FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1973.ptfa, 1031 aa vs ./tmplib.26680 library 1767986 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5154+/-0.00434; mu= 19.2347+/- 0.291 mean_var=88.7599+/-19.954, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1361 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4184 ( 905 res) mbg07034 ( 905) 316 73 2.3e-13 >>mKIAA4184 ( 905 res) mbg07034 (905 aa) initn: 408 init1: 126 opt: 316 Z-score: 332.4 bits: 72.9 E(): 2.3e-13 Smith-Waterman score: 612; 22.525% identity (24.695% ungapped) in 808 aa overlap (70-848:91-856) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 YNLSLEVVMAIEAGLGDLPLMPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQ ::. :: .. : . .:: :...: .: mKIAA4 AFRFAVQLYNTNQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFC-SQFSRGVYAIFGF-YDQ 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 GEMMELDLVSSVLHIPVLSIVRHEFPRESQNPLHLQLSLENSLSSDADVTVSILTMNNWY : : ..:: :.: :: ... . .:. . .:.. . .:.: . .: mKIAA4 MSMNTLTSFCGALHT---SFVTPSFPTDADVQFVIQM--RPALKG---AILSLLGYYKWE 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 NFSLLLCQE-DWNITDFLL--LTENNSKFHLESIINITANLSSTKDLLSFLQVQLENIRN .: : : ..: . .. ..:: . .:. :: ::. : .. .:.. mKIAA4 KFVYLYDTERGFSILQAIMEAAVQNNWQVTARSVGNI-------KDIQEFRRI-IEEMDR 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 STPTMVMFGCDMGSIRQIFEMSTQFGLSPPDLHWVLGDSQNVEELRTEGLPLGLIAHGKT .. :.. : :.:. . .: :..:.. : . : . :: . mKIAA4 RQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHSRGYHYMLAN------LGFTDIVLERVMHGGA 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 TQSVFEYYVQDAMELVARAVATATMIQPELALLPSTMNCMDVKTTNLTSGQYLSRFLANT . . :. :.. .: . . .. . .: . : . :: : : mKIAA4 NITGFQI-VNNENPMVQQFIQR--WVRLDEREFPEAKNAPLKYISALTHDAILVIAEAFR 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 TFRGLSGSIKVKGSTIVSSENNFFIWNLQYDPMGKPMWTRLGSWQGGRIVMDSGIWPEQA .: ... .::. : :. : . . . .. . :: : ..: . mKIAA4 YLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGID-IERAL--KMVQVQG----MTGNIQFDTY 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 QRHKTHFHHPNKLHLRVVTLIEHPFVFTREV--DDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSILDSLF :. .. .... . . : : .:. . .. . ..::.: . mKIAA4 GRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSSSSENRTIVVTTILESPY 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 SSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAW--KNGHWTGL ..... . . . :::.:: ..:. . . . : ::::::::: .. :.:. mKIAA4 VMYKKNHEQLEGNERY--EGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGM 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 VGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAP-IGAFMWPLHW ::.:. : :..::. ..:. .: .::::..::.: ...:... . . : . .:. :: . mKIAA4 VGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAY 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 mKIAA1 TMWLGI-FVALHITAIFLTL-----YEWKSPFGMTPKGRNRNKVFSFSSALNVCYALLFG .:. : :. . ...... . :::. . . :. .. . . ... .: :. mKIAA4 EIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLE-DNNEEPRDPQSPPDPPNEFGIFNSLWFS 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 RTAAIK-----PPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPK : .. :. .::.. ..: .: .. .:.::::::: .. :.. . . .: mKIAA4 LGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED-- 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 LHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATP--------DGVQYLKNDP : . .. . .::. .:.... :.: ..: : : : : ::: .... mKIAA4 LAKQTE-IAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSK 690 700 710 720 730 740 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 EKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKS :. ::...... .: . : . :: . .:::.. : .: : . .. . . . mKIAA4 GKF-AFLLESTMNEY-IEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSE 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 HGFMDVLHDKW-YKVVPCG-KRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHI .:..: :..:: : :: : : . .: ..... .:.: .: :.::...... : mKIAA4 QGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMMVALIEFC 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 mKIAA1 VYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRFHRALNTSFVEEKQPCSKTKRVEKSRWRRWTCKTEG mKIAA4 YKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI 860 870 880 890 900 1031 residues in 1 query sequences 1767986 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:56:51 2006 done: Mon Mar 27 10:56:52 2006 Scan time: 1.030 Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]