FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0739.ptfa, 1094 aa vs ./tmplib.26680 library 1767923 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5288+/-0.00449; mu= 20.1717+/- 0.302 mean_var=93.0472+/-21.369, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 30 in 1/35 Lambda= 0.1330 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4136 ( 1138 res) mbg09982 (1138) 4325 841 0 >>mKIAA4136 ( 1138 res) mbg09982 (1138 aa) initn: 5575 init1: 4325 opt: 4325 Z-score: 4479.7 bits: 840.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 5560; 74.661% identity (78.125% ungapped) in 1105 aa overlap (21-1090:37-1127) 10 20 30 40 50 mKIAA0 RLRPAMPAGSNEPDGVLSYQRPDEEAVVDQGGTSTILNIHYEKEELEGHR : :::::::.::: .::. :.:::.::::: mKIAA4 TAEQGAFFPEVLQNMEIKDQGAQMEPLLPTRNDEEAVVDRGGTRSILKTHFEKEDLEGHR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 mKIAA0 TLYVGVRMPLG-RQSHRHHRTHGQKHRRRGG-RGKGASQGEEGLEALAHDTPSQRVQFIL ::..::..::: :.:::.:: .:.:::.: : 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