FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1026.ptfa, 808 aa vs ./tmplib.26680 library 1768209 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4843+/-0.00681; mu= 6.4283+/- 0.452 mean_var=272.2874+/-65.514, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 24 in 1/35 Lambda= 0.0777 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1230 ( 990 res) mfj00035 ( 990) 552 76 2.6e-14 mKIAA0897 ( 1140 res) meh02302 (1140) 448 64 9.1e-11 mKIAA4112 ( 1261 res) mfj10349 (1261) 435 63 2.6e-10 mKIAA0687 ( 1310 res) mpg00180 (1310) 235 40 0.0015 >>mKIAA1230 ( 990 res) mfj00035 (990 aa) initn: 608 init1: 324 opt: 552 Z-score: 349.3 bits: 75.8 E(): 2.6e-14 Smith-Waterman score: 576; 27.080% identity (31.239% ungapped) in 661 aa overlap (119-711:213-853) 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 AAVTVADSAVATMENHQHGAQVLLREEVVQLQEEVHLLR-QMKEMLAKDLEESQGGKCSE : .:.. :: ...:: .. :. . : .. mKIAA1 MAEISNLKLKLTAVEKDRLDYEDRFRDTEGLIQEINDLRLKVNEMDGERLQYEKKLKSTK 190 200 210 220 230 240 150 160 170 180 190 mKIAA1 VLSATELRVQLVQKEQELAR--------AK-EALQAMKAD---RKRLKGEKTDLVSQMQQ :. :. :: .:: :. : :: :..... : .:.:: ::. :..:.. mKIAA1 DELAS-LKEQLEEKECEVKRLQERLVCKAKGEGIEVLDRDENIKKKLK-EKNIEVQKMKK 250 260 270 280 290 300 200 210 220 230 mKIAA1 ----LYATLESREEQLRDFIRNYEQHRKESEDAVKALAKEKD------------LLEREK :.:. : .:....:. . ..:: .. :: : ..... ::. . mKIAA1 AVESLMAANEEKERKIEDLRQCLSRYRKMQDPAVLAQGQDSECEGLFHSSSISTLLDAQG 310 320 330 340 350 360 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 W-ELRRQAKEATDHAAALRSQLDL---KDNRMKELEAEL-AMAKQSLATLTKDVPKRHSL . .:.:... . .. :. : .. . . :.: . .. :. . : . :: . mKIAA1 FSDLERSTSSTPGMGSPSRDPLHTSAPEEFHTSVLQASIPSLLPPSVDVETCEKPKLPTK 370 380 390 400 410 420 300 310 320 mKIAA1 AMP------GETVLNGNQEWVVQADLPLTAAIRQSQQT-------------------LYH :...:.. : : .: :.....:.. . mKIAA1 PETSFEEGDGRAILGAAAE-VSLSDGVSTSSLQKSSSLGNLKKEASDGTDKAPTDSRTFG 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 SHPPHPADRQVRV--SPCHSRQP-SVISDA--SAAEGDRSSTPSDINSPRHRT--HSLCN . ::. ... : .: .:. : .. . . : :... .. ...: : mKIAA1 TLPPKVPGHEASVDDNPFGTRKARSSFGRGFFKIKSGKRTASAPNLAETEKETAEHLNLA 480 490 500 510 520 530 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 GDSPGPVQKSLHNPIVQSLEDLEDQKRKKKKEKMGFGSISRVFARGKQRKSLDPGLFDDS : : . ... .:. .: . ...:... .. ::.. : .: ...: ... mKIAA1 GTSRSKGSQGT-SPFPMSPPSPDSRKKSRGIMRL-FGKLRR-----SQSTTFNPDDMSEP 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 DSQCSPTRHSLSLSEGEEQMDRLQHVELVRTTPMSHWKAGTVQAWLEVVMAMPMYVKACA . . . :: . . : . .. .: :...: : .:: . ... :... mKIAA1 EFKRGGTRATAGPRLGWSRDLGQSNSDL--DMPFAKWTKEQVCSWL-AEQGLGSYLSSGK 600 610 620 630 640 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 ENVKSGKVLLSLSDEDLELGLGVCSSLHRRKLRLAIEDYRDAEAGRSLSKAADLDHHWVA . . ::..::. :..::: ::. ::::.::.::.. . : .. . :: .::. mKIAA1 HWIISGQTLLQASQQDLEKELGIKHSLHRKKLQLALQALGSEEE----TNYGKLDFNWVT 650 660 670 680 690 700 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 KAWLNDIGLSQYSQAFQNHLVDGRMLNSLMKRDLEKHLNVSKKFHQVSILLGIELLYQVN . ::.:::: ::. :.. ::::::. . :: . :.: . .:..:: .:..: : mKIAA1 R-WLDDIGLPQYKTQFDEGRVDGRMLHYMTVDDLLS-LKVVSVLHHLSIKRAIQVLRINN 710 720 730 740 750 760 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 FSREALQERRARCETQNTDPVV--WTNQRVLKWVRDIDLKEYADNLTNSGVHGAVLVLEP : . :. :: :.. : : :::.::..:.:..:: ::: :: .:::::...:::: mKIAA1 FEPNCLR-RRPSDENSITPSEVQQWTNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLMVLEP 770 780 790 800 810 820 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 TFNAEAMATALGIPSGKHILRRHLAEEMSTIFHPSNSTGIRESERFGTPPGRASSITRAG ::.:.:: :.:: .: .:::::: ... .. mKIAA1 RFNVETMAQLLNIPPNKTLLRRHLATHFNLLIGAEAQHQKRDAMELPDYVLLTATAKVKP 830 840 850 860 870 880 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 REDSGGNSKHRAGRLPLGKIGRGFSSKEPDFHDDYGSLENEDCGDEDLQGRPEQCRLEGY mKIAA1 KKLTFSNFGNLRKKKHEDGEEYVCPMELGQASGSSQKGFRPGLDMRLYEEDDLDRLEQME 890 900 910 920 930 940 >>mKIAA0897 ( 1140 res) meh02302 (1140 aa) initn: 610 init1: 386 opt: 448 Z-score: 285.7 bits: 64.3 E(): 9.1e-11 Smith-Waterman score: 640; 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