FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4245.ptfa, 606 aa vs ./tmplib.26680 library 1768411 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1662+/-0.00633; mu= -3.4149+/- 0.416 mean_var=238.7095+/-58.661, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.0830 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00316 ( 641 res) mph01644 ( 641) 2267 285 1.4e-77 mKIAA4246 ( 602 res) msj08227 ( 602) 1697 217 4.6e-57 >>mFLJ00316 ( 641 res) mph01644 (641 aa) initn: 2263 init1: 1692 opt: 2267 Z-score: 1485.3 bits: 285.0 E(): 1.4e-77 Smith-Waterman score: 2267; 65.000% identity (65.242% ungapped) in 540 aa overlap (39-576:61-600) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 HRDSGQDFSASGSSGYCWMVPYREVLFDELFGGTESRFPLGSTVQSQTKGIWMWCMPHPT ..: . : ::.::.:.::::::::.:::. mFLJ00 INILERITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNRLAGQNHGFNLGTTVRSETKGIWMWCVPHPS 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 KPEHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDLWIFALSVLLSSTFVYNSMNTINHQALEQLHYVTE ::. ::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::.::::::::::::::: mFLJ00 KPKFTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTE 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 mKIAA4 LTELIRAKSSPNPHGIKNSTEFVSFFPDFVWTVRDFMLELKLNGEDITSDEYLENALKLI ::: :::::. . . .: :::::::::.::::::.:::::.:. ::.::::::::::: mFLJ00 LTERIRAKSTSRSEEVDDSDEFVSFFPDFIWTVRDFVLELKLEGRVITADEYLENALKLI 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 240 mKIAA4 PGNNPRIQASNSARECIRRFFPNRKCFVFEWPTHDIELIKQLETISEDQLDPTFKESAMA :: . . : .: :::::.::: ::::::. ::.: ::. ..: . ::::: .:. .. mFLJ00 PGMSIKAQKANLPRECIRHFFPRRKCFVFDRPTKDKELLVHVEEMPEDQLDHSFQVQSKE 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 FASYIFTYAKIKTLREGIKVTGNGLGTLVTTYVDAINSGAVPCLDDAVTTLAQRENSVAV : ::::. .: :::.::: :.:: :.::::::::::::: ::::..:::::::::::.:: mFLJ00 FCSYIFSNSKAKTLKEGIVVNGNRLATLVTTYVDAINSGDVPCLENAVTTLAQRENSIAV 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 QKAASHYSEQMAQRLSLPTDTIQELLDVHAACEKEAMAVFMEHSFKDENQQFLKKLVELL ::::.:::::::::. :::::.:::: ::.::::::.::::::::::::::: :.:: . mFLJ00 QKAADHYSEQMAQRMRLPTDTLQELLTVHTACEKEAIAVFMEHSFKDENQQFQKNLVVTI 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 mKIAA4 REKNGLFLLKNEEASDKYCQEELDRLSKDLMDNIS--TFSVPGGHRLYMDMREKIEHDYW .::. :: .:: :: ..:: :::.::..: ..:: .::::::::::.. :.:.:.:: mFLJ00 EEKKEDFLRQNEAASLSHCQAELDKLSESLRESISRGVFSVPGGHRLYLEARKKVEQDYE 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 QVPRKGVKASEVFQNFLQSQAIIESSILQADTALTAGQKAIAEKHTKKEAAEKEQDLLRQ .::::::::..:.:.::::: ::.::.:.: ::: ::::. ....::::::::.:::: mFLJ00 RVPRKGVKANHVLQSFLQSQISIEDSIMQSDKALTDGQKAMEAERAQKEAAEKEQELLRQ 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 KQKEHQEYMEAQEKRNKENLEQLRRKLEQEREQLIKDHNMMLEKLTKEQKTFREEGYKTQ :::: :. :::::. :::. ::..:.: ::......... ::. : :: . .::.: . mFLJ00 KQKELQQVMEAQERSYKENVAQLHEKMETERKNILREQEVKLEHKLKIQKDMLNEGFKRK 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 AEELRREIHQLGHNIKEMKQNGDSLVESILRSWFSFISPPSESEKAISSVLSLLRKKDRL : . :: :: ..:. :....:: .:: mFLJ00 CEAMDLEISQLQKEIQLNKEKNSSLGAKILDGFGDVLISVVPGSGKYFGLGLKILSSQMN 580 590 600 610 620 630 >>mKIAA4246 ( 602 res) msj08227 (602 aa) initn: 1759 init1: 820 opt: 1697 Z-score: 1116.7 bits: 216.7 E(): 4.6e-57 Smith-Waterman score: 1697; 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