FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0291.ptfa, 993 aa vs ./tmplib.26680 library 1768024 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1085+/-0.00797; mu= 4.6654+/- 0.527 mean_var=351.2011+/-84.568, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 140 in 1/35 Lambda= 0.0684 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 680 82 5.6e-16 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 382 53 4e-07 mKIAA0635 ( 1125 res) mia28019 (1125) 311 46 4.7e-05 mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174) 296 44 0.00013 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 277 43 0.00063 mKIAA0480 ( 1937 res) mef00473 (1937) 265 41 0.0015 mKIAA1398 ( 804 res) mph00305 ( 804) 254 40 0.0019 mKIAA0639 ( 810 res) mbg16237 ( 810) 252 40 0.0022 mKIAA1052 ( 1172 res) mfj00977 (1172) 247 39 0.0039 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 245 39 0.0059 mFLJ00238 ( 1452 res) mfj01101 (1452) 241 39 0.0065 >>mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319 aa) initn: 1809 init1: 492 opt: 680 Z-score: 379.3 bits: 82.1 E(): 5.6e-16 Smith-Waterman score: 1719; 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