FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0903.ptfa, 1242 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767775 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2650+/-0.00814; mu= -12.4657+/- 0.536
 mean_var=369.2144+/-89.535, 0's: 0 Z-trim: 11  B-trim: 2 in 1/35
 Lambda= 0.0667

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
mFLJ00043  ( 431 res)   msk06005                   ( 431)  688   81 5.8e-16
mKIAA1668  ( 883 res)   mpf01101                   ( 883)  382   52 7.3e-07
mKIAA0819  ( 468 res)   mfj12040                   ( 468)  364   50 1.5e-06
mKIAA0376  ( 1135 res)   mbg00975                  (1135)  338   47 1.7e-05
mKIAA1364  ( 776 res)   mbg16438                   ( 776)  330   46 2.1e-05
mKIAA0750  ( 1106 res)   mbp09208                  (1106)  321   46 5.1e-05
mFLJ00139  ( 992 res)   mbp09110                   ( 992)  309   45  0.0001
mKIAA4061  ( 1011 res)   mbg07137                  (1011)  290   43 0.00038
mKIAA4049  ( 1290 res)   mbg01111                  (1290)  291   43 0.00042


>>mFLJ00043  ( 431 res)   msk06005                        (431 aa)
 initn: 912 init1: 665 opt: 688  Z-score: 379.0  bits: 80.7 E(): 5.8e-16
Smith-Waterman score: 688;  62.431% identity (64.943% ungapped) in 181 aa overlap (1068-1241:250-430)

      1040      1050      1060      1070          1080      1090   
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                                     . .::  :..    :.:::::: .:: :::
mFLJ00 EGPNPASSPDANPLPAPVPQQPPGGPPPTEESSPSLGEEAGLQRFQDTSQYVCAELQALE
     220       230       240       250       260       270         

          1100      1110      1120      1130      1140      1150   
mKIAA0 NEQKQIDTRAALVEKRLRYLMDTGRNTEEEEAMMQEWFMLVNKKNALIRRMNQLSLLEKE
       .:: ::: ::: :::.:: ::..: :  .::...:::: :::::::::::..::.:: .:
mFLJ00 QEQGQIDGRAAEVEKQLRSLMESGANRLQEEVLIQEWFTLVNKKNALIRRQDQLQLLIEE
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          1160      1170      1180      1190      1200      1210   
mKIAA0 HDLERRYELLNRELRAMLAIEDWQKTEAQKRREQLLLDELVALVDKRDALVRDLDAQEKQ
       .:::::.:::.::::::::::.:::: ::..::::::.:::.::..:: :::::: .:. 
mFLJ00 QDLERRFELLSRELRAMLAIEEWQKTVAQQHREQLLLEELVSLVNQRDELVRDLDQKERI
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          1220      1230         1240  
mKIAA0 AEEEDEHLERTLEQNKGKMAK---KEEKCALQ
       : ::::.::: ::: . :...   ..:.:.:.
mFLJ00 ALEEDERLERGLEQRRRKVSRQLSRRERCTLS
     400       410       420       430 

>>mKIAA1668  ( 883 res)   mpf01101                        (883 aa)
 initn: 582 init1: 251 opt: 382  Z-score: 215.5  bits: 51.5 E(): 7.3e-07
Smith-Waterman score: 579;  24.480% identity (28.267% ungapped) in 866 aa overlap (454-1227:1-842)

           430       440       450        460          470         
mKIAA0 APPALTPKTGVNENTVVSAGKDLSTSPKPSPIPSP-VLGQKPNASQ---SLLAWCREVTK
                                     :::::  :   :  .    .::::::.  .
mKIAA1                               PIPSPGRLRAGPAMAGPRGALLAWCRRQCE
                                             10        20        30

     480       490       500       510       520       530         
mKIAA0 NYRGVKITNFTTSWRNGLSFCAILHHFRPDLIDYKSLNPQDIKENNKKAYD-GFASIGIS
       .:::: : ....:.:.::.::::::. ::::.:..::. ... :::. :.. .   .:: 
mKIAA1 GYRGVDIRDLSSSFRDGLAFCAILHRHRPDLLDFQSLSKENVFENNRLAFEVAEKELGIP
               40        50        60        70        80        90

      540       550       560         570       580       590      
mKIAA0 RLLEPSDMVLLAIPDKLTVMTYLYQIRAHF--SGQELNVVQIEENSSKSTYKVGNYETDT
        ::.:.::: ...:: :..:::. :   ::  :::   ..    . .:.    .   :. 
mKIAA1 ALLDPNDMVSMSVPDCLSIMTYVSQYYNHFTSSGQ---AAASPPKPGKDPAPPSPTSTSP
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mKIAA0 NSSVDQEKFYAELS-DLKREPEPHQPARGAVDLLSQDDSVFVTDSGVGESESEHQ-----
         .  .:    .:: :   :   .::  .:    .:   : ...  ..:..  :.     
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       150       160       170       180         190       200     

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mKIAA0 -------TPDDHLSPSTASPYY-----------RRTKSDTEPQKSQQ---SSARTSGSDD
              .: .. :    . .             :. .    :. ::   . :. . ..:
mKIAA1 RQCSSTLVPGSYSSGPEEGTFVCAERCTRLGPGSRSGTRLLSQQRQQPAAAEAKDAEDND
         210       220       230       240       250       260     

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mKIAA0 PGLS----SSTDSAQALASLG-----KKRLKAENLELSDLCVSDKKKDVSPLSAYEQKL-
       :.::    . .:  :: . .      :  : ..  ::..      .   .: .: :..  
mKIAA1 PSLSVAAVAEADRLQASSEVQFHTPTKPPLPSKPQELAS--PPGGRPTPAPRKASESSAL
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mKIAA0 --QTVHASSDMEQ-GKMEKSRS---LECRLDGELAITKPNVSSPSKLGYNRDTDFTKKPC
          : .  :...: : .:.: :   .. ::. :  . ::  ..: ::.    .     : 
mKIAA1 TPPTPRPRSSLQQDGTVEQSVSSGLVNGRLQ-EPPVPKPR-GTP-KLSERMAAPRKDPPW
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mKIAA0 ASLRQIESDPDADKNTLNHADHP-NKAVQHRMLSRQEELKERARVLLEQARRDAAFKVGS
        .: : :       .  . .  : ..: ..   .  ::  ...     . .    :.   
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            860       870       880       890       900         910
mKIAA0 KHGGSAAPALCSRQLNDQQDEERRRQLRERARQLIAEARCGVKMSELPSYG--EMAAEKL
       .. :  :: . : .:                    .::   .  :  : ::    .. : 
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mKIAA0 KERSKASGDENDNIEIDTN---EEIPEGFVVGGGDELTNIESDLDNPEQNSKVVDLRLKK
       :.:    .   . . : ..   .  : . . . .  . .. :. ..   :.. ..     
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mKIAA0 LLEAQPQV---------ANLLPSAAQKAVTEASEQGEKSG--VEDLRTERL--QKATERF
          ..: :         .: .  .:..... ..: :. ::  . ..::.     ..:. :
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mKIAA0 RN----PVVFNKDST------VRKTQLQSFSQYVENRPEMKRQRSIQEDTKRGTEEKAEI
        .    : ..  : .        . :::  :.  ::  . : . : .  ....:.    .
mKIAA1 SGATPTPFLLAGDRNPAPPVGSASPQLQIKSSCKENPFNRKPSPSASPTVRKATKGAKPV
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            .:    .::       ...::.      ::.  .: .   ..  ..:.:..::  
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          : :   :. :. .:: :...:. :.:: ..:  . :...::.:   .. ::: .:  
mKIAA1 --GGANEGSEDDMLVDWFKLIHEKHLLVRRESELIYVFKQQNLEQRQADVEFELRCLLNK
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         .::  :. .. ::..:..::..:...:::.:  :: .... ::::. ::  ....   
mKIAA1 PEKDW--TDEDRAREKVLMQELMTLIEQRDAIVNCLDEDRQREEEEDKMLETMIKKKDFQ
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            1240                            
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mKIAA1 REAESDSKKKGKFKTIKVLKFLGNKREAKSKAPGDKS
        850       860       870       880   

>>mKIAA0819  ( 468 res)   mfj12040                        (468 aa)
 initn: 334 init1: 261 opt: 364  Z-score: 209.9  bits: 49.6 E(): 1.5e-06
Smith-Waterman score: 365;  24.520% identity (28.117% ungapped) in 469 aa overlap (782-1225:25-458)

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mKIAA0 KMEKSRSLECRLDGELAITKPNVSSPSKLGYNRDTDFTKKPCASLRQIESDPDADKNTLN
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mKIAA0       VEDTYDDKTEDSSLQEKFFTPPSCWSRSEKLQAKENGRLPPLEQDVPPQKRGL-
                     10        20        30        40        50    

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mKIAA0 HADHPNKAVQHRMLSRQEELKERARVLLEQARRDAAFKVGSKHGGSAAPALCSRQLNDQQ
           :  ... . :. .:... : . .  :: :::  :  :.   .:   . ::. . :.
mKIAA0 ----PLVSAEAKELA-EERMRAREKSVKSQALRDAMAKQLSRM--QAMEMVSSRSHTAQS
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                 ....:      : . .. ::        ::.  .:...:  .   :..  
mKIAA0 ----------QGKEL------GSESTRHPSLRGTQEPTLKH--EATSEEILSPPSDSGG-
                  110             120       130         140        

               940       950       960            970       980    
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        :.: :..  :..  .. .:.: .:..:.:    .      .:   . :. .   :..  
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       :.:  . .. .:             ::.     . :.  . .:  ..:  . :..:: . 
mKIAA0 KSVFSGYKKDKKKKSDEKSCSSTPSSGATVDSGQRRASPMVRAELQLRRQLSFSEDSDLS
        210       220       230       240       250       260      

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       . . :.  ::  . .:.   .. ..    : ... :     .:. ...:      .: . 
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        .:  .:..:.:.. :.. ::: ::   ..: . ...  .::::: ::..:::..:  ..
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mKIAA0 LSLLEKEHDLERRYELLNRELRAMLAIEDWQKTEAQKRREQLLLDELVALVDKRDALVRD
       : .. .: .:: :   :..:::  .:.::  :::..  .:. .:.:.. .:..::.::  
mKIAA0 LMIFARELELEDRQSRLQQELRERMAVEDHLKTEGELSEEKKILNEMLEVVEQRDSLVAL
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mKIAA0 LDAQEKQAEEEDEHLERTLEQNKGKMAKKEEKCALQ
       :. :. . .:::. :: ..                 
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                                     :: .. ::   . :... ...:::..    
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             .:.    : :  :    :  :. : . ... :. :       : .:.:   :: 
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mKIAA0 Y--LNPFDEPETFVMIKDSPP---QSTRRKNLRPVDMSKYLYADSSKSEEELDESNPFYE
          ..:...      :. : :    : .:.:   . ....:   :: :.       : .:
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          :     :.  .  : .: ..    : :: :   .  .:    . .: ..:. .:  :
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         ..   .:  : .     :.: ::   :: ::.. :..:... ::::..:: .::.:::
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       .:: . :  : :. :: :: :.:   :...  :.::.  :. ..:.    ::  .:: :.
mKIAA0 LLHTYLPAHIPYQELNSQDKKRNFTLAFQAAESVGIKSTLDINEMARTERPDWQNVMLYV
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         :  .:                                                     
mKIAA0 TAIYKYFET                                                   
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>>mKIAA1364  ( 776 res)   mbg16438                        (776 aa)
 initn: 321 init1: 258 opt: 330  Z-score: 189.2  bits: 46.5 E(): 2.1e-05
Smith-Waterman score: 330;  39.496% identity (40.517% ungapped) in 119 aa overlap (453-568:507-625)

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       : ::..:..: ::..::..:::.:..::::::. ::. :....::. :.: .   .::: 
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mKIAA0 LLEPSDMVLLAIPDKLTVMTYLYQIRAHFSGQELNVVQIEENSSKSTYKVGNYETDTNSS
       ..  ..:. .. ::::... :: :.   :.                              
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>>mKIAA0750  ( 1106 res)   mbp09208                       (1106 aa)
 initn: 324 init1: 261 opt: 321  Z-score: 182.5  bits: 45.7 E(): 5.1e-05
Smith-Waterman score: 321;  29.839% identity (33.333% ungapped) in 248 aa overlap (463-696:522-757)

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       ::.::..:::.: :::.::.. ::: .:  :::. :.: .   .::  .   ..:.    
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mKIAA0 PDKLTVMTYLYQIRAHFSGQELNVVQ-----IEENSS---KSTYKVGNYETDT-----NS
       ::::... :: ..   : :  :  ..       ::..    .:.  .:: . :     . 
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        :: .    ...  .:.   :      .. : . .:  . .:    .::  :.   :.. 
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       .  . . . :..   :.  .:.  :.::   : : :..                      
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>>mFLJ00139  ( 992 res)   mbp09110                        (992 aa)
 initn: 522 init1: 204 opt: 309  Z-score: 176.8  bits: 44.5 E(): 0.0001
Smith-Waterman score: 315;  35.870% identity (41.250% ungapped) in 184 aa overlap (481-661:1-163)

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mKIAA0 IDYKSLNPQDIKENNKKAYD-GFASIGISRLLEPSDMVLLAIPDKLTVMTYLYQIRAHFS
       :....:  ..: :::: :.. .  ..::  ::.  ::: : .::.:...::. :   .: 
mFLJ00 INFSALRKENIYENNKLAFQVAEEQLGIPALLDAEDMVALKVPDRLSILTYVSQYYNYFH
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       :.    ... :.. :: :: .... .               ::.  . : : :  :. . 
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mKIAA0 FKPLSKKVVSATLQFSLSCIFLREG--KATDEDMQSLASLMSMKQADIGNLDDF------
        . . : . .   :..:::  ::.   ::. : .. ..::..  . : . : .       
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       :...:  .: .. . .    .::           .. . ..  :::..: ::.   ..: 
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mKIAA0 D--VTELNPFGDPDSE-EPITETTSPKKPEES-----FYNNSCNPF---KGVQTPQYLNP
       .  .   . .:: ... .:..:   :.. . .      : :  .:    ... . . .. 
mKIAA4 EKNARLQKELGDIQGHSRPVNEEPEPSEADAAGRWRGVYVNRTSPAPSDSATTVKSLIKS
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