FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1296.ptfa, 1304 aa vs ./tmplib.26680 library 1767713 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1334+/-0.00553; mu= 5.3964+/- 0.365 mean_var=260.8508+/-62.677, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0794 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0777 ( 1134 res) mbg09833 (1134) 996 128 7.8e-30 mFLJ00204 ( 618 res) msp00191 ( 618) 247 42 0.00036 mKIAA1494 ( 914 res) mpm09319 ( 914) 237 41 0.001 >>mKIAA0777 ( 1134 res) mbg09833 (1134 aa) initn: 1320 init1: 360 opt: 996 Z-score: 627.9 bits: 128.3 E(): 7.8e-30 Smith-Waterman score: 1693; 34.905% identity (42.930% ungapped) in 1209 aa overlap (228-1302:18-1134) 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 TSPGRASERRAKDASRRVVRSAQDLSDVSTDEVGIP--LRNT-ERSKDWYKTMFKQIHKL :: ::: .:.: .: :::::::::::: . mKIAA0 KRVTVIKAPHYPGIGPVDESGIPTAIRTTVDRPKDWYKTMFKQIHMV 10 20 30 40 260 270 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