FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1561.ptfa, 1106 aa vs ./tmplib.26680 library 1767911 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1775+/-0.00871; mu= 4.2288+/- 0.578 mean_var=452.3429+/-107.013, 0's: 0 Z-trim: 40 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0603 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1334 ( 992 res) mpm09174 ( 992) 589 67 1.8e-11 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 455 56 7.7e-08 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 409 52 1.3e-06 mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 402 51 1.6e-06 mKIAA0635 ( 1125 res) mia28019 (1125) 399 50 1.8e-06 mKIAA0336 ( 1693 res) mbg01823 (1693) 390 50 3.8e-06 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 373 48 9e-06 mKIAA1601 ( 856 res) mpm03175 ( 856) 366 47 1.1e-05 mKIAA0445 ( 1598 res) mbg06476 (1598) 351 47 3.8e-05 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 349 46 4.5e-05 mKIAA0373 ( 1370 res) mfj02256 (1370) 322 44 0.0002 mKIAA0619 ( 777 res) mbg08246 ( 777) 288 40 0.0012 mKIAA1565 ( 2081 res) mpf00737 (2081) 270 40 0.0058 mKIAA0378 ( 632 res) mbg02680 ( 632) 255 37 0.0079 >>mKIAA1334 ( 992 res) mpm09174 (992 aa) initn: 798 init1: 252 opt: 589 Z-score: 298.4 bits: 66.9 E(): 1.8e-11 Smith-Waterman score: 659; 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