FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1837.ptfa, 1119 aa vs ./tmplib.26680 library 1767898 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3431+/-0.00582; mu= 6.1273+/- 0.389 mean_var=197.0018+/-46.540, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0914 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0319 ( 1083 res) mbg09941 (1083) 2761 377 6.2e-105 >>mKIAA0319 ( 1083 res) mbg09941 (1083 aa) initn: 2730 init1: 2610 opt: 2761 Z-score: 1976.2 bits: 377.5 E(): 6.2e-105 Smith-Waterman score: 2873; 45.318% identity (48.988% ungapped) in 1068 aa overlap (112-1105:12-1073) 90 100 110 120 130 mKIAA1 PASWVLPGYCWQTSVKLPRSLYLLYSFFCFSVLWLSTDADES--RCQQGKTLYGAGLRTE :.: :.. : : .:..:.: :. .. . mKIAA0 GRMVSPPGVLSSLLLLAAMAGGSSQQCSEGRT-YSDAIISP 10 20 30 40 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 GENHLRLLAGSLPFHA--CRAACCRDSACHALWWLEGMCFQADCSKPQSCQPFRTDSSNS . . .:.. : : . : :::: .: ::.:: :. . : . ..:.: : : mKIAA0 NPETIRIMRVSQTFSVGDCTAACCDLLTCDLAWWFEGSCYLVKCMRSENCEPRTTGPIRS 50 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 mKIAA1 MLIIFQKSQTTDDLGLLPEDDEPHLLRLG-----WGRT--SWRRQ-SLLG---APLTLSV .: : . . :: : .: : :: . . :.. .:: .: . mKIAA0 YLT-FVRRPVQRPGQLLDYGD--MMLSRGSPSGAWGDSLEDLRKDLPFLGKDGGPEETTE 110 120 130 140 150 250 260 270 280 mKIAA1 PSSHHQSLLR-------DRQKR------DLSVVPTH-GAMQHSKVNHSEEAGA---LSPT :.....: : ... : : :..:.. :... . .. . :. .:: mKIAA0 YSDEYKDLERGLLQPSNQQDPRGSAEYPDWSLLPSNEGGFNATATGDNSAASMEKLQDPT 160 170 180 190 200 210 290 300 310 320 mKIAA1 -----SAEVRKTITVAGSFTSNHTTQTPEWPKNVSIHP---------------EPSEHSS . ... . : : .:.. . ::...: : .::. :. mKIAA0 PHPLDQEQLQALNESTWSPTPGHSSISSVWPSSASPLPTEEGLEGEETLQLQEQPSNSSG 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 mKIAA1 ---PV-SGTPQVKSTEHSPT----DAPLPVAP-SYSYATPT-PQASSQSTSAPHP----- :. : .:. : : ::. .. . :.: : ...::: : .. . .: : mKIAA0 KEVPMPSHNPSPASLESSPATTEKNSNFTVTPRSRKHSTPTFPTSTVLTGLTPPPWPLSP 280 290 300 310 320 330 380 390 400 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