FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0835.ptfa, 1129 aa vs ./tmplib.26680 library 1767888 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0182+/-0.00807; mu= -6.2750+/- 0.535 mean_var=366.0961+/-86.010, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0670 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0535 ( 1049 res) mbg03667 (1049) 1929 201 6e-52 mKIAA1106 ( 1211 res) mbg00011 (1211) 1904 199 3.5e-51 mKIAA1835 ( 646 res) mph00586 ( 646) 249 39 0.0035 >>mKIAA0535 ( 1049 res) mbg03667 (1049 aa) initn: 1879 init1: 673 opt: 1929 Z-score: 1025.0 bits: 201.4 E(): 6e-52 Smith-Waterman score: 2584; 42.771% identity (50.357% ungapped) in 1155 aa overlap (40-1129:4-1049) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 FRGKLLTQRWTQEDKTSSCRTERHFLCRYNKMSSESDDKRARTRSKTLRGPPETTGADLS ::..: .:: .: :: . : .. .: mKIAA0 LLEKMDAEVEDKTLHTLSKGTEVPMDSLIPELR 10 20 30 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 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