# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj00047.fasta.nr -Q ../query/mKIAA4189.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA4189, 953 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920587 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3707+/-0.000187; mu= 12.5324+/- 0.010 mean_var=80.4210+/-15.440, 0's: 34 Z-trim: 39 B-trim: 29 in 1/64 Lambda= 0.143018 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|187465936|emb|CAQ52309.1| novel protein (111002 ( 947) 6259 1301.9 0 gi|187954699|gb|AAI41037.1| 1110028C15Rik protein ( 947) 6254 1300.8 0 gi|170172568|ref|NP_808313.3| hypothetical protein ( 947) 6235 1296.9 0 gi|109486120|ref|XP_346059.3| PREDICTED: similar t ( 947) 5952 1238.5 0 gi|116496621|gb|AAI26156.1| C2orf67 protein [Homo ( 945) 4988 1039.6 0 gi|187465938|emb|CAQ52311.1| novel protein (111002 ( 700) 4444 927.3 0 gi|172045940|sp|Q5DTI6.2|CB067_MOUSE RecName: Full ( 991) 4444 927.4 0 gi|109487266|ref|XP_001053548.1| PREDICTED: simila ( 989) 4290 895.6 0 gi|126337886|ref|XP_001364597.1| PREDICTED: simila ( 956) 4273 892.1 0 gi|57110981|ref|XP_536052.1| PREDICTED: hypothetic ( 989) 3785 791.4 0 gi|149710093|ref|XP_001488377.1| PREDICTED: simila ( 984) 3737 781.5 0 gi|23958782|gb|AAH32837.1| C2orf67 protein [Homo s ( 705) 3673 768.2 0 gi|172044070|sp|A0AUZ9.2|CB067_HUMAN RecName: Full ( 987) 3669 767.5 0 gi|114583040|ref|XP_001144710.1| PREDICTED: simila ( 705) 3664 766.3 0 gi|114583036|ref|XP_516062.2| PREDICTED: hypotheti ( 987) 3660 765.6 0 gi|16552439|dbj|BAB71308.1| unnamed protein produc ( 705) 3655 764.5 0 gi|114583046|ref|XP_001144925.1| PREDICTED: simila ( 682) 3517 736.0 1.4e-209 gi|119590882|gb|EAW70476.1| hypothetical protein F ( 641) 3500 732.5 1.6e-208 gi|149016012|gb|EDL75293.1| similar to CG4699-PA, ( 836) 3442 720.6 7.6e-205 gi|62822331|gb|AAY14880.1| unknown [Homo sapiens] ( 585) 3288 688.7 2.1e-195 gi|126337884|ref|XP_001364525.1| PREDICTED: simila (1002) 3148 660.0 1.6e-186 gi|194664878|ref|XP_599530.4| PREDICTED: similar t ( 862) 2902 609.2 2.7e-171 gi|148667824|gb|EDL00241.1| mCG144005, isoform CRA ( 417) 2702 567.7 4.1e-159 gi|148667823|gb|EDL00240.1| mCG144005, isoform CRA ( 837) 2701 567.7 8.1e-159 gi|26349145|dbj|BAC38212.1| unnamed protein produc ( 417) 2690 565.2 2.3e-158 gi|170172570|ref|NP_001116210.1| hypothetical prot ( 956) 2692 565.9 3.2e-158 gi|109100856|ref|XP_001102366.1| PREDICTED: simila ( 859) 2458 517.6 1e-143 gi|74221358|dbj|BAE42157.1| unnamed protein produc ( 368) 2375 500.2 7.6e-139 gi|118093284|ref|XP_421860.2| PREDICTED: hypotheti ( 915) 2052 433.8 1.8e-118 gi|47682880|gb|AAH70141.1| C2orf67 protein [Homo s ( 342) 1839 389.5 1.4e-105 gi|187465937|emb|CAQ52310.1| novel protein (111002 ( 646) 1815 384.8 7.1e-104 gi|26350071|dbj|BAC38675.1| unnamed protein produc ( 530) 1804 382.5 2.9e-103 gi|224056000|ref|XP_002193004.1| PREDICTED: hypoth ( 987) 1691 359.4 5e-96 gi|6453472|emb|CAB61379.1| hypothetical protein [H ( 401) 1333 285.2 4.3e-74 gi|119590883|gb|EAW70477.1| hypothetical protein F ( 440) 1271 272.4 3.3e-70 gi|18677048|dbj|BAB85085.1| unnamed protein produc ( 439) 1253 268.7 4.3e-69 gi|149575489|ref|XP_001519641.1| PREDICTED: simila ( 385) 940 204.1 1.1e-49 gi|119590881|gb|EAW70475.1| hypothetical protein F ( 269) 770 168.9 2.9e-39 gi|119590884|gb|EAW70478.1| hypothetical protein F ( 258) 763 167.4 7.7e-39 gi|73965128|ref|XP_860200.1| PREDICTED: similar to (1040) 699 154.7 2.1e-34 gi|149411331|ref|XP_001508220.1| PREDICTED: hypoth ( 565) 683 151.2 1.3e-33 gi|109492041|ref|XP_001081571.1| PREDICTED: simila (1037) 681 151.0 2.8e-33 gi|123885702|sp|Q0IHW6.1|CB067_XENTR Uncharacteriz ( 903) 678 150.3 3.8e-33 gi|159570759|emb|CAP19564.1| novel protein [Danio ( 615) 453 103.8 2.7e-19 gi|189523662|ref|XP_689876.3| PREDICTED: hypotheti ( 828) 453 103.9 3.4e-19 gi|73965124|ref|XP_537608.2| PREDICTED: similar to (1104) 415 96.1 9.7e-17 gi|149723404|ref|XP_001501617.1| PREDICTED: simila (1103) 410 95.1 2e-16 gi|224086185|ref|XP_002191385.1| PREDICTED: hypoth (1093) 404 93.8 4.6e-16 gi|158255954|dbj|BAF83948.1| unnamed protein produ (1104) 402 93.4 6.2e-16 gi|55645673|ref|XP_511576.1| PREDICTED: hypothetic (1105) 402 93.4 6.2e-16 >>gi|187465936|emb|CAQ52309.1| novel protein (1110028C15 (947 aa) initn: 6259 init1: 6259 opt: 6259 Z-score: 6974.4 bits: 1301.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 6259; 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