FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1973.ptfa, 1031 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767986 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5154+/-0.00434; mu= 19.2347+/- 0.291
 mean_var=88.7599+/-19.954, 0's: 0 Z-trim: 1  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1361

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
mKIAA4184  ( 905 res)   mbg07034                   ( 905)  316   73 2.3e-13


>>mKIAA4184  ( 905 res)   mbg07034                        (905 aa)
 initn: 408 init1: 126 opt: 316  Z-score: 332.4  bits: 72.9 E(): 2.3e-13
Smith-Waterman score: 612;  22.525% identity (24.695% ungapped) in 808 aa overlap (70-848:91-856)

      40        50        60        70        80        90         
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                                     ::. ::  .. : .   .:: :...:  .:
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     100       110       120       130       140       150         
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         :  :    ..::    :.:   :: ...  . .:.  . .:..   . .:.: . .: 
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       .:  :   :  ..: . ..   ..:: .   .:. ::       ::.  : .. .:..  
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             .. :..  :  :.:. . .:      :..:..      :    . :  . :: .
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       . . :.  :..   .: . .     .. .   .: . :      . ::    :    :  
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        .:    ... .::.     :    :.   : . . .  .. . ::    : ..:  .  
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        :. ..     ....       .   . : :  .:. .   ..   .     ..::.: .
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          ..... .  . .    :::.::  ..:. . . . : :::::::::   ..  :.:.
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       ::.:. : :..::. ..:. .: .::::..::.: ...:...  . . : . .:. :: .
mKIAA4 VGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAY
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        .:. : :. . ...... .     :::.     . . :. ..  .  . ...  .: :.
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]