FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4080.ptfa, 1323 aa vs ./tmplib.26680 library 1767694 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1650+/-0.00601; mu= 11.2931+/- 0.394 mean_var=371.7399+/-93.432, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0665 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0473 ( 938 res) mbg05612 ( 938) 1639 173 3e-43 mKIAA0968 ( 487 res) mbg13747 ( 487) 234 37 0.0086 >>mKIAA0473 ( 938 res) mbg05612 (938 aa) initn: 2367 init1: 1516 opt: 1639 Z-score: 868.8 bits: 172.6 E(): 3e-43 Smith-Waterman score: 2593; 43.389% identity (49.332% ungapped) in 1021 aa overlap (341-1323:3-938) 320 330 340 350 360 370 mKIAA4 RAMLKVNPEERLSIAEVVRQLQEIAAARNVNPKAPITELLEQNGGYGNSGPSRAQPPCGG :::. ..: . . .: .: . . mKIAA0 MTNPKSGVAESAGLACSRAAAGENRMKDSENK 10 20 30 380 390 400 410 420 mKIAA4 TVNSSGVLALAEYDQPYGG-FLDILRGGTERLFTNLKD--------TSSKVIQSVANYAK ..: ... ::: ..:...::. :::.:::: :::.:::::..:.: mKIAA0 GASSP------DMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVSSYTK 40 50 60 70 80 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 GDLDISYITSRIAVMSFPAEGVESAIKNNIEDVRMFLDAKHPGHYAVYNLSPRIYRASKF ::::..:.:::: :::::...:. ...:...:.: :::..: ::.::::::. ::..:: mKIAA0 GDLDFTYVTSRIIVMSFPVDSVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKF 90 100 110 120 130 140 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 HNRVTECGWAVRRAPHLHSLYTLCRSMHAWLREDHRNVCVVHCMDGRAASAVAVCAFLCF :.::.::.: .:.:: ::.:...::.:. :: .. .:::::::.::::::.. : :.. : mKIAA0 HSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIF 150 160 170 180 190 200 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 CRLFSTAEAAVYMFSMKRCPPGIWPSHKRYIEYVCDMVAEEPITPHSKPMLVKSVVMTPV : :.:: :: .. :: :. :::.::. :.::..:..: :: ::. .:.....:: mKIAA0 CNLYSTPGPAVRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKAITVSPV 210 220 230 240 250 260 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 PLFSKQRNGCRPFCEVYVGEERVTTTSQEYDRMKEFKIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIIIY :.:.::::::::.:.: .:: .. .: ...::::....::: :::..::::::.. .: mKIAA0 PFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVIVSMY 270 280 290 300 310 320 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 HARATLGGRLQAKMASMKMFQIQFHTGFVPRNATTVKFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNL : :.:.:.:::::... ..::.:::.::.: ..:..::.: .:::::. ::::.::::.: mKIAA0 HLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHSGFIPLDTTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTL 330 340 350 360 370 380 730 740 750 760 770 780 mKIAA4 EVEVEPRDRPSREAPPWENTSLRGLNPKILFSNREEQQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYD ..::.:.:. .::::. . .::.::::...:.:: :. :. : : . mKIAA0 DIEVQPQDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSQQEHQDTLALGGQAPADLPPDHTRNL- 390 400 410 420 430 440 790 800 810 820 830 840 mKIAA4 AEAGSPEAEITESDSPQSSSTDTNHFLHTLDWQEEKEPETGLDNTSPKESQSVLIADGDG ...: :. .: ::..: ... .:....:. .. mKIAA0 GQGG---------------------FFASLCWQDQKS-----EKSRCEEDHAALV--NQE 450 460 470 850 860 870 880 890 mKIAA4 SEVSDEEEASFPSEERKPGAGE-DTPRLAA--GTKQQDLIFDVGMLAAPQEPVQPEEGVD :: ::.: .. : . : .: : :. : : :::. : : ::: :: mKIAA0 SEQSDDELLTLSSPH---GNAEGDKPHGAKKPGKKQQE----------PAAPPPPEE-VD 480 490 500 510 520 900 910 920 930 940 mKIAA4 LLGLHSEGDLRPAAPLQACGVPSSNTDLLSCLLE------PSDAAQVG------PPGDLL ::::.. .:. .. ... ..: ::..::: :. :..:.:.: : : . mKIAA0 LLGLEG-SDV--STNFSSLAAPPSNSELLSDLFGGVGATGPAQAGQAGVEDVFHPSGPVS 530 540 550 560 570 580 950 960 970 980 990 1000 mKIAA4 GGEAPLLLASPVSPLGLQNNLQGKVPDTVDPFDQFLLSSNSDTQPCSKPDLFGEFLNSDS . .: :. .: .: : ::: .. ..: .. ::.: :::..: mKIAA0 AQSTPRRTATSASASPTLRVGEGA---TFDPF-------GAPAKPPGQ-DLLGSFLNTSS 590 600 610 620 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA4 VASSTAFPSTHSAPPPSCSTAFLHLGDLPAEPSKVIASSSHPDLLGGWDTWADTATPGPA ::: : . .: :. .: .. :: . .::. :::: . . : . mKIAA0 -ASSDPFLQPTRSPSPT-----VHASSTPA-------VNIQPDIAGGWDWHTKPGGFGMG 630 640 650 660 670 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA4 SIPVPEGTLFSSAGHPAPPGPNPSQTKSQNLDPFADLSDL-SSSLQG---LPAGLPAGGF : . . :: : :. :.: :.:::::::. : :::. . :.:: .::: mKIAA0 SKSAATSPTGSSHGTPT------HQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGL-GGGF 680 690 700 710 720 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA4 VGAPAPTQKSNSPWQANRPTAPGTSWTP-QAKP---APRASEQLRSH----FSVIGA-RE .: . : .: .. : .: :.:: :..: : : . ::.. : . mKIAA0 PPLSSPQKASPQPMGGGWQQPAGYNWQQTQSKPQSSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPAGQS 730 740 750 760 770 780 1180 1190 1200 1210 1220 1230 mKIAA4 ERGVRVPSFAQKPKVSENDFEDLLPNQGFS-KSDKKGPKTMAEMRKQELARDTDPLKLKL ::: .. : :.. :::::: .:::. ..:::::.:.:::::.:.:.. :: :::. mKIAA0 ERGKGSTNLEGKQKAA--DFEDLLSSQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKI 790 800 810 820 830 840 1240 1250 1260 1270 1280 1290 mKIAA4 LDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVSMADLVTPEQVKKQYRRAVLVVHPDKAT :.:::::::::::::::.::::: ::..: ::.:::::::::::: :::::::::::::: mKIAA0 LEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRRAVLVVHPDKAT 850 860 870 880 890 900 1300 1310 1320 mKIAA4 GQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF ::::::::::::::::::::::::::..::. mKIAA0 GQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY 910 920 930 >>mKIAA0968 ( 487 res) mbg13747 (487 aa) initn: 211 init1: 75 opt: 234 Z-score: 142.5 bits: 37.2 E(): 0.0086 Smith-Waterman score: 303; 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