FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1640.ptfa, 1219 aa vs ./tmplib.26680 library 1767798 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7082+/-0.00747; mu= -4.7575+/- 0.493 mean_var=362.2333+/-85.667, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0674 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 434 57 1.9e-08 mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 308 45 9.4e-05 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 293 44 0.00034 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 273 42 0.0012 mKIAA1074 ( 1043 res) mfj11296 (1043) 251 39 0.0038 mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048) 251 40 0.0058 mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 243 39 0.0096 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 156 init1: 90 opt: 434 Z-score: 243.8 bits: 57.3 E(): 1.9e-08 Smith-Waterman score: 475; 21.504% identity (24.167% ungapped) in 944 aa overlap (300-1214:327-1195) 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 YQRDFPMGARHRFRLSIMGSLTPSDTDDLPLETDEPPQQE------SVQSTPRALEETRI :: .: .:. .... . ::: .: mFLJ00 ARVEEEEERCQYLQAEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQI 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 mKIAA1 QFLDQVQSLSPEALL--DRATEGSD---EAEEEGSQLIVLDPDHPLMIR-FQEALKGYLN . :: .:. : : ::..: . : ::....: : : :: ..: : mFLJ00 IMEDQNCKLAKEKKLLEDRVAEFTTNLMEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERL----- 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 RQMDKLKLDVQELDVATKQTRSQRQELGVNLYGVQQHLARLQMQLEKSHDRHSLVACERR :. .: . :::. . .. ... .:. .. .: ..:.:.::: : mFLJ00 RREEKQR---QELEKTRRKLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELKMQLAK------------- 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 RKEEELQCARSVYNKTCQTANEERKKLAALQTEVESLALHLFYMQNIEQDVRDDIQVMKQ :::::: : . .. : ::. :.:.. : : . :. :. . .:. mFLJ00 -KEEELQAALARVEEEAAQKNMALKKIRELETQISELQEDL----ESERASRNKAEKQKR 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 VVRKTETEKMHAEVEKKKQDLFVDQLTERSHQLEENI--ALFEAQYLSQAEDTRVLKKAV . . : : ...:.: .. ..: . ... : .: .: . .. . . ... mFLJ00 DLGE-ELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVSILKKTLEDEAKTHEAQIQEMRQKH 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 TEAITEIDTIAVEKKRI---LQQWTTSLVGMKHR--NEAYKTVMDALRECQHQVKSTDSE ..:. :. . ::. :.. .: . . . ::. :..... . .:. :..... mFLJ00 SQAVEELADQLEQTKRVKATLEKAKQTLENERGELANEV-KALLQGKGDSEHKRKKVEAQ 570 580 590 600 610 620 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 IEVCKKSIMQEEEKNEKLARLLNRAETEATLVQKMTAQCLSKQEALQTEFNTYQLALQDT .. . .. . :. .:: ... ..: : . .: ::. : .:.. . :::: mFLJ00 LQELQVKFSEGERVRTELADKVTKLQVELDSVTGLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDT 630 640 650 660 670 680 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 EEMLNKGYVEHSAVLSELQATRQAFHQEQELRQKMDMSMVDKLQEQGTSSKMTKYFHQLL .:.:.. :. :: .: ... .:.... .. . . . :. .: . mFLJ00 QELLQE---ENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFREQLE----EEEEAKRNLEKQIATLHAQV 690 700 710 720 730 740 740 750 760 770 780 mKIAA1 RKLQKENTNLVTHLSKIDGDIAQATLDITNTNCKIDMHKKTLAEMDKEVKRF----NDLI ..:. . : : . . :. . . ... . . ...: :. .::. mFLJ00 TDMKKKMEDGVGCLETAEEAKRRLQKDLEGLSQRLEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLL 750 760 770 780 790 800 790 800 810 820 830 840 mKIAA1 TNSESEIARRTIL-IERKQSLINFFNKQL--EQMVSELGGEEAGPLELEIKRLSKLTEEY .. . . :... .:.::. :.. : :. .: .:: : : .. . mFLJ00 VDLDHQ--RQSVSNLEKKQKK---FDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSL 810 820 830 840 850 850 860 870 880 890 900 mKIAA1 NTGVAEAQMTWLRLQQELVQVTHEREEQLVSVDQLKKEVHIMEQKKLRIESKIAHEKKEQ .. ::. .:.. : : :. . : :.. : :: .:..: .:... .: : : mFLJ00 ARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQV-EEMKTQ 860 870 880 890 900 910 910 920 930 940 950 960 mKIAA1 KIVSRHMRDLDNDLSKLNMLLDKNRCSSEELEQNNIATETEFLRTLKDSERETIQMQEKL ...:...:. . : .. .:: : : ...: : :. .... . ...: mFLJ00 ------LEELEDELQATE---D----AKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQL 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA1 MELSEEKATLLNSFMEAEHQIMLWEKKIQLA-KEMRSSVDSETGQTEIRAMKAEIHRMKV .. .: . :.. . . . : .::... :.... .:. . . : .:.: .. mFLJ00 VRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDTANKNRE-EAIK------QL 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA1 RHGQLLKQQEKMIRDMELAVARRETIVVQAEGQSKIDKKVITKTEFHYQQRELQKKVREM : .: :.. .:... . : :: :..::. . : :.. ..:. :.:: : mFLJ00 R--KLQAQMKDCMRELDDTRASREEILAQAKENEKKLKSM--EAEMIQLQEELAAAERAK 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA1 HKATDDCTNTISELEETQKFLSSSLQEKQQLLSEMQATTDVLEEEINQLTALKRQNLLEI ..: .. . .:. ... . .:.::..: ... . :::: .. .. . :. mFLJ00 RQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELEEEQGNTELINDR--LKK 1080 1090 1100 1110 1120 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA1 VTLQTRGKHLQAAIEGKYVFLHRNSRSQLMER--KRLSVRLSQLNKVLSSVQEDYPQYQE ..:: . . .: ... ..:.:.:: :: :.:...:........: .:. mFLJ00 ANLQIDQINTDLNLERSHAQKNENARQQL-ERQNKELKAKLQEMESAVKS------KYKA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1210 mKIAA1 VLQSIQQKIATKLETPEPS . ... ::: .:: mFLJ00 SIAALEAKIA-QLEEQLDNETKERQAASKQVRRTEKKLKDVLLQVEDERRNAEQFKDQAD 1190 1200 1210 1220 1230 1240 >>mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319 aa) initn: 112 init1: 51 opt: 308 Z-score: 177.7 bits: 45.1 E(): 9.4e-05 Smith-Waterman score: 365; 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