FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1465.ptfa, 785 aa vs ./tmplib.26680 library 1768232 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9087+/-0.00667; mu= 3.4903+/- 0.442 mean_var=235.6636+/-56.142, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0835 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 377 59 4.5e-09 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 371 58 6.9e-09 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 353 56 3.3e-08 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 340 54 5.4e-08 mKIAA0405 ( 637 res) mbg12039 ( 637) 323 52 2.2e-07 mKIAA1246 ( 833 res) mbj01002 ( 833) 323 52 2.6e-07 mKIAA4208 ( 721 res) mbe00555 ( 721) 289 48 4.1e-06 mKIAA1469 ( 663 res) mbj00677 ( 663) 262 45 3.7e-05 mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 ( 528) 251 43 8e-05 mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 ( 839) 238 42 0.00032 mKIAA1497 ( 721 res) mid15001 ( 721) 230 41 0.00057 mKIAA1851 ( 705 res) mpg00887 ( 705) 224 40 0.00093 mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 ( 760) 221 40 0.0012 >>mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593 aa) initn: 800 init1: 334 opt: 377 Z-score: 255.3 bits: 59.1 E(): 4.5e-09 Smith-Waterman score: 410; 27.599% identity (29.389% ungapped) in 279 aa overlap (59-329:569-838) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 HHTASQRAAGVTMGPFGALCLAWALLGVVRACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEG :::: : : .::. ..: ..:. mKIAA4 RIGQIKSKKFRCSGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRC----EGTTVDCSNQRLNKIPDH 540 550 560 570 580 590 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 LPANVTTLSLSANKITVLR-RGAFVNVTQVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLS .: .. : :. :..:::. : : .. :. .. ...... .: ::. : .... :. mKIAA4 IPQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLT 600 610 620 630 640 650 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 HNLISNFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTF : . : . ...: .:. : . ::.. . :.. .: ..: : . .:.. :. ::.: mKIAA4 SNRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRISCVGNDSFIGLGSVRLLSLYDNQITTVAPGAF 660 670 680 690 700 710 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 DALSALSHLQLYHNPFHCSCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHR--L :.: .:: :.: :::.:.: :.:: : :. .: : .: :. .:.. . mKIAA4 DSLHSLSTLNLLANPFNCNCHLAWLGEWLRRKRIVTGNPR---CQKPYFLKEIPIQDVAI 720 730 740 750 760 770 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 PALPCAPPSVRLSAEPPPEAPGTPLRAGLAFMLHCVAEG-----HPTPRLQWQLQIPGGT . : . : : . :. . : ...: .: . :. .: . :. mKIAA4 QDFTCDDGNDDNSCSPLSRCPSEC--TCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPKDVTELYLDGNQ 780 790 800 810 820 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 VVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEGDGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGS .::: ::. mKIAA4 FTLVPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLK 830 840 850 860 870 880 >>mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431 aa) initn: 363 init1: 306 opt: 371 Z-score: 252.0 bits: 58.3 E(): 6.9e-09 Smith-Waterman score: 371; 27.124% identity (28.720% ungapped) in 306 aa overlap (78-374:1-298) 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 CLAWALLGVVRACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEG-LPANVTTLSLSANKITVL : .. :. :. :: . :.: :.: . mKIAA0 ARRQKRQCRESSLPRTQQHLDLRFNRIREI 10 20 30 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 RRGAFVNVTQVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDLRNLSALQ . ::: . ....: : ..... . .::. : .:: : : .: :... . ...:..:. mKIAA0 QPGAFRRLRSLNTLLLNNNQIKKIPNGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLE 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 LLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTFDALSALSHLQLYHNPFHCS : .. :.. .: ... :: :. : ..:::. : ::::. : ....:.: : .::. mKIAA0 QLYLHFNQIETLDPESFQHLPKLERLFLHNNRITHLIPGTFSQLESMKRLRLDSNALHCD 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 CGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRL-PA-LPCAPPSVRLSAEPPPE : ..:: . : . .: : ..:: : . : : : : :...:: mKIAA0 CEILWLADLLKTYAQSGNAQAAATCEYPRRIQGRSVATITPEELNCERP--RITSEPQD- 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 APGTPLRAGLAFMLHCVAEGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEGD . . .: . .. : :::.: :.. : :. . . . :. .:: ... . . mKIAA0 ---ADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIW-LRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQ-E 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 mKIAA1 GDEDL------PTQTEAPTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGSLLVPLLSAKEAGIYTCRA .:: . . :: : . . . :: : :. mKIAA0 ADEGVYQCMAKNVAGEAKTQEVTLRYLGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSATGHP 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 HNELGTNSTSLRVTVAAAGPPKHAPGTGEEPDAQVPTSERKATTKGRSNSVLPFKPEGKT mKIAA0 LPQITWTRGDRTPLPIDPRVNITPSGGLYIQNVAQSDSGEYTCFASNSVDSIHATAFIIV 330 340 350 360 370 380 >>mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557 aa) initn: 487 init1: 300 opt: 353 Z-score: 239.8 bits: 56.2 E(): 3.3e-08 Smith-Waterman score: 425; 27.957% identity (29.771% ungapped) in 279 aa overlap (59-329:538-807) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 HHTASQRAAGVTMGPFGALCLAWALLGVVRACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEG :::. : : . ..:. .: ..:: mKIAA0 SKKFRCSAKEQYFIPGTEDYHLNSECTSDVACPHKCRC----EASVVECSSLKLSKIPER 510 520 530 540 550 560 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 LPANVTTLSLSANKITVLR-RGAFVNVTQVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLS .: ..: : :. :.:..:. : : ..... .. :....: .:.:.. .....: :. mKIAA0 IPQSTTELRLNNNEISILEATGLFKKLSHLKKINLSNNKVSEIEDGTFEGAASVSELHLT 570 580 590 600 610 620 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 HNLISNFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTF : . .. . .:.:..:. : . .::.. . :.. .: ..: : . .:.. :. ::.: mKIAA0 ANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNHITTISPGAF 630 640 650 660 670 680 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 DALSALSHLQLYHNPFHCSCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHR--L :.:.::: :.: :::.:.: : :: : . .. .: : .: :. .:.. . mKIAA0 DTLQALSTLNLLANPFNCNCHLSWLGDWLRKRKIVTGNPR---CQNPDFLRQIPLQDVAF 690 700 710 720 730 740 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 PALPCAPPSVRLSAEPPPEAPGTPLRAGLAFMLHCV-----AEGHPTPRLQWQLQIPGGT : . : . ... : :. : : : ...: : . :. .: . :. mKIAA0 PDFRCEEGQEEVGCLPRPQCPQEC--ACLDTVVRCSNKHLQALPKGIPKNVTELYLDGNQ 750 760 770 780 790 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 VVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEGDGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGS .::: :: mKIAA0 FTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLR 800 810 820 830 840 850 >>mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 (640 aa) initn: 487 init1: 259 opt: 340 Z-score: 235.9 bits: 54.2 E(): 5.4e-08 Smith-Waterman score: 345; 25.708% identity (31.467% ungapped) in 459 aa overlap (27-418:9-450) 10 20 30 40 50 mKIAA1 AGRAREATDARSSLRLSPESGDRLAAPQHHTASQRAAGVTMGPFGALCLAWALL---GVV ::. . : . . :. .. :: :: :.: mKIAA1 MLNKMTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLV 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 RA--CPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRGAFVNVT :: :: :.: ..... . :. :.:::::.:. .:. :.: :.: ... ..: .. mKIAA1 RAQTCPSVCSCSNQFSKVI--CVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 QVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRL .. : :.....::.: ::. :..:..:.: : ....: . . :: :. : . .: . mKIAA1 HLEILQLSRNHIRTIEIGAFNGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYLSKLKELWLRNNPI 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 mKIAA1 GSLPRDALGALPDLRSLRINN-NRLRTLEPGTFDALSALSHLQLYH---------NPF-- :.: :.. .:.:: : ... .:: . :.:..:: : .:.: .:. mKIAA1 ESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCNLREIPNLTPLIK 170 180 190 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 ---------HCSC-------GLVWLQA-WAASTRVSLPEPDS---------IACASP--- : : ::. :: : ...... : .. : : mKIAA1 LDELDLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLAHNNLT 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 mKIAA1 --PELQGVPVHRLPAL-----P--CAPPSVRLSAEPPPEAPGTPLRAGLAFMLHCVAEGH :. .:.:.: . : : . :: ::.. : :. . mKIAA1 LLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILWLSWWIRDMAPSNTA---------CCARCN 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 PTPRLQWQL--QIPGGTVVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEGDGDEDLPTQTEAPTPTPAPA : :. . .. . . ::. : .: .. :: . : . .: : . . mKIAA1 TPPNLKGRYIGELDQNYFTCYAPVIV--EPPAD-LNVTEGMAAE---LKCRASTSLTSVS 340 350 360 370 380 370 380 390 400 410 mKIAA1 WPAPPATP--------RFLALANGSLLVPLLSAKEAGIYTCRAHNELG--TNSTSLRVTV : .: .: :. .:..:.: ......:.::: . : .: : :..: ::. mKIAA1 WITPNGTVMTHGAYKVRIAVLSDGTLNFTNVTVQDTGMYTCMVSNSVGNTTASATLNVTA 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 AAAGPPKHAPGTGEEPDAQVPTSERKATTKGRSNSVLPFKPEGKTKGQGLARVSVLGEIE :.. : mKIAA1 ATTTPFSYFSTVTVETMEPSQDEARTTDNNVGPTPVIDWETTNVTTSLTPQSTRSTEKTF 450 460 470 480 490 500 >>mKIAA0405 ( 637 res) mbg12039 (637 aa) initn: 284 init1: 180 opt: 323 Z-score: 224.9 bits: 52.1 E(): 2.2e-07 Smith-Waterman score: 323; 27.559% identity (28.807% ungapped) in 254 aa overlap (82-327:148-398) 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 ALLGVVRACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRGAF : :: :::... : .. :.:.:. :: mKIAA0 DDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAF 120 130 140 150 160 170 120 130 140 150 160 mKIAA1 VNVTQVTSLWLAHSEV--RTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDLRNLSALQLLK :.:.. : . . . . . :... :..::.... .: .:. : :: . ..: mKIAA0 QNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPP-PDLPGTHLIRLY- 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 MNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTFDALSALSHLQLYHNPFHCSCGL .. :... .: :.. : :. : :.::.:: : :.:: :: :..: .::. :.:.. mKIAA0 LQDNQINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDHLSNLKQLTARNNPWFCDCSI 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 VWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRLPA--LPCAPPSVRLSAEPPPEAPG :. : :: . .. : .: ...:. :..: : : . : . : . mKIAA0 KWVTEWLKYIPSSL-NVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPVFTPAPSTV 300 310 320 330 340 350 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 TPLRAGLAFMLHCVAEGH--PTPRLQWQLQIP--GGTVVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEG .: . .. . ..: :.: . :: : ..::. mKIAA0 SPTTQSPTLSVPSPSRGSVPPAPTPSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSI 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 DGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGSLLVPLLSAKEAGIYTCRAHNELG mKIAA0 QVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLD 420 430 440 450 460 470 >>mKIAA1246 ( 833 res) mbj01002 (833 aa) initn: 467 init1: 194 opt: 323 Z-score: 223.5 bits: 52.3 E(): 2.6e-07 Smith-Waterman score: 323; 25.670% identity (28.325% ungapped) in 448 aa overlap (18-448:28-450) 10 20 30 40 mKIAA1 AGRAREATDARSSLRLSPESGD-RLAAPQHHTASQRAAGVTMGPFGALCL : .: ::: :. :... . .: . :. . mKIAA1 REPVSGQEGCVAEPRSPGALRSRPWSLPATGRCRLAQVQR--LSDQTMETLLGGLLAFGM 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 AWALLGVVRACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRG :.: :: :::. :.: . . : : : :: . .. : :..: : . : mKIAA1 AFA---VVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHIGRQ 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 AFVNVTQVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDLRNLSALQLLK :.:.: ...: :... . .. .. : .:..: :. : . .. . ::.: :: : mKIAA1 DFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 MNHNRLGSLPRDAL-GALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTFDALSALSHLQLYHNPF-HCSC .:.:.::.. ::. : :..: .. : :. : . . : .:.: :: . : . mKIAA1 VNNNQLGGIADDAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAE 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 G-LVWLQAWA----ASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRLPALPCAPP-SVRLSAEP : .. :: : .:.:.. :: : : : : : : ::: : ....: mKIAA1 GTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASL-------LTATPFAPPLSFSFGGNP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 -PPEAPGTPLR--AGLAFMLHCVAEGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLVPPVLSKEEDGGDKV . :: . : . : : :... : ::..... :. mKIAA1 LHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGSLKGRYFWHIREE--EFVCEPPLITQHTH---KL 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 EDGEGDGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPP-----ATPRFLALANGSLLVPLLSAKEAGI ::.. : .. :.: : :: . : . ::.: . . .....: mKIAA1 LVLEGQA-ATLKCKA-IGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDILITTSQDSGP 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 YTCRAHNELGTNSTSLRVTVAAAGPPKHAPGTGEEPDAQVPTSERKATTKGRSNSVLPFK .:: : : : .....:... . : .. . ..: . : . : :.. mKIAA1 FTCIAANAAGEATATVEVSIV------QLPHLSNSTSRMAPPKSRLSDITGSSKTSRGGG 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 PEGKTKGQGLARVSVLGEIEAELEETDEGEQMEGQIPADPMGEKHCDHGDPSRYVSNHAF mKIAA1 GSGAGEPPKSTPERAVLVSDVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIP 460 470 480 490 500 510 >>mKIAA4208 ( 721 res) mbe00555 (721 aa) initn: 502 init1: 175 opt: 289 Z-score: 202.1 bits: 48.1 E(): 4.1e-06 Smith-Waterman score: 308; 27.350% identity (30.769% ungapped) in 234 aa overlap (92-312:102-322) 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 EPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRGAFVNVTQVTSLW :. .: :..:..: . : ..... : mKIAA4 DFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFSGLSNLHHLI 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 LAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRD : .... . : :. . :..::::.: . ..::. .... .:. :...:: . ..:. mKIAA4 LNNNQLTLISSTAFDDVFALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLDHNMIDNIPKG 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 mKIAA1 ALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGT-FDALSALSH----------LQLYHNPFHCSCGLV ... : . : ...:.:. : : :. ..:. :.. ::.::.: :. mKIAA4 TFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGGNPLHCNCELL 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 mKIAA1 WLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRLPA--LPCAPPSVRLSAEPPPEAPGT ::. :.: : : .:::: : : .: . : :: . .. : mKIAA4 WLR------RLSR-EDDLETCASPALLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVLEGQ 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 PLRAGLAFMLHCVAEGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEGDGDED :: :.: :.: : : ..: mKIAA4 --RA----TLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFT 310 320 330 340 350 >>mKIAA1469 ( 663 res) mbj00677 (663 aa) initn: 242 init1: 135 opt: 262 Z-score: 184.9 bits: 44.8 E(): 3.7e-05 Smith-Waterman score: 262; 26.512% identity (28.500% ungapped) in 215 aa overlap (82-288:180-387) 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 ALLGVVRACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRGAF : .: ::: .. : :. :.:... .. mKIAA1 DDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPGGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSL 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 mKIAA1 VNVTQVTSLWLAHSEVRTVESG--ALAVLSQLKNLDLSHNLIS----NFPWSDLRNLSAL ..:.. : : . . . : .. : .: .:.: .: .. :.: ..::.: mKIAA1 HGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTSLRKL--- 210 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 QLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTFDALSALSHLQLYHNPFHC :. :: .. .: .:.. : .: : ..:: : .: : :: :. ...: : .::..: mKIAA1 -YLQDNH--INRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYC 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 SCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRLPA--LPCAPPSVRLSAEPPP .: . :.. : : :.. . .. : .: ...:. .. : : . : .. . . mKIAA1 GCKMKWVRDWLQSLPVKV-NVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLSAELFDCKDSGIVSTIQITT 330 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 EAPGTPLRAGLAFMLHCVAEGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEG :.: mKIAA1 AIPNTAYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLIKDQRTTGSPSRKTILITVKSVTPDTIHISWR 390 400 410 420 430 440 >>mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 (528 aa) initn: 538 init1: 207 opt: 251 Z-score: 178.9 bits: 43.4 E(): 8e-05 Smith-Waterman score: 251; 32.367% identity (35.079% ungapped) in 207 aa overlap (27-221:2-204) 10 20 30 40 50 mKIAA1 AGRAREATDARSSLRLSPESGDRLAAPQHHTASQ--RAAGVTMG-PFGALCLA--WALLG :. ..::. : :. . :.:: :: .:. mKIAA0 QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSV 10 20 30 60 70 80 90 100 mKIAA1 VVR-------ACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRR :.. ::: : : .: : . .. ::.. . ::: :.::.:.: mKIAA0 VLKMLPALGMACPPKCRC-EKLLFY---CDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITALER 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 GAFVNVTQVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDLRNLSALQLL :.. .:.: : : :... ::. :. : .::.: :: : : .: . . .: :: : mKIAA0 DQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNL 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 KMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTFDALSALSHLQLYHNPFHCSCG .. :.:.:: . . .: :..:.. .: :::. : .: :.: : mKIAA0 DLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLAR 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 LVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRLPALPCAPPSVRLSAEPPPEAPGT mKIAA0 NGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMDWTWSTLEKL 220 230 240 250 260 270 >>mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 (839 aa) initn: 222 init1: 161 opt: 238 Z-score: 168.1 bits: 42.0 E(): 0.00032 Smith-Waterman score: 284; 22.830% identity (25.448% ungapped) in 311 aa overlap (16-295:210-519) 10 20 30 40 mKIAA1 AGRAREATDARSSLRLSPESGDRLAA-PQ-HHTASQRAAGVTMGP :.: .: : :. . :. : . . .. mKIAA0 TPLSTTGYLHTTPASVNSVATSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSRQPSKDLGYSN 180 190 200 210 220 230 50 60 70 80 90 mKIAA1 FGALCLAWALLGVVRACPEPCACVDKYAHQ--FADCAYKELREVPEGLPA--NVTTLSLS .: . : :: :.: . . ..: .... . : : : . :. mKIAA0 YGPSIAYQTKSPVPLECPTACTCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLT 240 250 260 270 280 290 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 ANKITVLRRGAFVNVTQVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDL : :::.:: :...: . : :..... ... :.. :..:. : :. : : . . mKIAA0 ENYITVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLGNLRRLYLNGNRIERLSPELF 300 310 320 330 340 350 160 170 180 190 200 mKIAA1 RNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTF------------ .:..:: : ...: . . .. .:.:. : .:::.:... :.: mKIAA0 YGLQSLQYLFLQYNLIREIQAGTFDPVPNLQLLFLNNNQLQAMPSGVFSGLTLLRLNLRG 360 370 380 390 400 410 210 220 230 240 250 mKIAA1 ------------DALSALSHLQLYHNPFHCSCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPP : :..: ...:. ::. :.: .: .. : . .:.. : . : .: mKIAA0 NSFTSLPVSGVLDQLTSLIQIDLHDNPWDCTCDVVGMKLWIEQLKVGV-LVDEVICKAPK 420 430 440 450 460 470 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 ELQGVPVHRLPA-LPCAPPSVRLSAEPPPEAPGTPLRAGLAFMLHCVAEGHPTPRLQWQL .. . .. . . : : : . . : : . .: :.. : mKIAA0 KFAETYMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPSRTNAATPAVRLNSTGTPAGLGAGT 480 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 QIPGGTVVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEGDGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPPATPRFL mKIAA0 GASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSV 540 550 560 570 580 590 785 residues in 1 query sequences 1768232 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:45:50 2006 done: Mon Mar 27 10:45:52 2006 Scan time: 0.910 Display time: 0.270 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]