FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4116.ptfa, 979 aa vs ./tmplib.26680 library 1768038 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.9710+/-0.00885; mu= -19.6215+/- 0.582 mean_var=570.5487+/-135.008, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0537 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0661 ( 1035 res) mpm03031 (1035) 1822 157 1.2e-38 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 371 45 0.00012 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 340 42 0.00051 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 340 42 0.0006 mKIAA1749 ( 922 res) meh00393 ( 922) 323 41 0.001 mKIAA0635 ( 1125 res) mia28019 (1125) 301 39 0.0037 mKIAA1074 ( 1043 res) mfj11296 (1043) 289 38 0.0067 mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 291 39 0.007 >>mKIAA0661 ( 1035 res) mpm03031 (1035 aa) initn: 3072 init1: 1766 opt: 1822 Z-score: 786.2 bits: 157.0 E(): 1.2e-38 Smith-Waterman score: 3598; 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:: :.: ....:.:. .:. ::::. .. :.. . .: . .:.. :..: mKIAA0 EKGNTKVKQLKRQLEEAEEESQRINANRRKLQ--RELDEATESNEAMGREVNALKSKLRR 1890 1900 1910 1920 1930 1940 930 940 950 960 970 mKIAA4 PCCNMRKKDAVLTKCFHVFCFECVKTRYDTRQRKCPKCNAAFGANDFHRIYIG mKIAA0 GNEASFVPSRRAGGRRVIENTDGSEEEMDARDSDFNGTKASE 1950 1960 1970 1980 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 172 init1: 83 opt: 340 Z-score: 164.5 bits: 42.3 E(): 0.00051 Smith-Waterman score: 436; 21.064% identity (23.884% ungapped) in 940 aa overlap (57-924:396-1296) 30 40 50 60 70 80 mKIAA4 KKTAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQSKNRKLAEMLDQRQAIEDELREHIEKLE :..:.. . :..: :.. :...:: . mFLJ00 AKEKKLLEDRVAEFTTNLMEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTR 370 380 390 400 410 420 90 100 110 120 130 140 mKIAA4 RRQATDDASLL-IVNRYWSQFDE-NIRIILKRYDLDQGLGDLLTE--RKALVVPEPEPDS :. :...: . . .:. : .... :. .:. .:. . : .: ... . . mFLJ00 RKLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARVEEEAAQKNMALKKIRELE 430 440 450 460 470 480 150 160 170 180 190 200 mKIAA4 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