FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4149.ptfa, 906 aa vs ./tmplib.26680 library 1768111 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4556+/-0.00614; mu= 11.6717+/- 0.411 mean_var=180.6195+/-41.363, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0954 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0854 ( 719 res) mbh04022 ( 719) 822 126 1.8e-29 mKIAA0395 ( 198 res) mbg08208 ( 198) 273 50 4.7e-07 mKIAA1443 ( 564 res) mpg01109 ( 564) 270 50 1.2e-06 >>mKIAA0854 ( 719 res) mbh04022 (719 aa) initn: 1382 init1: 405 opt: 822 Z-score: 621.4 bits: 125.9 E(): 1.8e-29 Smith-Waterman score: 1472; 38.021% identity (43.647% ungapped) in 768 aa overlap (144-891:2-690) 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 DLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTKRYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNN ::.::.::.:: :.:::: :::: ..:::: mKIAA0 TTKKYDSLSDHNSKFHPGETNFKLKLIKRNN 10 20 30 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 QTIFEQTINDLTFDGSFVKEENTEQGESIDVSSSGISISKTPIMKMMKNKVENKRITVHH ::..::.:. . : . : : : .. :.:..:::. : : :.. :.. . mKIAA0 QTVLEQSIEATNH---VVPITASGPGSS-D-NDPGVSVGKTPMTKTGKLKADAKKVPKKP 40 50 60 70 80 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 NSAEGTSEEKENGVKASQEENAESVSSSALESNTSTSTINRVHPSPASTVVTPTAVLPGL . :.. :.. .:. :. :...: : . .... .. : : mKIAA0 D--EAAPENHMEGT-------ARLVTDTA-EILARLGSVELLQDS--------------L 90 100 110 120 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 AQVITAVSAQQNSNLLPKVLIPVNSIPTYNAALDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQ ..:. .:. : ::.::: .:.:. ::.:::.: ..:..:::::::..:.. :.: mKIAA0 GHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAA 130 140 150 160 170 180 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 AKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEARRKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNG .:. ::.:.:::..::::::.::.::::::::.:.::::...:: ::::.:.... . . mKIAA0 SKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLTPTKVS 190 200 210 220 230 240 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 LPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPVTAPIALTVAGVPNQTNVQKSQVPAAQPA : :::: :::.:::.::::::.. .: .::.:.:::: :. . . .: : : mKIAA0 QP-ILQTALPCQILGQPSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPE 250 260 270 280 290 300 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 TDTKPATAAVPSSPSVRPEAALVNPDSFGIRAKKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRL .: : :: : :..: .: . . :::: :.:.::.:.:..::: :.:. :: mKIAA0 PK-RPHIAQVPEPP---PKVA-NTPLTPASDRKKTKLQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRL 310 320 330 340 350 540 550 560 570 580 mKIAA4 MKITGLTKGEIKKWFSDTRYN-QRNSKSNQCLHLNNDSSATIIIDSSDETPEPPAAAASQ ...:::...:::::::: :: ::. .:....: : .:. : .... mKIAA0 IEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IVHITSESLA------KDQM----AITGTR 360 370 380 390 400 590 600 610 620 630 640 mKIAA4 QKQSWNPFPDFAPQKFKEKTAEQLRALQASFLNSSVLTDEEVNRLRAQTKLTRREIDAWF . .... .:::::::::::. ::..:. :::.:: :. ::.:::..:::.:::::.:: mKIAA0 HGRTYHVYPDFAPQKFKEKSQGQLKTLEDSFLKSSFPTQAEVERLRVETKLSRREIDSWF 410 420 430 440 450 460 650 660 670 680 690 700 mKIAA4 TEKNKTKALKDEKI--EVDESNVGSSKEEP-GESSPGDETVAPKSGGT----GKICKKTP .:. : . .. . . .. ::. : : : :. . . .:. .. .. mKIAA0 SERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKKGSDAVAPNGALSRLDQLSGAQLAGSLPSPSSAIVQNQ 470 480 490 500 510 520 710 720 730 740 750 760 mKIAA4 EQLHMLKSAFVRTQWPSAEEYDKLAEESGLARTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKWYYYYQSS ::.:.:.:.:.:::::. .:::.:: ..::.::.:: :: ..: :.:.:.: :: mKIAA0 EQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTLSWLEQYQRH 530 540 550 560 570 580 770 780 790 800 810 820 mKIAA4 NSSSLNGLSSLRRRGRGRPKGRGRGRPRGRPRGGKRMNTWDRVPSLIKFKTGTAILKDYY . :. ::: . .:.. . : :.:. ..: mKIAA0 HMSD------------------DRGRDAVSRKVAKQVA---ESP-----KNGSEAAHQYA 590 600 610 830 840 850 860 870 mKIAA4 LKHKFLNEQDLDELVNRSHMGYEQVREWFA--------ERQRRSELGIELFEENEEEDEV : :.:.: ..:: : ..: . ... .: .:.. :. : . ::::: . mKIAA0 KDPKALSEEDSEKLVPRMKVGGDPTKDCLAGKPSEATSDRSEGSRDG-QGSEENEESG-I 620 630 640 650 660 670 880 890 900 mKIAA4 VDDQEEDEEETDD-SDTWEPPRHVKRKLSKSDD :: : : : :. : mKIAA0 VDFVEVTVGEEDAISEKWGSWSRRVAEGTVERADSDSDSTPAEAGQA 680 690 700 710 >>mKIAA0395 ( 198 res) mbg08208 (198 aa) initn: 386 init1: 262 opt: 273 Z-score: 219.0 bits: 49.6 E(): 4.7e-07 Smith-Waterman score: 352; 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