# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj05191.fasta.nr -Q ../query/mKIAA4236.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA4236, 919 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7889952 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7674+/-0.000191; mu= 11.7847+/- 0.011 mean_var=81.0804+/-15.384, 0's: 40 Z-trim: 245 B-trim: 66 in 1/66 Lambda= 0.142435 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|33115144|gb|AAH55310.1| Zinc finger protein 748 ( 888) 6472 1341.3 0 gi|74205423|dbj|BAE21027.1| unnamed protein produc ( 888) 6464 1339.7 0 gi|109460679|ref|XP_001063731.1| PREDICTED: simila ( 889) 6148 1274.8 0 gi|109504557|ref|XP_001056356.1| PREDICTED: simila ( 915) 6134 1271.9 0 gi|12585543|sp|O43345.1|ZN208_HUMAN RecName: Full= (1167) 3287 687.0 1.4e-194 gi|119605317|gb|EAW84911.1| zinc finger protein 20 (1137) 3283 686.1 2.3e-194 gi|114676358|ref|XP_512547.2| PREDICTED: zinc fing (1186) 3229 675.1 5.3e-191 gi|73947674|ref|XP_541442.2| PREDICTED: similar to (1142) 3197 668.5 4.9e-189 gi|114676315|ref|XP_512535.2| PREDICTED: zinc fing (1226) 3196 668.3 5.9e-189 gi|549839|sp|Q05481.1|ZNF91_HUMAN RecName: Full=Zi (1191) 3193 667.7 8.9e-189 gi|119605346|gb|EAW84940.1| zinc finger protein 91 (1185) 3188 666.6 1.8e-188 gi|118600985|ref|NP_003421.2| zinc finger protein (1191) 3187 666.4 2.1e-188 gi|221043150|dbj|BAH13252.1| unnamed protein produ (1159) 3168 662.5 3.1e-187 gi|158255948|dbj|BAF83945.1| unnamed protein produ (1191) 3156 660.1 1.7e-186 gi|114676418|ref|XP_524454.2| PREDICTED: zinc fing (1325) 3132 655.2 5.7e-185 gi|114676858|ref|XP_512615.2| PREDICTED: zinc fing (1120) 3103 649.1 3.2e-183 gi|114676856|ref|XP_001163591.1| PREDICTED: zinc f (1238) 3103 649.2 3.4e-183 gi|114676354|ref|XP_528849.2| PREDICTED: zinc fing (1227) 3101 648.8 4.5e-183 gi|119605319|gb|EAW84913.1| zinc finger protein 20 ( 851) 3070 642.2 2.9e-181 gi|109124478|ref|XP_001104516.1| PREDICTED: simila (1233) 3052 638.7 4.8e-180 gi|73948425|ref|XP_541659.2| PREDICTED: similar to (1259) 3039 636.0 3.1e-179 gi|109461612|ref|XP_001078762.1| PREDICTED: simila (1321) 3037 635.7 4.3e-179 gi|109458488|ref|XP_574414.2| PREDICTED: similar t (1396) 3037 635.7 4.4e-179 gi|187671941|sp|A6NN14.3|YS032_HUMAN RecName: Full (1173) 3006 629.2 3.3e-177 gi|73948417|ref|XP_541652.2| PREDICTED: similar to (1109) 2999 627.8 8.5e-177 gi|148678351|gb|EDL10298.1| mCG140701 [Mus musculu ( 489) 2984 624.3 4.1e-176 gi|169213614|ref|XP_001719825.1| PREDICTED: simila (1291) 2972 622.3 4.4e-175 gi|169213828|ref|XP_001715017.1| PREDICTED: simila (1291) 2972 622.3 4.4e-175 gi|119605325|gb|EAW84919.1| hCG1773661 [Homo sapie (1119) 2964 620.6 1.3e-174 gi|73948212|ref|XP_541576.2| PREDICTED: similar to (1155) 2956 618.9 4e-174 gi|73947799|ref|XP_867596.1| PREDICTED: similar to (1751) 2934 614.6 1.2e-172 gi|73947805|ref|XP_867624.1| PREDICTED: similar to (1980) 2934 614.7 1.3e-172 gi|109124151|ref|XP_001087503.1| PREDICTED: simila (1063) 2931 613.8 1.3e-172 gi|114676311|ref|XP_524165.2| PREDICTED: zinc fing (1267) 2926 612.8 3.1e-172 gi|109125070|ref|XP_001108376.1| PREDICTED: zinc f (1091) 2925 612.6 3.2e-172 gi|109125066|ref|XP_001108496.1| PREDICTED: zinc f (1176) 2925 612.6 3.4e-172 gi|114677698|ref|XP_001160465.1| PREDICTED: zinc f (1446) 2918 611.2 1e-171 gi|114677696|ref|XP_001160657.1| PREDICTED: zinc f (1531) 2918 611.3 1.1e-171 gi|126329553|ref|XP_001363095.1| PREDICTED: simila (1120) 2914 610.3 1.6e-171 gi|67514190|gb|AAH98180.1| RIKEN cDNA A530054K11 g ( 973) 2908 609.0 3.3e-171 gi|114671709|ref|XP_511785.2| PREDICTED: zinc fing (1323) 2900 607.5 1.3e-170 gi|114677092|ref|XP_512625.2| PREDICTED: zinc fing (1377) 2898 607.1 1.7e-170 gi|126339331|ref|XP_001365944.1| PREDICTED: simila (1653) 2873 602.1 7e-169 gi|73947807|ref|XP_541674.2| PREDICTED: similar to (2872) 2863 600.3 4.2e-168 gi|73947331|ref|XP_541379.2| PREDICTED: similar to (2183) 2860 599.5 5.4e-168 gi|73970472|ref|XP_531878.2| PREDICTED: similar to (1216) 2851 597.4 1.3e-167 gi|73948423|ref|XP_541656.2| PREDICTED: similar to (1223) 2842 595.5 4.7e-167 gi|148678347|gb|EDL10294.1| mCG141045 [Mus musculu ( 863) 2833 593.5 1.3e-166 gi|109124526|ref|XP_001105632.1| PREDICTED: simila (1114) 2826 592.2 4.3e-166 gi|109124528|ref|XP_001105560.1| PREDICTED: simila (1117) 2826 592.2 4.3e-166 >>gi|33115144|gb|AAH55310.1| Zinc finger protein 748 [Mu (888 aa) initn: 6472 init1: 6472 opt: 6472 Z-score: 7188.5 bits: 1341.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 6472; 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