# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj06041.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1837.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1837, 1119 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7916959 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6256+/-0.000193; mu= 12.7967+/- 0.011 mean_var=93.7972+/-17.998, 0's: 37 Z-trim: 47 B-trim: 86 in 2/64 Lambda= 0.132428 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148698327|gb|EDL30274.1| expressed sequence AU0 (1122) 7510 1445.9 0 gi|148698326|gb|EDL30273.1| expressed sequence AU0 (1055) 6949 1338.7 0 gi|123244433|emb|CAM19270.1| likely ortholog of H. 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