FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA2034.ptfa, 1729 aa vs ./tmplib.26680 library 1767288 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0464+/-0.00863; mu= 6.9634+/- 0.572 mean_var=456.9372+/-108.225, 0's: 0 Z-trim: 52 B-trim: 20 in 1/35 Lambda= 0.0600 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 7337 652 4.6e-187 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 6968 620 2e-177 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 5129 460 1.3e-129 mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048) 955 99 9.6e-21 mKIAA4211 ( 314 res) mfj31105 ( 314) 879 91 3.7e-19 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 709 78 1.9e-14 mKIAA1749 ( 922 res) meh00393 ( 922) 637 71 1.3e-12 mKIAA0445 ( 1598 res) mbg06476 (1598) 607 69 9.9e-12 mFLJ00293 ( 1022 res) msh04332 (1022) 533 62 6.8e-10 mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 498 60 7.5e-09 mKIAA0336 ( 1693 res) mbg01823 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..::::::::::::::..::::: ::::.:::::.::::::::::.:.:::: mKIAA3 AFGSAYKTKKGMFRTVGQLYKESLTKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKRAGKLDPHLVLD 500 510 520 530 540 550 450 460 470 480 490 500 mKIAA2 QLRCNGVLEGIRICRQGFPNRILFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACEKMIQALELD ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::.::::: mKIAA3 QLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIVFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACERMIRALELD 560 570 580 590 600 610 510 520 530 540 550 560 mKIAA2 PNLYRVGQSKIFFRAGVLAQLEEERDLKVTDIIVSFQAAARGYLARRAFQRRQQQQSALR :::::.:::::::::::::.::::::::.::::. :::. ::::::.:: ..::: :::. mKIAA3 PNLYRIGQSKIFFRAGVLAHLEEERDLKITDIIIFFQAVCRGYLARKAFAKKQQQLSALK 620 630 640 650 660 670 570 580 590 600 610 620 mKIAA2 VMQRNCAAYLKLRNWQWWRLFIKVKPLLQVTRQDEVLQARAQELQKVQELQQQSAREVGE :.:::::::::::.:::::.: :::::::::::.: :::. .:: ::.: : . :. : mKIAA3 VLQRNCAAYLKLRHWQWWRVFTKVKPLLQVTRQEEELQAKDEELLKVKEKQTKVEGELEE 680 690 700 710 720 730 630 640 650 660 670 680 mKIAA2 LQGRVAQLEEERTRLAEQLRAEAELCSEAEETRARLAARKQELELVVTELEARVGEEEEC .. . :: ::.. :::::.::.:: .:::: ::::::.::::: .. .::.:: :::: mKIAA3 MERKHQQLLEEKNILAEQLQAETELFAEAEEMRARLAAKKQELEEILHDLESRVEEEEER 740 750 760 770 780 790 690 700 710 720 730 740 mKIAA2 SRQLQSEKKRLQQHIQELESHLEAEEGARQKLQLEKVTTEAKMKKFEEDLLLLEDQNSKL .. ::.:::..: :::.:: .:. ::::::::::::::.:::.::.::..:::::::::. mKIAA3 NQILQNEKKKMQAHIQDLEEQLDEEEGARQKLQLEKVTAEAKIKKMEEEVLLLEDQNSKF 800 810 820 830 840 850 750 760 770 780 790 800 mKIAA2 SKERRLLEERLAEFSSQAAEEEEKVKSLNKLRLKYEATISDMEDRLKKEEKGRQELEKLK ::..:.:.:.:: ::: ::::::.:.: :.: : :. :::.:.::::::: :::::: : mKIAA3 IKEKKLMEDRIAECSSQLAEEEEKAKNLAKIRNKQEVMISDLEERLKKEEKTRQELEKAK 860 870 880 890 900 910 810 820 830 840 850 860 mKIAA2 RRLDGESSELQEQMVEQKQRAEELLAQLGRKEDELQAALLRAEEEGGARAQLLKSLREAQ :.::::...::.:..: . ...:: .:: .::.:::.:: :...: . . :: :: : mKIAA3 RKLDGETTDLQDQIAELQAQVDELKVQLTKKEEELQGALARGDDETLHKNNALKVARELQ 920 930 940 950 960 970 870 880 890 900 910 920 mKIAA2 AGLAEAQEDLEAERVARAKAEKQRRDLGEELEALRGELEDTLDSTNAQQELRSKREQEVT : .:: :::.:.:...: :::::.:::.::::::. :::::::.: ::::::.::::::. mKIAA3 AQIAELQEDFESEKASRNKAEKQKRDLSEELEALKTELEDTLDTTAAQQELRTKREQEVA 980 990 1000 1010 1020 1030 930 940 950 960 970 980 mKIAA2 ELKKALEEESRAHEVSMQELRQRHSQALVEMAEQLEQARRGKGVWEKTRLSLEAEVSELK :::::::.:.. ::...:..::::. :: :..::::::.: :. ::.. .::.. .:: mKIAA3 ELKKALEDETKNHEAQIQDMRQRHATALEELSEQLEQAKRFKANLEKNKQGLETDNKELA 1040 1050 1060 1070 1080 1090 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA2 AELSSLQTSRQEGEQKRRRLESQLQEVQGRSSDSERARSEAAEKLQRAQAELESVSTALS :.. :: . :.:.::..:..:.::.... :...: : : ::: .. : ::..::: : mKIAA3 CEVKVLQQVKAESEHKRKKLDAQVQELHAKVSEGDRLRVELAEKANKLQNELDNVSTLLE 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA2 EAESKAIRLGKELSSAESQLHDTQELLQEETRAKLALGSRVRALEAEAAGLREQMEEEVV :::.:.:...:. .. ::::.::::::::::: :: :.::.: :: : .:.::.::: mKIAA3 EAEKKGIKFAKDAAGLESQLQDTQELLQEETRQKLNLSSRIRQLEEEKNSLQEQQEEEEE 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA2 ARERAGRELQSTQAQLSEWRRRQEEEAAVLEAGEEARRRAAREAETLTQRLAEKTEAVER ::. ... . :.::.. ... ... ...:. :::... ...:.:.::: ::. : .. mKIAA3 ARKNLEKQVLALQSQLADTKKKVDDDLGTIESLEEAKKKLLKDVEALSQRLEEKVLAYDK 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1170 1180 1190 1200 1210 1220 mKIAA2 LERARRRLQQELDDATVDLGQQKQLLSTLEKKQRKFDQLLAEEKAAVLRAVEDRERIEAE ::... :::::::: :::: .:.:..:.:::::.::::::::::. : .:.:.: ::: mKIAA3 LEKTKNRLQQELDDLTVDLDHQRQIVSNLEKKQKKFDQLLAEEKGISARYAEERDRAEAE 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA2 GREREARALSLTRALEEEQEAREELERQNRALRAELEALLSSKDDVGKNVHELERARKAA .::.:..::::.::::: ::.::.::::. :::..: :.::::::::::::::....: mKIAA3 AREKETKALSLARALEEALEAKEEFERQNKQLRADMEDLMSSKDDVGKNVHELEKSKRAL 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1290 1300 1310 1320 1330 1340 mKIAA2 EQAASDLRTQVTELEDELTAAEDAKLRLEVTVQALKAQHERDLQGRDDAGEERRRQLAKQ :: . ..:::. :::::: :.:::::::::..::.::: ::::: ::. .::..: : :: mKIAA3 EQQVEEMRTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNMQAMKAQFERDLQTRDEQNEEKKRLLLKQ 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1350 1360 1370 1380 1390 1400 mKIAA2 LRDAEVERDEERKQRALAMAARKKLELELEELKAQTSAAGQGKEEAVKQLKKMQVQMKEL .:. :.: ..::::::::.:..::.:..:..:.:: ::.....:..:::.:.:.:::. mKIAA3 VRELEAELEDERKQRALAVASKKKMEIDLKDLEAQIEAANKARDEVIKQLRKLQAQMKDY 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1410 1420 1430 1440 1450 1460 mKIAA2 WREVEETRSSRDEMFTLSRENEKKLKGLEAEVLRLQEELAASDRARRQAQQDRDEMAEEV ::.::.:.::::.:. :.:.:::::.::::.:.::::::.:.::::.:.:.:::.:.:. mKIAA3 QRELEEARASRDEIFAQSKESEKKLKSLEAEILQLQEELASSERARRHAEQERDELADEI 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1470 1480 1490 1500 1510 1520 mKIAA2 ASGNLSKAATLEEKRQLEGRLSQLEEELEEEQNNSELLKDHYRKLVLQVESLTTELSAER :.. .:.: :.:::.::.:..::::::::::.: :::.:..:: .:::..:.:::.::: mKIAA3 ANSASGKSALLDEKRRLEARIAQLEEELEEEQSNMELLNDRFRKTTLQVDTLNTELAAER 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1530 1540 1550 1560 1570 1580 mKIAA2 SFSAKAESGRQQLERQIQELRARLGEEDAGARARQKMLIAALESKLAQAEEQLEQESRER : . :....::::::: .::.:.: : ....... : :.:::.:..: :::::::..:: mKIAA3 SAAQKSDNARQQLERQNKELKAKLQELEGAVKSKFKATISALEAKIGQLEEQLEQEAKER 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1590 1600 1610 1620 1630 1640 mKIAA2 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:. :.. .. ::.:..: : : ::: mKIAA0 FTTGMAAVKKKSLCIQIKLQVDALIDTIKRSKMHFVHCFLPVAEGWPG--EPRSASSRRV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 450 460 470 mKIAA2 ------------------LVLD------QLRCNGVLEGIRICRQGFPNRILFQEFRQRYE : :: ::: . .:...:. :::.:....:.:::.:.. mKIAA0 SSSSELDLPPGDPCEAGLLQLDVSLLRAQLRGSRLLDAMRMYRQGYPDHMVFSEFRRRFD 1080 1090 1100 1110 1120 1130 480 490 500 510 520 530 mKIAA2 ILTPNAIPK-G----FMDGKQACEKMIQALELDPNLYRVGQSKIFFRAGVLAQLEEERDL .:.:. : : .: :.: :.....:.:. . .: :..:::::.::.:::.:: mKIAA0 VLAPHLTKKHGRNYIVVDEKRAVEELLESLDLEKSSCCLGLSRVFFRAGTLARLEEQRDE 1140 1150 1160 1170 1180 1190 540 550 560 570 580 590 mKIAA2 KVTDIIVSFQAAARGYLARRAFQRRQQQQSALRVMQRNCAAYLKLRNWQWWRLFIKVKPL ... .. :::: ::::::. :..:. :. :.: .:.: ...: ::.:: :.:: mKIAA0 QTSRHLTLFQAACRGYLARQHFKKRKIQDLAIRCVQKNIKKNKGVKDWPWWKLFTTVRPL 1200 1210 1220 1230 1240 1250 600 610 620 630 640 650 mKIAA2 LQVTRQDEVLQARAQELQKVQELQQQSAREVGELQGRVAQLEEERTRLAEQL---RAEAE .:: ..: .. . .:.:... .. .: .::. .:: . ..:. .: : .: mKIAA0 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: .. : : . :. : : :.. .:.: .. .. mKIAA1 DLLDTRELLEELLEGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKE--EVASHDQEVEHVRLQYQRD 510 520 530 540 550 560 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA2 LSSAESQLHD-TQE-LLQEETRAKLALGSRVRALEAEAAGLREQMEEEVVARERAGRELQ . . ...: ::. : : :.. : :: :. : :. . .. .::. mKIAA1 TEQLRRSMQDATQDHAALEAERQKMS--SLVRELQRELEETSEETGHWQSMFQKNKEELR 570 580 590 600 610 620 1120 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA2 STQAQLSEWRRRQEEEAAVLEAGEEARRRAAREAETLTQRLAEKTEAVERLERARRRLQQ .:. .: . : ..:: : :. .: ..:.. :. :. ::.:.. :: : mKIAA1 ATKQELLQLRMEKEEMEEELGEKMEVLQRDLEQARASTR----DTHQVEELKKELRRTQG 630 640 650 660 670 1180 1190 1200 1210 1220 1230 mKIAA2 ELDDATVDLGQQKQLLSTLEKKQRKFDQLLAEEKAAVLRAVEDRERIEAEGREREARALS :: . .. ::.: : :. .:.: :.. :.:: :: ::: : . :. mKIAA1 ELKELQAE--QQNQ-----EVTGRHQNQVL-EKQLAALREEADR------GRELEQQNLQ 680 690 700 710 720 1240 1250 1260 1270 mKIAA2 LTRALEE-----EQEAREELERQNRAL-----RAELEALLSS----KDDVGKNV----HE : ..:.. :. .. .. ...:. :: .:. : .:. . . .. mKIAA1 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