# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj00063.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0714.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0714, 1770 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7918242 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1514+/-0.000187; mu= 15.8399+/- 0.010 mean_var=73.3136+/-14.578, 0's: 32 Z-trim: 45 B-trim: 1179 in 1/66 Lambda= 0.149790 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|62906842|sp|Q6A009.2|ZN294_MOUSE RecName: Full= (1767) 11637 2525.4 0 gi|124486727|ref|NP_001074537.1| ring finger prote (1767) 11614 2520.5 0 gi|109492780|ref|XP_001055727.1| PREDICTED: simila (1798) 10926 2371.8 0 gi|198041681|ref|NP_001019406.2| zinc finger prote (1767) 10911 2368.5 0 gi|114684319|ref|XP_514851.2| PREDICTED: zinc fing (1812) 10145 2203.0 0 gi|160113245|sp|O94822.5|ZN294_HUMAN RecName: Full (1766) 10102 2193.7 0 gi|187954961|gb|AAI40791.1| Zinc finger protein 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