FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4209.ptfa, 1417 aa vs ./tmplib.26680 library 1767600 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7096+/-0.00587; mu= 9.7362+/- 0.389 mean_var=160.8945+/-39.366, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 43 in 1/35 Lambda= 0.1011 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1488 ( 425 res) mpk03351 ( 425) 724 118 3.2e-27 mKIAA1517 ( 937 res) mbp07073 ( 937) 700 115 6.2e-26 mKIAA0577 ( 1048 res) mbg07362a (1048) 646 107 1.6e-23 mKIAA0890 ( 1057 res) mbg06494 (1057) 633 105 5.9e-23 mKIAA0134 ( 1167 res) mbh02208 (1167) 624 104 1.6e-22 mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264) 613 103 5e-22 mKIAA0224 ( 1224 res) mpg04132 (1224) 513 88 1.2e-17 >>mKIAA1488 ( 425 res) mpk03351 (425 aa) initn: 951 init1: 373 opt: 724 Z-score: 581.1 bits: 118.3 E(): 3.2e-27 Smith-Waterman score: 725; 39.818% identity (41.720% ungapped) in 329 aa overlap (447-772:88-404) 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 HISEFLYGKALEFAKTSEPVVYSLITLLEEESEIVKLLTHTQHKYSVPPVNVPPVPSETR : .::.::. .: : . ::.. mKIAA1 IGLWYAKKQTQKNKEAERQERAVVHMDERREEQIVQLLNSVQAKTDKD--------SEAQ 60 70 80 90 100 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 ISKPAYRKPVVPSNTFLSNQMLEGERLSELEEDADEDEGPASIIVENESYVNLKKRSYKR :: : . ... :.. ...:. . .: .. .. . ..::.. . . mKIAA1 ISWFAPEDHGYGTEVS-SEKKINSEKKLDNQEKKLLNQEKKTFRITDKSYIDRDTEYLLQ 110 120 130 140 150 160 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 YDRPAKSLFAENSKICRQFQMKQASRQFHAILQERQLLPAWEERETILKLLSKHQVVVIS ..: :: .... ...: :... .. . . :. ::.. .. ...:...:::.::: mKIAA1 ENEPNLSL---DQHLLEDLQRKKTDPRYIEMQRFRKKLPSYGMQKELVNLINNHQVTVIS 170 180 190 200 210 220 600 610 620 630 640 650 mKIAA4 GMTGCGKTTQIPQFILDNSLNGPPERVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGL--T : ::::::::. :::::: .. . :.::::::::::::::::: :::: : . mKIAA1 GETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVATERAESCGNGNS 230 240 250 260 270 280 660 670 680 690 700 710 mKIAA4 VGYQIRLES-VKSSATRLLYCTTGVLLRRLEGDATLQGVTHIIVDEVHERTEESDFLLLV .::::::.: . . .::::::..:. :..:. :..:.::..::.:::. .:: :. : mKIAA1 TGYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDSRLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTV 290 300 310 320 330 340 720 730 740 750 760 770 mKIAA4 LKDIVMQRATLQVILMSATLDAGLFSKYFSYCPVITIPGRAFPVDQFFLEDALAVTRYVL .::.. :. :.::::::::.: ::.::. ::.: ::: .::: ...::: . ::: mKIAA1 IKDLLHFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDIIEKIRYVP 350 360 370 380 390 400 780 790 800 810 820 830 mKIAA4 QDGSPYMRSMKQIAKEKLKARHNRTAQEEVEEDLRLSLHLQDEEESVKDTIPDQQLDFKQ mKIAA1 DQKEHRSQFKRGFMQGHVNR 410 420 >>mKIAA1517 ( 937 res) mbp07073 (937 aa) initn: 682 init1: 303 opt: 700 Z-score: 558.0 bits: 115.2 E(): 6.2e-26 Smith-Waterman score: 781; 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