FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0380.ptfa, 653 aa vs ./tmplib.26680 library 1768364 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5885+/-0.00669; mu= -0.3902+/- 0.445 mean_var=241.4232+/-58.486, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0825 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0382 ( 1553 res) mbg03948 (1553) 791 108 9.5e-24 mFLJ00369 ( 939 res) msh02173 ( 939) 756 103 1.2e-22 mKIAA0651 ( 985 res) mbg06227 ( 985) 256 44 0.0001 mKIAA0521 ( 740 res) mbg02422 ( 740) 237 41 0.00041 mKIAA1998 ( 1366 res) mbg16805 (1366) 212 39 0.0049 mKIAA1256 ( 1539 res) mbg11030 (1539) 213 39 0.005 >>mKIAA0382 ( 1553 res) mbg03948 (1553 aa) initn: 759 init1: 592 opt: 791 Z-score: 518.7 bits: 107.5 E(): 9.5e-24 Smith-Waterman score: 801; 36.235% identity (40.498% ungapped) in 494 aa overlap (1-483:935-1387) 10 20 30 mKIAA0 QLRDLIISEMQRLTKYPLLLENIIKHTAGG ::.:.: ..:::::::::::.:: :.: mKIAA0 LEMIKSRQKKDSRFHTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEW- 910 920 930 940 950 960 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 TSEHEKLCRARDQCREILKFVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSL :.::. .: :.::.::..::.::...::..::: ::.:::.. :. . : . :...: mKIAA0 PPEREKVKKAADHCRQILNYVNQAVREAENKQRLEDYQRRLDTSNLKLSEYPNVDELRNL 970 980 990 1000 1010 1020 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 DLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLQVLLLEDLVVLLQRQEEKLLLKCHSKTAVGSSDSK ::: :::::::::.:....::..:: .:::::..::::.:...:.:.:::: ....::: mKIAA0 DLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKSIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSK 1030 1040 1050 1060 1070 1080 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 QTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSELGPPQIYELVALTSSDKNIWMELLEEAVQ .:::::.::..::.:.::::..:.:.: :. : ::::::: : :.:..:..:. . . mKIAA0 HTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGA-QIYELVAQTVSEKTVWQDLICR-MA 1090 1100 1110 1120 1130 1140 220 230 240 250 260 mKIAA0 NATKHPGDAPV-LNHPSPPGSQEPAYQGSTSSRVEVNDSEVYPTEREPKKPS-EGPGPEQ ..:. . :. : .: :: . . .. .:: .: : . . . :.: . mKIAA0 ASVKEQSTKPIPLPQP-PPCEGDNDEEEPAKLKVEHHDLSVAGLQSPDRVLGLESPLISS 1150 1160 1170 1180 1190 1200 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 RGQDKQLLAQEGPEQEEDAEELRALPCPPPSLDGENRGIRTRD---PVLLALTGPLL--- . :...: . : . ::.: . . . : ... : :: .. :: : mKIAA0 KPQSHSL---NTPGKSA-AEHLFVTATQFAKEQHANGALKEGDGGYPV--TIPGPHLPVS 1210 1220 1230 1240 1250 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 MEGLADAALEDVENLRHLILWSLLPGHTVK-TQAAGEPEDDLTPTPSVVSITSHPWDPGS : : ::... :..:.. .: : : : :: . . :. :. : : . mKIAA0 EERWALDALRNLGLLKQLLVQQL--GLTEKSTQEDWQSFSRYGPASEEVQADSGIRDLEN 1260 1270 1280 1290 1300 1310 390 400 410 420 430 mKIAA0 PGQAPAISDNTQFPRPEGSQPEGEDVALCSLAHLPPRT--RNSGIWDSPELDRNPAEEAS : . .: : :.: :. ::: .. . :: : :: mKIAA0 VKACHAREGQMSFKTGTG------DIATCD----SPRTSTESCAAQDSVIL-------AS 1320 1330 1340 1350 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 SSEPAGSYKVVRKVSLLPGGGVGAAKVAGSNVTPALPESGQSESELSEVEGGAQATGNCF .. :.. :. .. : : .. :: ::.: .:: mKIAA0 QDSQASNVLVMDHMILTP------------EMPPAEPEGGLDESGEHFFDAREAHSDDNP 1360 1370 1380 1390 1400 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 YVSMPAEPLDSSTEPPGTPPSLSQCHSLPAWPTEPPQHRGVTGGQRSSLVLRDMGVIFHT mKIAA0 SEGDGAVKKEEKDVNLRISGNCLILDGYDAVQESSTDEEVASSFPLQPVTGIPTVDSSHQ 1410 1420 1430 1440 1450 1460 >>mFLJ00369 ( 939 res) msh02173 (939 aa) initn: 741 init1: 519 opt: 756 Z-score: 499.0 bits: 103.1 E(): 1.2e-22 Smith-Waterman score: 756; 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