# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj03378.fasta.nr -Q ../query/mKIAA2032.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA2032, 981 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7893813 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4165+/-0.000211; mu= 4.3073+/- 0.012 mean_var=179.7243+/-34.488, 0's: 27 Z-trim: 124 B-trim: 195 in 1/67 Lambda= 0.095669 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148703297|gb|EDL35244.1| RIKEN cDNA 2810046L04, ( 891) 5779 810.6 0 gi|149064800|gb|EDM14951.1| similar to hypothetica ( 912) 5743 805.7 0 gi|149064801|gb|EDM14952.1| similar to hypothetica ( 890) 5515 774.2 0 gi|35505203|gb|AAH57544.1| 2810046L04Rik protein [ ( 702) 4580 645.1 3.6e-182 gi|30185671|gb|AAH51453.1| 2810046L04Rik protein [ ( 655) 4255 600.2 1.1e-168 gi|26332537|dbj|BAC29986.1| unnamed protein produc ( 604) 3924 554.5 5.8e-155 gi|109120528|ref|XP_001086735.1| PREDICTED: hypoth ( 860) 3083 438.5 6.5e-120 gi|109120522|ref|XP_001087439.1| PREDICTED: hypoth ( 942) 3083 438.6 7e-120 gi|109120524|ref|XP_001087318.1| PREDICTED: hypoth ( 920) 2861 407.9 1.1e-110 gi|73993310|ref|XP_543125.2| PREDICTED: similar to ( 936) 2713 387.5 1.6e-104 gi|194221845|ref|XP_001915756.1| PREDICTED: simila ( 923) 2466 353.4 3e-94 gi|119629015|gb|EAX08610.1| chromosome 13 open rea ( 922) 2393 343.3 3.2e-91 gi|19343826|gb|AAH25559.1| 2810046L04Rik protein [ ( 396) 2280 327.4 8.7e-87 gi|109120526|ref|XP_001087206.1| PREDICTED: hypoth ( 808) 2271 326.4 3.4e-86 gi|221042832|dbj|BAH13093.1| unnamed protein produ ( 883) 2225 320.1 3e-84 gi|31657155|gb|AAH53566.1| C13orf23 protein [Homo ( 781) 1405 206.9 3.2e-50 gi|26352818|dbj|BAC40039.1| unnamed protein produc ( 241) 1391 204.5 5.3e-50 gi|114651330|ref|XP_001147125.1| PREDICTED: hypoth ( 809) 1399 206.1 5.8e-50 gi|10434288|dbj|BAB14204.1| unnamed protein produc ( 639) 1353 199.6 4e-48 gi|21739335|emb|CAD38713.1| hypothetical protein [ ( 464) 1285 190.1 2.1e-45 gi|21740164|emb|CAD39095.1| hypothetical protein [ ( 294) 1191 176.9 1.2e-41 gi|74195059|dbj|BAE28278.1| unnamed protein produc ( 156) 1030 154.5 3.9e-35 gi|74149511|dbj|BAE36398.1| unnamed protein produc ( 177) 1010 151.7 2.9e-34 gi|57209279|emb|CAI40974.1| chromosome 13 open rea ( 157) 888 134.9 3.1e-29 gi|134073236|emb|CAM71958.1| proteophosphoglycan p (5967) 676 107.1 2.6e-19 gi|70905641|gb|AAZ14280.1| proteophosphoglycan ppg (7194) 667 106.0 7.1e-19 gi|134065504|emb|CAM43271.1| proteophosphoglycan p (5384) 658 104.6 1.4e-18 gi|134065503|emb|CAM43270.1| proteophosphoglycan p (4324) 639 101.9 7.2e-18 gi|70905643|gb|AAZ14282.1| proteophosphoglycan ppg (2425) 621 99.2 2.7e-17 gi|209585698|gb|ACI64383.1| predicted protein [Tha (3283) 603 96.8 1.9e-16 gi|70905642|gb|AAZ14281.1| proteophosphoglycan 5 [ (17392) 610 98.5 3.1e-16 gi|190651317|gb|EDV48572.1| GG16353 [Drosophila er ( 927) 579 93.0 7.5e-16 gi|220972438|gb|EED90770.1| predicted protein [Tha (1524) 575 92.6 1.6e-15 gi|220977246|gb|EED95573.1| predicted protein [Tha (4505) 579 93.6 2.3e-15 gi|163667088|gb|ABY33454.1| autotransporter-associ (1320) 568 91.6 2.8e-15 gi|212001255|gb|EEB06915.1| predicted protein [Sch (1678) 564 91.1 4.8e-15 gi|7300427|gb|AAF55584.1| CG7709 [Drosophila melan ( 950) 555 89.7 7.6e-15 gi|194168773|gb|EDW83674.1| GK13553 [Drosophila wi ( 779) 551 89.0 9.7e-15 gi|70905640|gb|AAZ14279.1| proteophosphoglycan ppg (1435) 549 89.0 1.8e-14 gi|194678438|ref|XP_001255603.2| PREDICTED: simila (1908) 551 89.4 1.8e-14 gi|57209281|emb|CAI40976.1| chromosome 13 open rea ( 101) 524 84.4 3e-14 gi|5305335|gb|AAD41594.1|AF071081_1 proline-rich m ( 763) 532 86.4 5.9e-14 gi|600118|emb|CAA84230.1| extensin-like protein [Z (1188) 534 86.8 6.6e-14 gi|11994733|dbj|BAB03062.1| unnamed protein produc (1480) 530 86.4 1.1e-13 gi|190626691|gb|EDV42215.1| GF17870 [Drosophila an ( 871) 524 85.3 1.4e-13 gi|41400381|gb|AAS07042.1| minus agglutinin [Chlam (3889) 530 86.8 2.3e-13 gi|156225910|gb|EDO46724.1| predicted protein [Nem (1263) 517 84.5 3.5e-13 gi|170942511|emb|CAP68163.1| unnamed protein produ (2643) 518 85.0 5.4e-13 gi|194133050|gb|EDW54618.1| GM18689 [Drosophila se ( 678) 504 82.5 7.9e-13 gi|116284392|ref|NP_002448.2| mucin 2 precursor [H (5179) 505 83.5 3e-12 >>gi|148703297|gb|EDL35244.1| RIKEN cDNA 2810046L04, iso (891 aa) initn: 5779 init1: 5779 opt: 5779 Z-score: 4319.9 bits: 810.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5816; 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