FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0882.ptfa, 1229 aa vs ./tmplib.26680 library 1767788 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4095+/-0.00435; mu= 14.1448+/- 0.290 mean_var=90.6932+/-20.421, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1347 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0676 ( 1268 res) mfj02220 (1268) 4814 946 0 mFLJ00006 ( 766 res) mbj00080 ( 766) 586 125 5.5e-29 mKIAA1055 ( 979 res) mpf00228 ( 979) 522 112 3.6e-25 mKIAA4104 ( 1065 res) mbg15134 (1065) 381 85 6.8e-17 mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266) 374 84 2e-16 mKIAA0603 ( 956 res) mfj60230 ( 956) 350 79 4.1e-15 mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 ( 841) 343 78 9.6e-15 mFLJ00332 ( 439 res) msk03045 ( 439) 339 77 1e-14 mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 ( 329) 314 72 2.4e-13 mKIAA1201 ( 753 res) mbg09862 ( 753) 212 52 4.1e-07 mKIAA0608 ( 738 res) mfj39041 ( 738) 197 49 3e-06 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:::.:::..::..: .. : :: mKIAA4 IIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLTDFEGALKFFRVQLPKRYRSEENAKRLMEL 740 750 760 770 780 790 >>mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266 aa) initn: 282 init1: 118 opt: 374 Z-score: 387.3 bits: 83.8 E(): 2e-16 Smith-Waterman score: 385; 26.437% identity (28.571% ungapped) in 348 aa overlap (438-775:859-1190) 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 ADGERPFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICM ::..: : :: .:. .. :.. mKIAA1 QILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCL-KEVTT--VWEKMLSTPGRSKIK 830 840 850 860 870 880 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 YRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYE--DLVEKSMGKYNLATEE- . ::.. : .:.:. :::.: .:. .. : :. . :. : . : .:.... mKIAA1 FDMEKVHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHPFPSKQQPKDVPYKELLK-KLTSQQH 890 900 910 920 930 940 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 -IERDLHRSLPEHPAFQNEMGIA--ALRRVLTAYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKE : :: :..: :: :. ..: . .: .: ::.. . ..::::....:...:::. .: mKIAA1 AILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSE 950 960 970 980 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