FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0470.ptfa, 803 aa vs ./tmplib.26680 library 1768214 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0386+/-0.00603; mu= 1.8349+/- 0.401 mean_var=195.7148+/-45.964, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0917 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0284 ( 1629 res) mbg02094 (1629) 438 71 1.2e-12 mKIAA1791 ( 1452 res) mpm08259 (1452) 190 38 0.0084 >>mKIAA0284 ( 1629 res) mbg02094 (1629 aa) initn: 811 init1: 339 opt: 438 Z-score: 319.3 bits: 71.0 E(): 1.2e-12 Smith-Waterman score: 1155; 35.072% identity (38.539% ungapped) in 767 aa overlap (3-753:884-1597) 10 20 30 mKIAA0 HSTSKGDRVIQNESKRRKAEEIPKCQASKGDK .:.: ::: .: : . : : . mKIAA0 PKKSFVGPGEVDGPGRVVQTSPSARDGLYVSSNGRMVIQLRSGR-SPEPDP------APP 860 870 880 890 900 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 KESSKSLVRQGSFTIDKPSSNIPIE-LIPHINKQNSSVPTALALTSASRLRERSDSLDTD ::. ...:: ::: .:.:. : .::: :: : :..: :.. :: mKIAA0 KETL-TFARQESFT-KEPTSGPPAPGKLPHI----SSHPLLQDLAAA-----RASRLDFH 910 920 930 940 950 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 SSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTASTISLV .. :: ::::.::...: :::.:: . .: .:: .: :.: .:::::::::::. mKIAA0 AQ-DTHLILKETETALAALEARLRSKSADECDGGSTPRPPED-SLSGDSDVDTASTISLL 960 970 980 990 1000 1010 160 170 180 190 200 mKIAA0 TGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTSSPSKDVTKSGS-REKI-EKKAKSRSADIGARADG .:.. . : . . . . :. . :: ::.. :.. . ::.: . mKIAA0 SGKNGPSPTTPQTPGPQKESPLSPPTVPDPGGATPGSARERMSERQHRPTPADLGPGDTS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 RKFVQSSGRIRQPSIDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKSHGRTPLTSADEHNI :. .. :. . :.: .... :.. : :. . . . .. : : .: . mKIAA0 RRAAMRRGHGSRGSLDWPEEERGSGLAHLPSSNHETPEATLAGRQGPRRKP--AAPPPSP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 HSKLEGGKATKSKTSPVASGSTSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELADADKASV .. : ... : :. .. . ..:..: :::::.: :::::::.:::.: .:...... mKIAA0 AAREEQSRS--SATAQKVQQALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAVDGERGTA 1140 1150 1160 1170 1180 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 ASEVSTTSSTSKPPTGRRTISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASARTAEAV :. .. .. : . ..:.:.::.::. : ::... ::::.. .:.. :.:.:: mKIAA0 ANPEPANRAA---PEQAKKLTRLDILAMPRK-RAGSFTGPSDSETAPARTGFSGRSAELY 1190 1200 1210 1220 1230 1240 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 IRSG----ARLVPSDKLSPRTRANSISRLSDSKVKSMSSTHGSPSVNSRWRRFPTDYAST : :. . : . : ::. : :... :. ..: :.: :. .::.:: mKIAA0 STSRKPTIAEARAAAKKAAATAANTGPRQPFSRARPGSARYSS---NTRRRQQGSDYTST 1250 1260 1270 1280 1290 1300 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 SEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRMQSTGSAMPASSSFKHRIKEQED---YIRDWTA ::.:.::...:::::: ..: : .: : .:. : . .:. : .: . :: mKIAA0 SEEEYGSHHSSPKHTRSHASTATQTPRGSSSTRARSQGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQ-TA 1310 1320 1330 1340 1350 1360 510 520 530 540 550 mKIAA0 HREEIARISQ----DLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREE . ::::.:: :.:..::::.::::. ::. : : . : ..... .::.:.:..::: mKIAA0 EIAEIARLSQTLVKDVAILAREIHDVAGDGDSLGSPGPTRSPSLGNVPNTPASTISAREE 1370 1380 1390 1400 1410 1420 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 VGDLHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPP-LVHSKTPEGNNGRSVDSRPQPAEHPDHLTITR ::.:. . ::::.:.:: ..:.. . : . ::: : :: .. mKIAA0 ----------LVQRIPEASLNFQKVPPGSMNSHNLDQNMN---DSRD------DALT-NK 1430 1440 1450 1460 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 RRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSRKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIENKLRAESE : .:.::. :::.:. : :.:. ::.. .. : :...::.. : :.:.: .. .:.: mKIAA0 TRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSHAIRENTEHLAEKMKVLFQNTGRAWEDLEARINSENE 1470 1480 1490 1500 1510 1520 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 VPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQVINAMIDPDGTLEALNNMGFPNAILPSPPKQKSS :::.:::. ::::::.::.::.:::.::::..::. .:. : . :.. .: :. mKIAA0 VPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSLNLDLLMGNRAPSGS-GQPGLGKAR 1530 1540 1550 1560 1570 1580 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 PVNNHS-SPSQTPALCPPETRALHPAAAGVAAAASTEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEE :. . : ::... .: : mKIAA0 PAAQSSTSPASVDTLLPALPLRSFPQRANCGPPGLPEPAFLPDAERFLI 1590 1600 1610 1620 >>mKIAA1791 ( 1452 res) mpm08259 (1452 aa) initn: 125 init1: 79 opt: 190 Z-score: 142.7 bits: 38.1 E(): 0.0084 Smith-Waterman score: 190; 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