FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1852.ptfa, 736 aa vs ./tmplib.26680 library 1768281 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0518+/-0.00429; mu= 6.1606+/- 0.286 mean_var=137.6515+/-35.220, 0's: 0 Z-trim: 64 B-trim: 117 in 1/35 Lambda= 0.1093 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 1824 300 4e-82 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 1647 272 1.4e-73 mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 1644 272 1.9e-73 mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 1621 268 2.3e-72 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 1612 267 4.1e-72 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 1611 266 4.4e-72 mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 ( 486) 1490 247 2.6e-66 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 1488 247 3.3e-66 mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 ( 463) 1471 244 2e-65 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 1450 241 2.1e-64 mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 ( 617) 1413 235 1.4e-62 mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 ( 481) 1354 226 7.4e-60 mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 1345 225 2.3e-59 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 1327 222 1.7e-58 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 1306 218 1.3e-57 mKIAA4237 ( 519 res) mfj17080 ( 519) 1250 210 6.8e-55 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 1196 201 2.9e-52 mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 1172 197 3.1e-51 mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 ( 831) 1063 180 7e-46 mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 962 164 3.7e-41 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 921 158 4e-39 mKIAA4222 ( 543 res) mkg04188 ( 543) 843 145 1.5e-35 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 805 139 9.1e-34 mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 794 138 3.7e-33 mFLJ00187 ( 488 res) mbg06919 ( 488) 787 137 6.2e-33 mKIAA0426 ( 508 res) mpm11025 ( 508) 731 128 2.9e-30 mKIAA0924 ( 617 res) mbp20088 ( 617) 681 120 7.8e-28 mKIAA1703 ( 891 res) mfj09089 ( 891) 606 108 3.6e-24 mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852) 570 103 3e-22 mKIAA0478 ( 1234 res) mib07095 (1234) 457 85 5.3e-17 mKIAA4234 ( 105 res) mph00083 ( 105) 419 78 6.6e-16 mKIAA3011 ( 496 res) mph01327 ( 496) 404 76 9.6e-15 mFLJ00416 ( 522 res) msj08249 ( 522) 398 75 1.9e-14 mKIAA1020 ( 642 res) mpm09294 ( 642) 397 75 2.4e-14 mKIAA4227 ( 539 res) mng13251 ( 539) 353 68 2.7e-12 mKIAA1951 ( 392 res) mid22012 ( 392) 345 67 5.2e-12 mKIAA0287 ( 1618 res) mbg03130 (1618) 353 69 5.5e-12 mKIAA0760 ( 1400 res) mbg03730 (1400) 336 66 3.2e-11 mFLJ00107 ( 1371 res) mfj24090 (1371) 331 65 5.5e-11 mKIAA1084 ( 1013 res) mpf00327 (1013) 312 62 3.6e-10 mKIAA1572 ( 463 res) mfj40003 ( 463) 301 60 7.1e-10 mKIAA1675 ( 707 res) mia50030 ( 707) 294 59 2e-09 mKIAA0569 ( 1248 res) mbg07960 (1248) 294 59 2.9e-09 mKIAA0414 ( 491 res) mbg10164 ( 491) 277 56 1e-08 mKIAA0048 ( 622 res) mid07066 ( 622) 274 56 1.7e-08 mKIAA0352 ( 686 res) meh01314 ( 686) 266 55 4.2e-08 mKIAA1803 ( 705 res) mfj24209 ( 705) 263 54 6e-08 mKIAA1483 ( 492 res) mth00273 ( 492) 259 53 7.3e-08 mKIAA0211 ( 1292 res) mpm11220 (1292) 262 54 9.9e-08 mKIAA1993 ( 527 res) meh02016 ( 527) 250 52 2e-07 >>mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 (558 aa) initn: 1801 init1: 1801 opt: 1824 Z-score: 1566.8 bits: 300.1 E(): 4e-82 Smith-Waterman score: 1825; 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