FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1631.ptfa, 1027 aa vs ./tmplib.26680 library 1767990 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3709+/-0.00447; mu= 20.7564+/- 0.301 mean_var=85.0113+/-19.166, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 20 in 1/35 Lambda= 0.1391 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0054 ( 1617 res) mbg06166 (1617) 288 69 7.8e-12 mKIAA1769 ( 1622 res) mtg00072 (1622) 177 46 4e-05 mKIAA0625 ( 778 res) mpm03100 ( 778) 168 44 8.9e-05 mKIAA0083 ( 1078 res) mpm08053 (1078) 160 43 0.00033 >>mKIAA0054 ( 1617 res) mbg06166 (1617 aa) initn: 425 init1: 104 opt: 288 Z-score: 304.8 bits: 68.6 E(): 7.8e-12 Smith-Waterman score: 651; 28.531% identity (34.459% ungapped) in 715 aa overlap (322-973:429-1083) 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 TNRIEEGERPDRAKGYELELSLALGTYYPPILLRQLLPTLLQGPSIFTAPKEVAEIKAQL .:.: .: :.. ..:: .. : mKIAA0 QLVTTAKRWDSSSKTIVDFEPNETTDLEKSLLIRYQIP--LSADQLFT--------QSVL 400 410 420 430 440 360 370 380 390 400 mKIAA1 ETTLKSRNYEVKLRLLLHLEELQMEHDIRHYDLD-------SVPMTW----DPVDQNPRL . .: . ::...:. ::..::. . ... ...: : .: :: .: mKIAA0 DKSLTKTNYQARLHDLLYIEEIAQYKEVSRFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQL 450 460 470 480 490 500 410 420 430 440 mKIAA1 L-------TLEVPGVAESRPSVLRGDHLFAL-LSSE----TQQDDPVTYKGFVHKVELDR . :: .: .: . : . .. : . .: .: .:.. ... : mKIAA0 FGRFKLTETLSEDTLA-GRLVMTRVNAVYLLPVPKEKLVQSQGTKEKVYEATIEEKTKDY 510 520 530 540 550 560 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 VKLSFSTSL---LSRFVD-GLTFKVNFTFNRQPLRVQHRALELTGRWVLWPMLFPVASRG : : .: :: : . ...: .:: :: .: ::. : .::: mKIAA0 VFLRISRECCEELSLRPDCDIQVELQFQLNRLPLCEMHYALD---RIKDNAVLFP----D 570 580 590 600 610 620 510 520 530 540 550 mKIAA1 VSLLPSDVKF---KLYDRSLESNPEQLQAMKHIVRGTTRP-----APYIIFGPPGTGKTV .:. :. . . . .:..:. :. .:. : . : : : .:.:: ::::: mKIAA0 ISMTPT-IPWSPNRQWDEQLD--PRLNAKQKEAVLAITTPLSIQLPPVLIIGPYGTGKTF 630 640 650 660 670 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 TLVEAIKQVVKHLPKAHILACAPSNSGADL-----LCQRLRVHLPSS-IYRLLAPSRDIR ::..: :..... ...:: :. :::.::: : ... :.. :. .: .. mKIAA0 TLAQAAKHILQQ-QETRILICTHSNSAADLYIKDYLHPYVEAGNPQARPLRVYFRNRWVK 680 690 700 710 720 730 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 MVPEDIKTCCNWDAKKGEYVYPAKKHLQQYRVLITTLITASRLVSAQFPIDHFTHIFIDE : .. : .. .. . .: :. . ..::...:: :.. : . .. :::...:: mKIAA0 TVHPVVHQYCLISSTQSTFQMPQKEDILKHRVVVVTLSTSQYLCQLDLEPGFFTHVLLDE 740 750 760 770 780 790 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 AGHCMEPESLVAIAGLMDVKETGNPGGQLVLAGDPRQLGPVLRSPLALKHGLGYSLLERL :.. :: :... .: . .:.: ..::::: ::.: . : .: ...: :::.:: mKIAA0 AAQAMECETIMPLA--LATKNT-----RIVLAGDHMQLSPFVYSEFARERNLHVSLLDRL 800 810 820 830 840 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 LAYNSLYKKGPNGYDPQFITKLLRNYRSHPTILDIPNQLYYDGELQACADVVDRERFCRW :.. : . ... : .::::: .:.. ..:.:.:.:.: . .. : mKIAA0 ------YEHYPAEFPCRIL--LCENYRSHEAIINYTSELFYEGKLMASGKQPAHKDF--- 850 860 870 880 890 800 810 820 830 840 mKIAA1 EGLPQQGFPIIFHGVMGKDEREGNSPSFFNPEEAATVTSYLKQLLA--PSSKKGKARLSP .:. : . :.: .: :: .:.: :. :. ...: : . :: :. mKIAA0 -------YPLTFFTARGEDVQEKNSTAFYNNAEVFEVVERVEELRRKWPVAW-GK--LDD 900 910 920 930 940 850 860 870 880 890 900 mKIAA1 RNVGVISPYRKQVEKIRYCITKLDRELRGLDDIKDLKVGSVEEFQGQERSVILISTVRS- ..::..:: :: .:: ::: ..:..: : . ::.. :...::::. mKIAA0 GSIGVVTPYADQVFRIRA-------ELRK-KRLSDVNVERVLNVQGKQFRVLFLSTVRTR 950 960 970 980 990 1000 910 920 930 940 mKIAA1 -----SQSFV----QL------DLDFNLGFLKNPKRFNVAVTRAKALLIVVGNPLLL--- .:. . :: :::. :::.: : .:.:.:::..:. :::.:. : mKIAA0 HTCKHKQTPIKKKEQLLEDSTEDLDY--GFLSNYKLLNTAITRAQSLVAVVGDPVALCSI 1010 1020 1030 1040 1050 950 960 970 980 990 1000 mKIAA1 GH-DPDWKTFLEFCKENGGYTGCPFPAKLDLQQGQDLLQGLSKLSPSTSGPRRHQNLPQE :. :. :. .:.:: . : : mKIAA0 GRCRKFWERFIALCHENHSLHGITFEQIKAQLEALELKKTYVLNPLAPEFIPRALRLQHS 1060 1070 1080 1090 1100 1110 >>mKIAA1769 ( 1622 res) mtg00072 (1622 aa) initn: 245 init1: 142 opt: 177 Z-score: 184.4 bits: 46.4 E(): 4e-05 Smith-Waterman score: 235; 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