FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1230.ptfa, 990 aa vs ./tmplib.26680 library 1768027 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6632+/-0.00737; mu= -0.5085+/- 0.487 mean_var=290.3031+/-72.298, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 24 in 1/35 Lambda= 0.0753 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1026 ( 808 res) mfj07295 ( 808) 552 74 8.3e-14 mKIAA4112 ( 1261 res) mfj10349 (1261) 382 56 4e-08 mKIAA0897 ( 1140 res) meh02302 (1140) 381 56 4e-08 mKIAA1167 ( 459 res) mfj45274 ( 459) 212 37 0.0075 >>mKIAA1026 ( 808 res) mfj07295 (808 aa) initn: 608 init1: 324 opt: 552 Z-score: 340.2 bits: 74.1 E(): 8.3e-14 Smith-Waterman score: 576; 26.998% identity (31.349% ungapped) in 663 aa overlap (213-853:119-711) 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 MAEISNLKLKLTAVEKDRLDYEDRFRDTEGLIQEINDLRLKVNEMDGERLQYEKKLKSTK : .:.. :: ...:: .. :. . : .. mKIAA1 AAVTVADSAVATMENHQHGAQVLLREEVVQLQEEVHLLR-QMKEMLAKDLEESQGGKCSE 90 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 DELAS-LKEQLEEKECEVKRLQERLVCKAKGEGIEVLDRDENIKKKLK-EKNIEVQKMKK :. :. :: .:: :. : .: : ... : .:.:: ::. :..:.. mKIAA1 VLSATELRVQLVQKEQELARAKEAL---------QAMKAD---RKRLKGEKTDLVSQMQQ 150 160 170 180 190 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 AVESLMAANEEKERKIEDLRQCLSRYRKMQDPAVLAQGQDSECEGLFHSSSISTLLDAQG :.:. : .:....:. . ..:: .. :: : ..... ::. . mKIAA1 ----LYATLESREEQLRDFIRNYEQHRKESEDAVKALAKEKD------------LLEREK 200 210 220 230 370 380 390 400 410 mKIAA1 FSDLERSTSSTPGMGSPSRDP--LHTSAPEEFHTSVLQASIPSLLPPSVDVETCEKPKLP . .:.:... . .. :. :. . .:... . .:. :: . :: .. .: mKIAA1 W-ELRRQAKEATDHAAALRSQLDLKDNRMKELEAELAMAK-QSLATLTKDVPKRHSLAMP 240 250 260 270 280 290 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 TKPETSFEEGDGRAILGAAAE-VSLSDGVSTSSLQKSSSLGNLKKEASDGTDKAPTDSRT :...:.. : : .: :.....:.. mKIAA1 -----------GETVLNGNQEWVVQADLPLTAAIRQSQQT-------------------L 300 310 320 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 FGTLPPKVPGHEASVDDNPFGTRKARSSFGRGFFKIKSGKRTASAPNLAETEKETAEHLN . . ::. ... : .: .:. : .. . . : :... .. ...: : mKIAA1 YHSHPPHPADRQVRV--SPCHSRQP-SVISDA--SAAEGDRSSTPSDINSPRHRT--HSL 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 LAGTSRSKGSQGT-SPFPMSPPSPDSRKKSRGIMRL-FGKLRR-----SQSTTFNPDDMS : : . ... .:. .: . ...:... .. ::.. : .: ...: .. mKIAA1 CNGDSPGPVQKSLHNPIVQSLEDLEDQKRKKKKEKMGFGSISRVFARGKQRKSLDPGLFD 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 mKIAA1 EPEFKRGGTRATAGPRLGWSRDLGQSNSDL--DMPFAKWTKEQVCSWL-AEQGLGSYLSS . . . . :: . . : . .. .: :...: : .:: . ... :... mKIAA1 DSDSQCSPTRHSLSLSEGEEQMDRLQHVELVRTTPMSHWKAGTVQAWLEVVMAMPMYVKA 450 460 470 480 490 500 650 660 670 680 690 700 mKIAA1 GKHWIISGQTLLQASQQDLEKELGIKHSLHRKKLQLALQ----ALGSEEETNYGKLDFNW . . ::..::. :..::: ::. ::::.::.::.. : ... .. . :: .: mKIAA1 CAENVKSGKVLLSLSDEDLELGLGVCSSLHRRKLRLAIEDYRDAEAGRSLSKAADLDHHW 510 520 530 540 550 560 710 720 730 740 750 760 mKIAA1 VTR-WLDDIGLPQYKTQFDEGRVDGRMLHYMTVDDLLS-LKVVSVLHHLSIKRAIQVLRI :.. ::.:::: ::. :.. ::::::. . :: . :.: . .:..:: .:..: mKIAA1 VAKAWLNDIGLSQYSQAFQNHLVDGRMLNSLMKRDLEKHLNVSKKFHQVSILLGIELLYQ 570 580 590 600 610 620 770 780 790 800 810 820 mKIAA1 NNFEPNCLR-RRPSDENSITPSEVQQWTNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLMVL :: . :. :: :.. : : :::.::..:.:..:: ::: :: .:::::...:: mKIAA1 VNFSREALQERRARCETQNTDPVV--WTNQRVLKWVRDIDLKEYADNLTNSGVHGAVLVL 630 640 650 660 670 830 840 850 860 870 880 mKIAA1 EPRFNVETMAQLLNIPPNKTLLRRHLATHFNLLIGAEAQHQKRDAMELPDYVLLTATAKV :: ::.:.:: :.:: .: .:::::: ... .. mKIAA1 EPTFNAEAMATALGIPSGKHILRRHLAEEMSTIFHPSNSTGIRESERFGTPPGRASSITR 680 690 700 710 720 730 890 900 910 920 930 940 mKIAA1 KPKKLTFSNFGNLRKKKHEDGEEYVCPMELGQASGSSQKGFRPGLDMRLYEEDDLDRLEQ mKIAA1 AGREDSGGNSKHRAGRLPLGKIGRGFSSKEPDFHDDYGSLENEDCGDEDLQGRPEQCRLE 740 750 760 770 780 790 >>mKIAA4112 ( 1261 res) mfj10349 (1261 aa) initn: 571 init1: 251 opt: 382 Z-score: 238.2 bits: 55.9 E(): 4e-08 Smith-Waterman score: 609; 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