FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0400.ptfa, 970 aa vs ./tmplib.26680 library 1768047 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.1400+/-0.0106; mu= -20.8034+/- 0.699 mean_var=599.3876+/-142.523, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0524 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1249 ( 1079 res) mbg09359 (1079) 3243 261 8.3e-70 mKIAA0041 ( 807 res) mbg03660 ( 807) 494 53 2.4e-07 mKIAA1099 ( 981 res) mfj15083 ( 981) 382 44 9.6e-05 mKIAA0167 ( 1029 res) mfj34112 (1029) 370 43 0.00019 >>mKIAA1249 ( 1079 res) mbg09359 (1079 aa) initn: 3058 init1: 1237 opt: 3243 Z-score: 1345.6 bits: 260.6 E(): 8.3e-70 Smith-Waterman score: 3452; 53.650% identity (64.972% ungapped) in 1096 aa overlap (49-970:1-1079) 20 30 40 50 60 70 mKIAA0 VSEFVAETHEDYKAPTASSFTTRTAQCRNTVAAIEEALDVDRMVLYKMKKSVKAINISGL :. .::::: :: .: :.::::::: :: mKIAA1 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