FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4018.ptfa, 606 aa vs ./tmplib.26680 library 1768411 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5847+/-0.00469; mu= 11.6730+/- 0.314 mean_var=108.6149+/-26.150, 0's: 0 Z-trim: 26 B-trim: 122 in 2/34 Lambda= 0.1231 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 2107 385 2.1e-107 mKIAA1365 ( 1497 res) mbg05137 (1497) 1251 233 1.1e-61 mKIAA1225 ( 1401 res) mbg04842 (1401) 1241 232 3.5e-61 mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 ( 584) 524 104 4e-23 mKIAA0231 ( 815 res) mbp00073 ( 815) 409 84 7.1e-17 mKIAA1437 ( 811 res) mfj00342 ( 811) 386 80 1.2e-15 mKIAA0606 ( 1318 res) mbg00108 (1318) 374 78 7.3e-15 mFLJ00248 ( 491 res) mfj21306 ( 491) 297 64 4.8e-11 mKIAA1016 ( 777 res) mpg00620 ( 777) 280 61 5.4e-10 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 224 51 4.6e-07 mKIAA1790 ( 1898 res) mpf00986 (1898) 217 50 2.3e-06 mKIAA1497 ( 721 res) mid15001 ( 721) 211 48 2.5e-06 mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 208 48 6.2e-06 mKIAA1246 ( 833 res) mbj01002 ( 833) 198 46 1.4e-05 mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 ( 837) 198 46 1.4e-05 mKIAA4208 ( 721 res) mbe00555 ( 721) 189 45 3.7e-05 mKIAA1185 ( 521 res) mph01717 ( 521) 182 43 7.1e-05 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 188 45 7.2e-05 mKIAA0405 ( 637 res) mbg12039 ( 637) 178 43 0.00013 mKIAA1469 ( 663 res) mbj00677 ( 663) 175 42 0.0002 mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 ( 528) 171 41 0.00028 mKIAA1674 ( 439 res) mbp04236 ( 439) 169 41 0.00031 mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 ( 785) 158 39 0.0018 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 149 38 0.0082 >>mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694 aa) initn: 2860 init1: 1976 opt: 2107 Z-score: 2020.7 bits: 385.4 E(): 2.1e-107 Smith-Waterman score: 2128; 62.570% identity (64.491% ungapped) in 537 aa overlap (51-581:25-551) 30 40 50 60 70 80 mKIAA4 GFPRLPQNVRDGGVLARRERAWSQQRAWSGRRAGSSGAAGRSGLRAPGSAARRDTALVVE : : . . : : : : : . . mKIAA0 TRAEPSADPGHSPGPGCPPHPRARRSARARRSCGPSPAPRPEPAERLPSPRSLP 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 mKIAA4 A-AMFHCIPLWRCNRHVEAIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQ : :..::::::::::::..::::::: ::::::::.:::::::::::::::::. ::. mKIAA0 ARIMLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQVVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFR 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 mKIAA4 LVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIAFCKALQVADFSGNPL :..:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::::..:::::::: mKIAA0 LLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPL 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 250 mKIAA4 TRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLE .:::..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..:::::::: :: ::. : .:: mKIAA0 SRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLE 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 mKIAA4 ELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPE .::::.:.. ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: mKIAA0 QLDLGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPV 240 250 260 270 280 290 320 330 340 350 360 370 mKIAA4 EISGLTSLTYLVISQNLLETIPEGIGKLKKLSILKLDQNRLTQLPEAIGDCENLTELVLT :..::. :: :..:::::. .:::::.::.:::::.::::: .. :::::::::.::.:: mKIAA0 ELGGLALLTDLLLSQNLLQRLPEGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILT 300 310 320 330 340 350 380 390 400 410 420 430 mKIAA4 ENRLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTMFCIRDNRLTRLPAEVSQA :: : .::.:.::: ::.:::.:::.: :: ::::: .:... .:::::. :: :.... mKIAA0 ENLLTALPHSLGKLTKLTNLNVDRNHLEVLPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHT 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 mKIAA4 VELHVLDVAGNRLHHLPLSLTTLKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDIDRATGEKILTCVLLP .::::::::::::. ::..:: :.::::::..::.::.: :::. : ::::.::: ::: mKIAA0 AELHVLDVAGNRLRSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDAQTGEKVLTCYLLP 420 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 550 mKIAA4 QMPSEPICQESLPRCGALESLVTDMSEEAWNDRSVHRVSAIRF---LEDEKDEDEN--ET :.: : :: : : :. .: . :::.:.: :: :.: .: : mKIAA0 QQPL-P----SLEDAGQQSS-----PSESCSDAPLSRVSVIQFEDTLEGEEDAEEAAAEK 480 490 500 510 520 560 570 580 590 600 mKIAA4 RTLQRRATPHPGELKNMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAAERVTTSV : :::::::::.::: ::. .:. ::. mKIAA0 RGLQRRATPHPSELKVMKRGIEERRNEAFVCKPDPSPPSPSEEEKRLSAESALSGGSVPS 530 540 550 560 570 580 >>mKIAA1365 ( 1497 res) mbg05137 (1497 aa) initn: 1105 init1: 1105 opt: 1251 Z-score: 1200.0 bits: 233.4 E(): 1.1e-61 Smith-Waterman score: 1251; 44.111% identity (45.475% ungapped) in 467 aa overlap (91-552:22-479) 70 80 90 100 110 mKIAA4 RSGLRAPGSAARRDTALVVEAAMFHCIPLWRCNRHVEAI----DKRHCSLVYVPEEIYRY :: : : : : :::: ::.:.. . mKIAA1 LAMQCLEMTTKRKLIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNF 10 20 30 40 50 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 ARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNDI :.:::: :::::..:::.:.:. ::::.. ::... :: ::....: :::.:.: . mKIAA1 ERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSSLPTSIASLVNLKELDISKNGV 60 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 PEIPESIAFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLA :.::.: :: : . . : ::...::..: .: ::: : .:: :. :: :.: : .: mKIAA1 QEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLR 120 130 140 150 160 170 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 SLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQ :::::: : :: :. .: .::.:::::::. .::: . . .:..::.:.: :. :: mKIAA1 ILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFSELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPG 180 190 200 210 220 230 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 EIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTYLVISQNLLETIPEGIGKLKKLSILKLD ::.:: :. ::.:.::.: . .::: .: :..:.:.:. .:..:: ::::. ::.: mKIAA1 SIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVD 240 250 260 270 280 290 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 QNRLTQLPEAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGC .:.::.::..::. : :. . :.: .:: .:: :..: .: .:.: : ::.:::.: mKIAA1 DNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLPPTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSC 300 310 320 330 340 350 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 CSLTMFCIRDNRLTRLPAEVSQAVELHVLDVAGNRLHHLPLSLTTLK-LKALWLSDNQSQ ..:.. .:.:.: :: :..: .:.::... :::..::.:.: :: : :::::::::. mKIAA1 KNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQRLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSK 360 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 PLLTFQTDIDRATGEKILTCVLLPQMPSEPICQESLPRCGALESLVTDMSEEAWNDRSVH :. .::. : ...:: ..::.: .:.. .: ... :... . mKIAA1 ALIPLQTEAHPETKQRVLTNYMFPQQPRG---DEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQ 420 430 440 450 460 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 RVSAIRFLEDEKDEDENETRTLQRRATPHPGELKNMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEV :... .::.:..::. mKIAA1 RMTVAFEFEDKKEDDESAGKVKALSCQAPWDRGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQ 470 480 490 500 510 520 >>mKIAA1225 ( 1401 res) mbg04842 (1401 aa) initn: 2019 init1: 1012 opt: 1241 Z-score: 1190.7 bits: 231.6 E(): 3.5e-61 Smith-Waterman score: 1241; 40.577% identity (41.865% ungapped) in 520 aa overlap (91-602:40-551) 70 80 90 100 110 mKIAA4 RSGLRAPGSAARRDTALVVEAAMFHCIPLWRCNR----HVEAIDKRHCSLVYVPEEIYRY :: : : ..: :::: ::.::. . mKIAA1 SIKKHQGDKFNSVHLKMTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTF 10 20 30 40 50 60 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 ARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNDI ..:::: :::::..:::.:.:. .:.::.: ::.. :: :::...: :::::.: : mKIAA1 EKTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGI 70 80 90 100 110 120 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 PEIPESIAFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLA :.::.: ::.: ... : ::...::..: .: ::: : .:: :. :: :.: : .: mKIAA1 QEFPENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQ 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 SLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQ :::::: : .:: ....: .::.::::.::. ..:: . : :...:.:::.:. .: mKIAA1 ILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLREFWMDGNRLTFIPG 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 EIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTYLVISQNLLETIPEGIGKLKKLSILKLD ::.:..: ::::.: .: . : :: . ...:.: :. .:: ::.::... ::.: mKIAA1 FIGSLRQLTYLDVSKNNIEMVEEGISTCENPQDFLLSSNSLQQLPETIGSLKNVTTLKID 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 QNRLTQLPEAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGC .:.: ::..:: ... :: . :.. .::.:::.: .. .. ::.: : .:: :::. mKIAA1 ENQLMYLPDSIGGLRSIEELDCSFNEIEALPSSIGQLTNMRTFAADHNYLQQLPPEIGNW 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 CSLTMFCIRDNRLTRLPAEVSQAVELHVLDVAGNRLHHLPLSLTTLK-LKALWLSDNQSQ ..:.. .. :.: :: :... .:.:.... :::..::.:.: :. : :.:::::::. mKIAA1 KNITVLFLHCNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSK 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 PLLTFQTDIDRATGEKILTCVLLPQMPSEPICQESLPRCGALESLVTDMSEEAWNDRSVH ::. .: . : : . .:: ..::.: :.. . ::. . :... . mKIAA1 PLIPLQKETDTETQKMVLTNYMFPQQPRT----EDVMFISDNESFNPAL----WEEQRKQ 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 RVSAIRFLEDEKDEDENETR--TLQRRATPHPGELKNMKKTVENLRNDM-NAAKGLDSNK :... ...::: : : .:.: ::.: ::::: :::... . . . . .:.. mKIAA1 RAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEESGR 490 500 510 520 530 540 600 mKIAA4 NEVNHAAERVTTSV . .: ..:. mKIAA1 DLKQHEDQQVVNKDKCVKTSESTTTKSKLDEREKYMNSVQKMSEPEAETNGGNLPVTASM 550 560 570 580 590 600 >>mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 (584 aa) initn: 746 init1: 474 opt: 524 Z-score: 507.5 bits: 103.9 E(): 4e-23 Smith-Waterman score: 649; 31.795% identity (34.254% ungapped) in 390 aa overlap (94-456:171-559) 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 LRAPGSAARRDTALVVEAAMFHCIPLWRCNRHVEAIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEEL .... .: :: .: .: .:: :: : mKIAA0 PAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLD-SLTTL 150 160 170 180 190 130 140 150 160 170 180 mKIAA4 LLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNDIPEIPESI : :.. . ... .: :: :.. .:.:..:: ::... .:. :::..:.. ..:. : mKIAA0 YLRFNRITTVEKDIKNLPKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQLEHLPKEI 200 210 220 230 240 250 190 200 210 220 230 240 mKIAA4 AFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELREN . : . :.. : : ::... .:..:. :.. :...:..... : :.:..: mKIAA0 GNCTQITNLDLQHNDLLDLPDTIGNLSSLNRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENN 260 270 280 290 300 310 250 260 270 mKIAA4 LLTYLPDSL-------------------------TQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGAL .. ::.:: .:. . :.. .:.: ..: .: . mKIAA0 NISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSR 320 330 340 350 360 370 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 LH-LKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTYLVISQNLL . :. : . :::. :: ..:. ... :... :.: ..::..:::.:: :..:.::: mKIAA0 AKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLL 380 390 400 410 420 430 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 ETIPEGIGKLKKLSILKLDQNRLTQLPEAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKLKKLS . .:.:.:.:.:: : :..:.: .::. :. ..: .::::.:.: :::..::.: .:. mKIAA0 KKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLSTLPRGIGHLTNLT 440 450 460 470 480 490 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 NLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTMFCIRDN-RLTRLPAEVSQAVELHVLDVAGNRLHHLP .:. .: :. ::.::: .: . . :: : :: :.. .: .... . : ::: mKIAA0 HLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLP 500 510 520 530 540 550 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 LSLTTLKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDIDRATGEKILTCVLLPQMPSEPICQESLPRCGA mKIAA0 PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV 560 570 580 >>mKIAA0231 ( 815 res) mbp00073 (815 aa) initn: 518 init1: 296 opt: 409 Z-score: 395.3 bits: 83.6 E(): 7.1e-17 Smith-Waterman score: 414; 30.372% identity (32.024% ungapped) in 349 aa overlap (107-441:465-809) 80 90 100 110 120 130 mKIAA4 LVVEAAMFHCIPLWRCNRHVEAIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQ : .: . . . : . .. . . : mKIAA0 ELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPAAVAQLVNLRELHVYHSSLVVDHPAL 440 450 460 470 480 490 140 150 160 170 180 190 mKIAA4 FFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIAF-----CKALQV : .:: : :. .:. ..: . .. .: :: .: .:: :. . : :.. mKIAA0 AFLEENLRILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSSLHLEGFQDLKNLRT 500 510 520 530 540 550 200 210 220 230 240 mKIAA4 ADFSGNPLTRLPESFPEL-QNLTCLSV-NDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLP .... :.:.:. .: .: ::. :. : . .:. .. :: :::: : .: mKIAA0 LYLKSS-LSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELLSCDLERIP 560 570 580 590 600 610 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 DSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKD-----LWLDGNQLSELPQEIGNLKNL :. .: :.:::: .:.. .. : : .. :: . :: :... .: .:: :.:: mKIAA0 HSIFSLNNLHELDLKENNLKTVEEII-SFQHLPSLSCLKLW--HNNIAYIPAQIGALSNL 620 630 640 650 660 670 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 LCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTYLVISQNLLETIPEGIGKLKKLSILKLDQNRLTQLP : ...: .: :: .. :.: :: .: : : ::: : : .:. . . .: . .:: mKIAA0 EQLFLGHNNIESLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLTNLQYFAVTNNNIEMLP 680 690 700 710 720 730 370 380 390 400 410 420 mKIAA4 EAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTMFC- ... .:..: :.: .: : : .:.:..:..:. : : .:: :. :: :: : mKIAA0 DGLFQCKKLQCLLLGRNSLTDLSPLVGELSNLTHLELTGNYLETLPVELEGCQSLKRSCL 740 750 760 770 780 790 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 -IRDNRLTRLPAEVSQAVELHVLDVAGNRLHHLPLSLTTLKLKALWLSDNQSQPLLTFQT ..:. :. :: :.. .. mKIAA0 IVEDSLLNSLPLPVAERLQTCLDKC 800 810 >>mKIAA1437 ( 811 res) mfj00342 (811 aa) initn: 541 init1: 282 opt: 386 Z-score: 373.3 bits: 79.6 E(): 1.2e-15 Smith-Waterman score: 433; 29.971% identity (31.804% ungapped) in 347 aa overlap (107-438:460-801) 80 90 100 110 120 130 mKIAA4 LVVEAAMFHCIPLWRCNRHVEAIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLR-ELPE : .: : . . .:.:: : . . : : mKIAA1 ELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLT-GLKELWLYHTAAKIEAPA 430 440 450 460 470 480 140 150 160 170 180 190 mKIAA4 QFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNDIPE-----IPESIAFCKALQ : .:: : .. ..:...: : .. : :: .. : : . ... : :. mKIAA1 LAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLK 490 500 510 520 530 540 200 210 220 230 240 mKIAA4 VADFSGNPLTRLPESFPELQ-NLTCLSVNDISLQSLPEN-IGNLYNLASLELRENLLTYL : ...: :..::. .. .: ::.:. . . . : . .. ::. ::: . : . mKIAA1 VLRLKSN-LSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMVNLTELELIRCDLERI 550 560 570 580 590 600 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 PDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLK-----DLWLDGNQLSELPQEIGNLKN : :. .:. :.:.:: .:.. .. : : .. ::. :: :... .: .:::: : mKIAA1 PHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEII-SFQHLHRLTCLKLWY--NHIAYIPIQIGNLTN 610 620 630 640 650 660 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 LLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTYLVISQNLLETIPEGIGKLKKLSILKLDQNRLTQL : : ...:..:..: .. .: :: .:.: : .: :: :..:. : . ::. : mKIAA1 LERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAVTANRIEAL 670 680 690 700 710 720 370 380 390 400 410 420 mKIAA4 PEAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSL--TM : . .:..: : : .: : .::. .:.: .:.... :.: :: :.: : : . mKIAA1 PPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSG 730 740 750 760 770 780 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 FCIRDNRLTRLPAEVSQAVELHVLDVAGNRLHHLPLSLTTLKLKALWLSDNQSQPLLTFQ . .... .. :: ::.. mKIAA1 LVVEEDLFSTLPPEVKERLWRADKEQA 790 800 810 >>mKIAA0606 ( 1318 res) mbg00108 (1318 aa) initn: 336 init1: 149 opt: 374 Z-score: 359.2 bits: 77.6 E(): 7.3e-15 Smith-Waterman score: 394; 26.141% identity (29.371% ungapped) in 482 aa overlap (93-525:223-700) 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 GLRAPGSAARRDTALVVEAAMFHCIPLWRCNRHVEAIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEE .... ..: ::: ..: ... :...: . mKIAA0 SSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLF-YSQDLTH 200 210 220 230 240 250 130 140 150 160 170 mKIAA4 LLLDANQLRELPE--------QFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRN : : : ::. : .. ...::..:.::.:.. .: . .. :.::.:: : mKIAA0 LNLKQNFLRQTPTLPAARGLGELQRFTKLKSLNLSNNHLGAFPSAVCSIPTLAELNVSCN 260 270 280 290 300 310 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 DIPEIPESIAFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYN . :.: ... . ::. ..:: : :: . ...:. :... . ..:: . .: mKIAA0 ALREVPAAVGDMQNLQTFLLDGNFLQSLPAELESMHQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTA 320 330 340 350 360 370 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 LASLELRENLLTYLPDSLTQLRRL---EELDLGNNEIYNL-PESIGALLHLKDLWLDGNQ . .: . : . : : :::. ...:: : . .: . . . :. .: : :. mKIAA0 VDKLCMAGNCVETL--RLQALRRMPHIKHVDLRLNILRKLMADEVDFVQHVTQLDLRDNK 380 390 400 410 420 300 310 320 330 mKIAA4 LSELPQEI-GNLKNLLC-------LDVSENRLERL---PEEISGL------TSLTYLVIS :..: : .:.. : : :.: :. : .:.. : . :.:. .: mKIAA0 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLNVCGYFLKALYASSNELAQLDVYPVPNYLSYMDVS 430 440 450 460 470 480 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 QNLLETIPEGIGKLKKLSILKLDQNRLTQLPEAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKL .: ::..:: . . .:: .: . .:.. .:: . .: .:. .::: ::. . . mKIAA0 RNCLESVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNRLARLPERLERT 490 500 510 520 530 540 400 410 420 430 440 mKIAA4 KKLSNLNADRNKLVSLPKEI-GGCCSLTMFCIRDNRLTRLP-AEVSQAVE--LHVLDVAG . . :....:... :: .. :: .. :.: :: : .:. . :. : ... mKIAA0 S-VEVLDVQHNQITELPPNLLMKADSLRFLNASANKLETLPPATLSEETSSILQELYLTN 550 560 570 580 590 600 450 460 470 480 490 mKIAA4 NRLHH--LPLSLTTLKLKALWLSDN--QSQPL-----LTFQTDID------RATGEKILT : : .:: .:: : .. : :: : : .:: .: :.. mKIAA0 NCLTDKCVPLLTGHPRLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDISGNKLKAIPTTIMN 610 620 630 640 650 660 500 510 520 530 540 550 mKIAA4 CVLLPQMPSEPICQESLPRCGAL-ESLVTDMSEEAWNDRSVHRVSAIRFLEDEKDEDENE : . . .. : : .:. : : .:.: mKIAA0 CRRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEVKCVDLSCNELSEITLPENLPPKLQELDLTGNPRL 670 680 690 700 710 720 560 570 580 590 600 mKIAA4 TRTLQRRATPHPGELKNMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAAERVTTSV mKIAA0 ALDHKSLELLNNIRCFKIDQPSAGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFRDN 730 740 750 760 770 780 >>mFLJ00248 ( 491 res) mfj21306 (491 aa) initn: 365 init1: 142 opt: 297 Z-score: 290.6 bits: 63.5 E(): 4.8e-11 Smith-Waterman score: 328; 33.624% identity (35.000% ungapped) in 229 aa overlap (146-369:51-275) 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 YARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIA---NFMQLVELDVS :.::. .....: : .. .... :.: mFLJ00 AASVSLPGSPGLPGSRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLS 30 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 RNDIPEIPESIAFCKALQVADFS--GNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIG :: .::.:: : :. ... .: : : : .. .: :: :... .:.::: : mFLJ00 RNRFPEVPE--AACQLVSLEGLSLYHNCLKCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSSLPPYIC 90 100 110 120 130 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 NLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQ .: : : . .: : :: ... : :..::...::. .:: . .: :.:: . :: mFLJ00 QL-PLRVLIISNNKLGALPPDISTLGSLRQLDVSSNELQSLPVELCSLRSLRDLNVRRNQ 140 150 160 170 180 190 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 LSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTYLVISQNLLETIPEGIGKLKKL :: ::.:.:.: :. :: : ::. :.: . : : .....: :.. : : :: mFLJ00 LSTLPDELGDLP-LVRLDFSCNRISRIPVSFCRLRHLQVVLLDSNPLQSPPAQICLKGKL 200 210 220 230 240 250 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 SILKLDQNRLTQLPEAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLP :.: . . :.:: mFLJ00 HIFKYLTMEAGRRGAALGDLVPSRPPSFSPCPAEDLFPGRRYDGGLDSGFHSVDSGSKRW 260 270 280 290 300 310 >>mKIAA1016 ( 777 res) mpg00620 (777 aa) initn: 403 init1: 161 opt: 280 Z-score: 271.8 bits: 60.7 E(): 5.4e-10 Smith-Waterman score: 330; 28.535% identity (30.623% ungapped) in 396 aa overlap (198-576:116-501) 170 180 190 200 210 220 mKIAA4 ELDVSRNDIPEIPESIAFCKALQVADFSGNPLTR-LPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLP ::.: : ... : : :... .:. .: mKIAA1 TALHPHLHQHHQHHQHHQHHGGTGGTGFNLPLNRGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFP 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 ENIGNLYNLASL---ELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKD .. . ..:.. .: .: :. .: : :. :: :.: .: : .::.: : : mKIAA1 RTTAPGHDLSDTVRADLSKNRLVEVPMELCQFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTH 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 LWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTYLVISQNLLETIPEG : :. :::: :: . .: : : .:.:.: :::::. : .: : .: : . ..:. mKIAA1 LNLSRNQLSALPACLCGLP-LKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQ 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 IGKLKKLSILKLDQNRLTQLPEAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKLKKLSNLNADR ::.::.: :.. .: : :: . : :... .. :..:..: . ..:.:. : . mKIAA1 IGQLKSLRELNVRRNYLKVLPPELVDLP-LVKFDFSCNKVLVIPVCFREMKQLQVLLLEN 270 280 290 300 310 320 410 420 430 440 450 mKIAA4 NKLVSLPKEIGGCCSLTMF-------C-IRDNRLTRLPAEVSQAVELHVLDVAGNRLHHL : : : : .: .. .: : :. . ::. .. :: : . . mKIAA1 NPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTSDSLYLPTIERPHLHQHVEDSKKDSDSGV 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 PLSLTTLKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDI---DRATGEKILTCVLLPQMPSEPICQESLP . .:.: ::... : . ...: :.. : .: : : : : mKIAA1 GSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNAPMSNIVEEDQTIKED--ACHRLT-----PAKGEFQP 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 RCGAL-ESLVTDMSEEAWNDRSVHRVSAI-RFLEDEKDEDENETRTLQRRATPHPGELKN . ..: .: .. . .: :. : :.. ...:. :: .: ... : : :: : mKIAA1 KPSVLGDSGISGQEREQLAGRADARHSGLMNYIKDQA-EDCEELLRIEEDAHWHMEELLN 440 450 460 470 480 490 580 590 600 mKIAA4 MKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAAERVTTSV .: : mKIAA1 SSKDRELDIAMIEQLREAELLQDPNGLSADIIERSILNLFPMDSGEASEFPDPSLNGQLQ 500 510 520 530 540 550 >>mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 (640 aa) initn: 156 init1: 59 opt: 224 Z-score: 219.1 bits: 50.7 E(): 4.6e-07 Smith-Waterman score: 224; 27.451% identity (29.536% ungapped) in 255 aa overlap (86-330:47-293) 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 SGAAGRSGLRAPGSAARRDTALVVEAAMFHCIPLWRCNRHVEAIDKRHCSLVYVPEEIYR : . :. . . . .: ::. : mKIAA1 RFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKVICVRKNLREVPDGIST 20 30 40 50 60 70 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 YARSLEELLLDANQLRELP-EQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSR- .: :. : ::.. . ..: .: .:. : :: :.:. . ::. : :..:.. . mKIAA1 NTRLLN---LHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLSRNHIRTI--EIGAFNGLANLNTLEL 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 mKIAA4 --NDIPEIPE-SIAFCKALQVADFSGNPLTRLPE-SFPELQNLTCLSVNDIS-LQSLPEN : . ::. .... . :. . .::. .: .: .. .: :...... :. . :. mKIAA1 FDNRLTTIPNGAFVYLSKLKELWLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEG 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 -IGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNL-PESIGALLHLKDLWL . .: :: :.: : .:. :: : .:.::::..:.. . : :. .:.::. ::. mKIAA1 AFEGLSNLRYLNLAMCNLREIPN-LTPLIKLDELDLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWM 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 DGNQLSELPQE-IGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTYLVISQNLLETIPEGIG .:.. . .. . ::..:. .....: : ::... .: : .: mKIAA1 IQSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLAHNNLTLLPHDL--FTPLHHLERIHLHHNPWNCNCD 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 KLKKLSILKLDQNRLTQLPEAIGDCENLTELVLTENRLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNK mKIAA1 ILWLSWWIRDMAPSNTACCARCNTPPNLKGRYIGELDQNYFTCYAPVIVEPPADLNVTEG 310 320 330 340 350 360 606 residues in 1 query sequences 1768411 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:59:21 2006 done: Mon Mar 27 10:59:22 2006 Scan time: 0.810 Display time: 0.300 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]