FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0655.ptfa, 1083 aa vs ./tmplib.26680 library 1767934 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8704+/-0.0082; mu= 5.0972+/- 0.543 mean_var=334.3962+/-82.955, 0's: 0 Z-trim: 27 B-trim: 77 in 2/34 Lambda= 0.0701 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4113 ( 618 res) mpf00134 ( 618) 1484 165 3.8e-41 mKIAA1027 ( 2564 res) mia05043 (2564) 381 54 3.3e-07 mKIAA0320 ( 1471 res) mbg01292 (1471) 298 45 8.2e-05 mKIAA0445 ( 1598 res) mbg06476 (1598) 251 41 0.0023 mKIAA1656 ( 660 res) mfj12037 ( 660) 224 37 0.0094 >>mKIAA4113 ( 618 res) mpf00134 (618 aa) initn: 1606 init1: 1293 opt: 1484 Z-score: 831.1 bits: 164.7 E(): 3.8e-41 Smith-Waterman score: 1752; 48.823% identity (51.405% ungapped) in 637 aa overlap (406-1039:1-608) 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 REVETLRAELEKIKMEAQRYISQLKGQVNGLEAELEEQRKQKQKALVDNEQLRHELAQLK ::::: ::.. ..:. : : :: :: .:: mKIAA4 LEAELAEQQHLGRQAMDDCEFLRTELDELK 10 20 30 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 ALQLEGARNQGLREEAERKASATEARYSKLKEKHSELINTHAELLRKNADTAKQLTVTQQ . . . : : ::::.:.: ::::::::.:::...::.::::::...::..:..: mKIAA4 RQREDTEKAQRSLTEIERKAQANEQRYSKLKEKYSELVQNHADLLRKNAEVTKQVSVARQ 40 50 60 70 80 90 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 SQEEVARVKEQLAFQMEQAKRESEMKMEEQSDQLEKLKRELAARAGELARAQEALSRTEQ .: .. : :..:: .: . .::.: ::.::.:::. :: . : . : mKIAA4 AQVDLEREKKELA--------DSFARTQEQQDVLENLKHELATSRQELQVLHSNLETSAQ 100 110 120 130 140 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 SGSELSSRLDTLNAEKEALSGVVRQREAELLAAQSLVREKEEALSQEQQRSSQEKGELRG : .. ... :. :. .:. :. ::: :: : .:.. : :.: : : : mKIAA4 SEAKWLTQIAELEKEQGSLATVAAQREEEL----SALRDQLE--------STQIK--LAG 150 160 170 180 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 QLAEKESQEQGLRQKLLDEQLAVLRSAAAEAEAILQDAVSKLDDPLHLRCTSSPDYLVSR .::. . :.. :.. ..: . :: .:.:.:.:..: . :..: :.:.:. mKIAA4 ------AQES-MCQQVKDQRKTLLAGIRKAAEREIQEALSQLEEPTLISCAGSTDHLLSK 190 200 210 220 230 240 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 AQAALDSVSGLEQGHTQYLASSEDASALVAALTRFSHLAADTIVNGAATSHLAPTDPADR .... . . ::.. .:::: :: : :. ..: ..::..:::..:.::: :: .::: mKIAA4 VSSVSSCLEQLEKNGSQYLACPEDISELLHSITLLAHLTGDTIIQGSATSLRAPPEPADS 250 260 270 280 290 300 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 LMDTCRECGARALELVGQLQDQTVLPRAQPSLMRAPLQGILQLGQDLKPKSLDVRQEELG : ..::. : ..: ...:... .. :. . .: :. . ::..: :..::..::::: mKIAA4 LTEACRQYGRETLAYLSSLEEEGTMENADVTALRNCLSRVKTLGEELLPRGLDIKQEELG 310 320 330 340 350 360 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 AMVDKEMAATSAAIEDAVRRIEDMMSQARHESSGVKLEVNERILNSCTDLMKAIRLLVMT .::::::::::::: :. :::...:..: ..:::::::::::.:::.::.::..::.. mKIAA4 DLVDKEMAATSAAIEAATTRIEEILSKSRAGDTGVKLEVNERILGSCTSLMQAIKVLVVA 370 380 390 400 410 420 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 STSLQKEIVESGRGAATQQEFYAKNSRWTEGLISASKAVGWGATQLVESADKVVLHMGKY : .:::::::::::.:. .::::::::::::::::::::::::: .:..:: :: ::. mKIAA4 SKDLQKEIVESGRGTASPKEFYAKNSRWTEGLISASKAVGWGATIMVDAADLVVQGKGKF 430 440 450 460 470 480 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 EELIVCSHEIAASTAQLVAASKVKANKNSPHLSRLQECSRTVNERAANVVASTKSGQEQI :::.:::.:::::::::::::::::::.: .:..::. :: ::. .: ::::: ::. :: mKIAA4 EELMVCSREIAASTAQLVAASKVKANKGSLNLTQLQQASRGVNQATAAVVASTISGKSQI 490 500 510 520 530 540 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 EDRDTMDFSGLSLIKLKKQEMETQVRVLELEKTLEAERVRLGELRKQHYVLAG---GMGT :. :.::::...: ..:.:::..::::::::. :. :: .::::::.:: ::: : mKIAA4 EETDSMDFSSMTLTQIKRQEMDSQVRVLELENDLQKERQKLGELRKKHYELAGVAEGWEE 550 560 570 580 590 600 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA0 PSEEEPSRPSPAPRSGATKKPPLAQKPSIAPRTDNQLDKKDGVYPAQLVNY .: :: mKIAA4 GTEASPSTVQEAIPDKE 610 >>mKIAA1027 ( 2564 res) mia05043 (2564 aa) initn: 304 init1: 220 opt: 381 Z-score: 221.8 bits: 54.0 E(): 3.3e-07 Smith-Waterman score: 436; 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