FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00258.ptfa, 663 aa vs ./tmplib.26680 library 1768354 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3138+/-0.00606; mu= 12.1506+/- 0.404 mean_var=183.8365+/-42.727, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0946 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3018 ( 732 res) mbg08136 ( 732) 1445 210 8.6e-55 mKIAA1914 ( 835 res) mfj32047 ( 835) 535 85 2.2e-17 >>mKIAA3018 ( 732 res) mbg08136 (732 aa) initn: 1690 init1: 654 opt: 1445 Z-score: 1076.1 bits: 209.6 E(): 8.6e-55 Smith-Waterman score: 1898; 46.619% identity (53.377% ungapped) in 695 aa overlap (9-661:81-729) 10 20 30 mFLJ00 LRSAAADVPPPLPNKPPPEDYYEEALPLGPGKSPEYIS :::::.. :: :::::.::.:::.::::. mKIAA3 AQKAEANNLPAPPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYIT 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 mFLJ00 SHNGCSPAQSIVDGYYEDADNSYPTTRMNGELKNSYNDSDAMSSSYESYDEEEEEEKGRQ :. :::::::::::::::::. ::.. mKIAA3 SNY----------------------------------DSDAMSSSYESYDEEEEDGKGKK 120 130 100 110 120 130 140 150 mFLJ00 PKHQWPSEEASMHLVRDCRICAFLLRKKRFGQWAKQLTVIKEEQLLCYKSSKDRQPHLRL .:::::::::: ::.: .::::::::::::::.: : :::. .:::::::::.::...: mKIAA3 TRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTKLLCYKSSKDQQPQMEL 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 mFLJ00 ALDVCTVIYVPKDSRHKRHELRFSQGATEVLVLALQSREQAEEWLKVIREV----SRPIV :. :.. :.:.::..:.:::...: .:. ::::.:..::::.:::::.:. : : : mKIAA3 PLQGCSITYIPRDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQGKEQAEQWLKVIKEAYSDCSGP-V 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 mFLJ00 GAEGLEVPRSPVILCKADQDKRLSQEKQNSDSDSLGMNDSGSTLGRREACEHGKGKKNSL : : . . . ::. .:.::.:. .::... :.... .: . .: ..: :: : mKIAA3 DPECSPPPSTSAPVNKAELEKKLSSERPSSDGEG-GVENGVTTCNGKE---QAKRKKPSK 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 mFLJ00 AELKGSMSRAAGRKITRIISFSKKKALSEDLQTFSSEDEVPCCGYLNVLVNQGWKERWCR .: ::..:...:.:::.::...::: : : :: :.:..:: ::::::: :. :.::::: mKIAA3 SEAKGTVSKVTGKKITKIIGLGKKKP-STDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNSRWRERWCR 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 mFLJ00 LRCNTLYFHKDRTDLHTHVNSIALRGCEVAPGFGPRHPFAFRILRNRQEVAILEASCSED .. . : .::::.::.::. :: :::::: ::. .::..::.::: ::::.:::: ::: mKIAA3 VKDSKLILHKDRADLKTHLVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAVLEASSSED 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 mFLJ00 MGRWLGLLLVEMGSKVTPEALHYDYVDVETLTSIVSAGRNSFL-----------YAQSCQ ::::.:.::.: ::.. : ::::::.::: ..........: : : . mKIAA3 MGRWIGILLAETGSSTDPGALHYDYIDVEMSANVIQTAKQTFCFMNRRAVSTSPYLGSLS 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 mFLJ00 DQWPEPRI----YDEVP--YEKVQDEEPQRPT-GAQVKRHASSCSEKSHRADPQVKVKRH . . .: ::.:: ......: . :. :: .: : ..: ... ::: mKIAA3 NGYAHPSGTALHYDDVPCVNGSLKNKKPPASSNGVPVKGKAPSSQQK--KVETAGGVKRT 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 550 mFLJ00 ASSANQYKYGKNRAEEDARRYLVEKERLEKEKETIRTELTALRQEKKELKEAIRNNPGAK ::.:.::::::::.: ::.: ..:.: :.::..:..:. ::.:.:.:. ::. : : : mKIAA3 ASNAEQYKYGKNRVEADAKRLQSKEEELLKRKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIEVNAGRK 550 560 570 580 590 600 560 570 580 590 600 610 mFLJ00 SKA-LEEAVATLEAQCRAKEEQRIDLELKLVAVKERLQQSLAGGPALGLSVSNKNKSQDT ..: ::. . :: .:. .: .:..:::.:. ::: :...:::: .:::.. .. mKIAA3 TQAALEDKLKRLEEECKQREAERVSLELELTEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPRSG---- 610 620 630 640 650 660 620 630 640 650 mFLJ00 TNKPQS---------NAP---------EQSLPVNCVSELRKRSPSIVTSN-QGRVLQKAK :..::: :.: : :::: .. :.: .:: .: .:.:::::: mKIAA3 TSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDAEGPLPVNSAAVLKKSQPSSGSSPCRGHVLQKAK 670 680 690 700 710 720 660 mFLJ00 EWEMKKT :::.:. mKIAA3 EWELKNGT 730 >>mKIAA1914 ( 835 res) mfj32047 (835 aa) initn: 1277 init1: 453 opt: 535 Z-score: 404.3 bits: 85.5 E(): 2.2e-17 Smith-Waterman score: 1211; 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