQPLASSTQTAAS--NSGFSGFGSTLTTSTSAPATTSQPTLTFSNT . .:.: ... :.: :: :.:::. ... ::::: . ..:::.. .: . :..: mKIAA0 SSNTATAPSATPVFGQVAASITSTAAATPQASSSGFGSP-AFGASAPGVFGQTA--FGQT 1700 1710 1720 1730 1740 1750 710 720 730 740 750 760 mKIAA0 VTPTFNIPFSSSAKPALPTYPGANSQPTFGATDGATKPALAPS-FGS--------SFTFG :.:. :: :. . :: .: :.:: . ..: . . . ::. ::.:: mKIAA0 --PAFGQATSSPASGFSFSQPGFSSVPAFGQSVSSTPASTSANVFGATSSTSSPGSFSFG 1760 1770 1780 1790 1800 1810 770 780 790 800 810 mKIAA0 NSVASAPSAAPAPATFGSAAQPAFG---GLKAAASTFGAPASTQPAFGSTTSVFSFGSAT .. :. . . ::. :::: :. ..:.::. ..: . .. : ::: .: mKIAA0 QA-----STNTGGTLFGQNNPPAFGQSPGFGQGSSVFGGTSATTST--AAPSGFSFCQA- 1820 1830 1840 1850 1860 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 TSGFGAAATAATTTQTTNSGSSSSLFG-SSAPSPFTFGGSAAPAGSGGF-GLSATPGT-S ::::.. :... :..:.:.: .:: ::. : .::.. : :.: : ::.. :. . mKIAA0 -SGFGSSNTGSVFGQAANTGGS--VFGQSSTSSGGVFGSGNATRGGGFFSGLGGKPSQDA 1870 1880 1890 1900 1910 880 890 900 910 920 mKIAA0 STSGTFSF---GSGQSGTPGTTTSFGSLSQNTLGAPSQGSPFAFSVGSTPESKPV--F-- .... :: : :....:.:.. ::. . .:.:. :. .: :.::. : mKIAA0 ANKNPFSSAGGGFGSTAAPNTSNLFGNSGAKTFGG--------FGSSSFGEQKPAGTFSS 1920 1930 1940 1950 1960 1970 930 940 950 960 970 mKIAA0 GGTSTPT--FGQSAPAPGVGTTGSSLSFGASST--PAQGFVGVGPFGS :: :. . :: :.: .: :.. ::. : . :: :: ::: mKIAA0 GGGSVASQGFGFSTPNK-TGGFGAAPVFGGPPTFGGSPGFGGVPAFGSAPAFTSPLGSTG 1980 1990 2000 2010 2020 2030 mKIAA0 GKVFGEGTAAASAGGFGFGSSGNTASFGTLASQNAPTFGSLSQQTSGFGTPSSGFAGFGS 2040 2050 2060 2070 2080 2090 >>mKIAA2032 ( 981 res) mfj03378 (981 aa) initn: 334 init1: 90 opt: 444 Z-score: 197.1 bits: 47.9 E(): 7.8e-06 Smith-Waterman score: 477; 25.744% identity (29.373% ungapped) in 874 aa overlap (59-888:170-979) 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 VCWNGGHKKAVLSPRNSRMVCSPVTVRIAPPDSKLFRSSMSEQ-----ILDTTLSSPSSN : ::: .:::. .:. . :. . . mKIAA2 SILSCFTFSKDKLAALELLASNIVDAQNSRPIEDLFRINMSEKKRCKRVLEQA-SKAGCK 140 150 160 170 180 190 90 100 110 120 130 mKIAA0 AP----DPCAKETVLNALKEKKKRT--VAEEDQLHLDGQE--NKRRRHDSGGSGHSAFEP :: . :. : : .: . :. ::.: :. . . : : : mKIAA2 APHAMISSCGTFPGNPYPKGKPSRINGIFPGTPLKKDGEEITNEGKGIAARILGPSKPPP 200 210 220 230 240 250 140 150 160 170 180 190 mKIAA0 LVANGVPAAFVPKPGSLKRSLASQSSDDHLNKRSRTSSVSSLASACTGGIPSSSRNAITS . : : :: : : :. . . . : ... ::.. . :.: . . mKIAA2 STYN--PHKPVPYPIPPCRPHATIAPSAYNN-----AGLVPLANVIAPGVPPPPPYTPNP 260 270 280 290 300 310 200 210 220 230 240 mKIAA0 SYSSTRGISQLWKRSGPTSSP-FSSPASSR-----SQTPERPAKKTREEEPCQQSSSSPP . .... .:. .: ::.: ::.:::. :..: :: .. . : mKIAA2 AGTDNEDLSS---QSKPTQSQTFSTPASQLFSPHGSSNPSTPAATPVPAVSPAKAVNHPS 320 330 340 350 360 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 LVTDKESPGEKVTDTTTGKQQSSWTSPPTPGSSGQRKRKIQLLPSRRGDQLTLPPPPELG . . . : ..:.:. . . .: ::. . : .. : . : : : . mKIAA2 VSAAATGAGMSATNTALAVFPTP--QPNTPNPTVIRTPSVPATPVTSTHSTTPTPVPSV- 370 380 390 400 410 420 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 YSITAEDLDMERKASLQWFNKVLEDKPDDASASATDGPPSTSPPFTFTLPAVGPAASPAS .: . . .: : .:: : . ..: :. : . .: .: mKIAA2 FSGLVPLPGLSATPTL----------PTQAS-SISRVTLASSETFASTCAPFSGHSSASS 430 440 450 460 470 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 LPAPSSNPLLESLKKMQES-PAPSSSEPAEAATVAAPSPPKTPS------LLAPLVSPLA . .:::. :... . : : : . ..:.:.: : . .::.: : mKIAA2 TAGSASNPITAPLSSVFAGLPLPF---PPASHSIATPTPSVIASAAGPHGVNSPLLSALK 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 mKIAA0 GPLAST-----SSDSKPAATFLGLASASSITPL-TDSKSSGVSQAEQSVSTPASTASSPT : :.:. .:.. :.:. :::: ::. .:: .:.... ...::. :: : mKIAA2 GFLTSNDTHLINSSALPSAVTSGLASLSSLPNRNSDSPASATNKCYPPAAVPAAQRSS-T 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 PKPSMLFGMLSPPASSSSLATPAPACASPMFKPIFPATPKSESDSPLPSSSSAATTASSS : .:. :. :: ::..:.: :: ::. : :.: : ..: .: . :.. mKIAA2 PGLAMFPGLQSPVASATSVAPTLPA-QSPLATPS-TAVPVSCGSS---GSLLHGPHAGGI 600 610 620 630 640 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 TAPPTAASTTPTFKPIFDKMEPFTAMPLSTPFSLKQTTATATTTATSAPLFTGLGTATST .. :.::. :.. : :: . : . . : . : . :. : : : :.. mKIAA2 SSAPAAATM-----PVMIKSEPTSPPPSAFKGPAHPGTPVRGTLGLSGAL--GRGYPTTS 650 660 670 680 690 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 VASGTAASASKPVFGFGVTTAASTASSTMTSTSQSVLFGGAPSSAPALASI---FQF-GK : .... . . :.. .. ..: .. ..:. .. . .. : ..:. : . :. mKIAA2 VPISVSTCLNPALSGLSSLSTPLAGSMSLPPHASSTPIAPVFTALPPFTSLTNSFPLPGS 700 710 720 730 740 750 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 P-LAPAASAAGTSFSQPLASSTQTAASNSGFSGFGSTLTTSTSAPATTSQPTLTFSNTVT : : ::.: ::.: ..: .:: . . . :.: ::...::. : :..:..: mKIAA2 PSLNPAVSLAGSS------TTTTSAAVHPSSATVRSVLPTSNASPAAF--P-LNLSTAVP 760 770 780 790 800 720 730 740 750 760 mKIAA0 PTFNI---PFSSSAKPALPTYPGANSQPTFGATDGATKPAL-APSFGSSFTFGNSVASAP : . :. .: .:. : .: ..: :. :: . :.: ::: . : .:::: mKIAA2 SLFAVTQGPLPTS-NPSYPGFP-VSSAPS-GAPTLPSFPGLQAPST-VAVTPLPVAASAP 810 820 830 840 850 860 770 780 790 800 810 820 mKIAA0 SAAPAPATFGSAAQPAFGGLKAAASTFGAPASTQPAFGSTTSVFSFGSATTSGFGAAATA : ::. :.:: . :.. .: . : .. : : ::.. .. ::. : mKIAA2 SPAPVLPGFASAFSSNFNSALVAQA--GLSSGLQAA-GSSVFPGLLSLPGIPGFSQAPPQ 870 880 890 900 910 920 830 840 850 860 870 880 mKIAA0 ATTTQTTNSGSSSSLFGSSAPSPFTFGGSAAPAGSGGFGLSATPGTSSTSGT-FSFGSG- .. . .:....: . ... : .. . :: . :: :. :: :: ::. .: mKIAA2 SSLQELQHSAAAQSALLQQVHSASAL--ESYPAQADGF-----PSYPSTPGTPFSLQTGL 930 940 950 960 970 890 900 910 920 930 940 mKIAA0 -QSGTPGTTTSFGSLSQNTLGAPSQGSPFAFSVGSTPESKPVFGGTSTPTFGQSAPAPGV ::: mKIAA2 SQSGWQ 980 >>mKIAA0697 ( 1119 res) mpm11062 (1119 aa) initn: 140 init1: 66 opt: 328 Z-score: 150.7 bits: 39.5 E(): 0.003 Smith-Waterman score: 345; 20.798% identity (24.226% ungapped) in 1053 aa overlap (35-969:85-1106) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 FVITPRRRYPIQQAQYSLLGALPTVCWNGGHKKAVLSPRNSRMVCS-PVTVRIAPPD--- ..: ..:.: ... . :. . . :. mKIAA0 TIGISATWTTLAGSHGKRNNTITTTSSKRKNRKNKITPENVQIIFDDPLPISYSQPEKVN 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 mKIAA0 -----SKLFRSSMSEQILDTTLSSPSSNA-----PDPCAKETVLNALKEKKKRTV----A :. .:. :... .. :. :::. . :. .: ... ::. .: mKIAA0 GESKSSSTSESGDSDNMRISSCSDESSNSNSSRKSNNHASAVVTTTMASKKQPSVLVTFP 120 130 140 150 160 170 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 EEDQLHLDGQENKRRRHDSGGSGHSAFEPLVANGVPAAFVPKPGSLKRSLASQSSDDHLN .:.. ..:. . . . . . ... . .: :. . :.: ..:: . . . mKIAA0 KEERKSVSGKASIKLSETVNEGTSNSLSTCTKSG-PSPLSSPNGKL--TVASPKRGPKRE 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 mKIAA0 K------RSRTSSVSSLASACTGGIPSSSRNAITSSYSSTRGISQLWKRSGPTSSPF-SS . :...: :.. : : . . ::: .. :.. ..: . .. mKIAA0 EGWKEVVRKKVSVPSTVISRVIGR-GGCNINAIRECTGAHIDIDKQKDKTGDRIITIRGG 240 250 260 270 280 290 220 230 240 250 260 mKIAA0 PASSRSQT---------PER------PAKKTREEEPCQQSSSSPPLVTDKESP--GEKVT :.:. : :.. : .. . .. .:: : .: .: : :.: mKIAA0 TESTRQATQLINALIKDPDKEIDELIPKNRLKSSTANSKIGSSAPTTTAANSSLMGIKMT 300 310 320 330 340 350 270 280 290 300 310 mKIAA0 D---TTTGKQQSSWTSPPTPGSSGQRKRKIQLLPSRRGDQLTLP---PPPELGYSI-TAE ..:.. .. : : ..: .. : . : : ..:: :::...... .:. mKIAA0 TVALSSTSQTATALTVPAISSASTHKTIKNPVNNVRPGFPVSLPLAYPPPQFAHALLAAQ 360 370 380 390 400 410 320 330 340 350 mKIAA0 DLDMERKASLQW--FNKVLEDKPDD---------ASASATDGP-PSTSPPFT-------- ... : : :. .. . . : ::..: : : . mKIAA0 TFQQIRPPRLPMTHFGGTFPPAQSTWGPFPVRPLSPARATNSPKPHMVPRHSNQNSSGSQ 420 430 440 450 460 470 360 370 380 390 400 mKIAA0 -------FTLPAVGPAASPASLPAPSSN--PLLESLKKMQESPAPSSSEPAEAATVAAPS . :.. ..: ...:. .:: : :.... . ..:. . ...... : mKIAA0 VNSAGSLTSSPTTTASSSASAVPGTTSNGSPSSPSVRRQLFVTVVKTSNATTTTVTTTAS 480 490 500 510 520 530 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 PPKTPSLLAPLVSPLAG---PLASTSSDSKPAATFLGLASASSITPLTDSKSSGVSQAEQ .: : : : :..: :: : :: :.. : . . : ..:.: .:: mKIAA0 NNSTAPTNATYPMPTAKEHYPVSSPSSPSPPAQPG-GVSRNSPLDCGSASPNKGASASEQ 540 550 560 570 580 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 SVSTPASTASSPTPKPSMLFGMLSPPASSSSLATPAPACAS---PMFKPIFPATPKSESD .:.: :. .:. :: :::: .. . .. : : : : ..:. mKIAA0 EASSP------PVVEPANS----RPPHSSSSSGSSSGHSTQQQPPGSVPQEPRPPLQQSQ 590 600 610 620 630 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 SPLPSSSSAATTASSSTAPPTAASTTPTFKPIFDKMEPFTAMPLSTPFSLKQTTATATTT : :. .. ...:.:: .. ::.:. :. : : : : : ... . . mKIAA0 VPSPDVRMTVPPTATSSAPVAVPSTAPVTYPM-----PQTQMGCSQPPKMEAPAIRPPSH 640 650 660 670 680 690 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 ATSAPLFTGLGTATSTVASGTAASASKPVFGFGVTTAASTASSTMTSTSQSVLFGGAPSS ::.:: : . .:... .. ..: . .. .. ::... ..:: .. : mKIAA0 ATAAPHKTPAPVQSSSASVLNVNHIKRP-HSVPSSVQLPSTLSTQSACQNSVHPANKPV- 700 710 720 730 740 750 650 660 670 680 690 mKIAA0 APALASIFQFGKPLAP----AASAAGTSFSQPLASSTQTAASN-SGFSGF---GSTLTTS :: ... . :: :.. . : . .. :..:: .: : :: :.. .. : : mKIAA0 APNFSAPLPFG-PFSTLFENNPTNAHAFWGGPVVSSQSTPESMLSGKSSYLPNSDPLHQS 760 770 780 790 800 810 700 710 720 730 740 mKIAA0 TSAPATTSQPTL---TFSNTVTPTFNIPFSSSAKPALPTYPGANSQPTFGATDGATKPAL .. : .: : . : . ... :..: . :. . :. . : : : mKIAA0 DTSKAPGFRPPLQRPAPSPSGIVNMDTPYGS-VTPSSTHLGNFASSLSGGQMYGPGAPLG 820 830 840 850 860 870 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 APSFGSSFTFGNSVAS--APSAAPAPATFGSAAQPAFGGLKAAASTFGAPASTQPAFGST . .:.. : .: . .: . .: . .: .:: . ... . ::.:. : . mKIAA0 GAPLGGAPTAANFNRQHFSPLSLLTPCSSASNESPAQSVSSGVRAPSPAPSSV-PLGSEK 880 890 900 910 920 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 TSVFSFGSATTSGFGAAATAATTTQTTNSGSSS-SLFGSSAPSPFTFGGSAAPAGSGGFG : : . .:. .: . ..:.:. :..::. . .: . : :: mKIAA0 PSSVSQDRKVPVPIGTERSA----RIRQTGTSAPSVIGSNLSTSVGHSGIWSFEGIGGNQ 930 940 950 960 970 980 870 880 890 900 910 mKIAA0 LSA---TPGTS--------STSGTFS-FGSGQSGTPGTTTSFGSLSQNT----LGAPSQG .. .:: . : :.:: . . . : .: :.. :.. . :. : mKIAA0 DKVDWCNPGMGNPMIHRPMSDPGVFSQHQAMERDSTGIVTPSGTFHQHVPAGYMDFPKVG 990 1000 1010 1020 1030 1040 920 930 940 950 960 mKIAA0 S-PFA-FSVGSTPESKPVFGGTSTPTFGQSAPAPGVGTTGSSLSFGASSTPAQG--FVGV : ::. .. . : :. :.. : : ..: . . .: ... .::: .: : . mKIAA0 SMPFSVYGNAMLPPVAPIADGAGGPIF--NGPHSAEPSWNSLIKMVSSSTENNGPQTVWT 1050 1060 1070 1080 1090 1100 970 mKIAA0 GPFGS ::.. mKIAA0 GPWAPHMNSVHMNQLG 1110 971 residues in 1 query sequences 1768046 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:24:30 2006 done: Mon Mar 27 10:24:31 2006 Scan time: 1.080 Display time: 0.290 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]