FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0897.ptfa, 1140 aa vs ./tmplib.26680 library 1767877 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8572+/-0.00789; mu= 6.3785+/- 0.523 mean_var=329.4508+/-77.893, 0's: 0 Z-trim: 27 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0707 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4112 ( 1261 res) mfj10349 (1261) 1368 154 1.1e-37 mKIAA1026 ( 808 res) mfj07295 ( 808) 448 60 1.4e-09 mKIAA1230 ( 990 res) mfj00035 ( 990) 381 54 1.8e-07 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 271 43 0.0006 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 240 39 0.0043 mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 237 39 0.0055 >>mKIAA4112 ( 1261 res) mfj10349 (1261 aa) initn: 4258 init1: 1207 opt: 1368 Z-score: 769.3 bits: 154.4 E(): 1.1e-37 Smith-Waterman score: 4813; 65.435% identity (73.186% ungapped) in 1218 aa overlap (5-1107:28-1231) 10 20 30 mKIAA0 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. .. : . :. ..: mKIAA1 RKESEDAVK-------------ALAKEKDLLEREKWE----LRRQA--------KEATDH 220 230 240 250 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 AMMLQEQLDAINQEIRMIQEE----KESTELRAEEIETRVTSGSMEALNLTQLRKRGSIP : :. ::: ..... .. : :.: .... : : .: . .. . .. . mKIAA1 AAALRSQLDLKDNRMKELEAELAMAKQSLATLTKDVPKR-HSLAMPGETVLNGNQEWVVQ 260 270 280 290 300 310 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 TSLTALSLASASPPLSGRSTPKLTSRSAAQDLDRMGVMTLPSDLRKHRRKLLSPVSREEN ..: . : .: : . ::. : . : :. ...: .: :. mKIAA1 ADLPLTAAIRQSQQTLYHSHPP-------HPADRQ-VRVSPCHSRQP--SVISDASAAEG 320 330 340 350 360 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 REDKATIKCETSPPSSPRTLRLEKLGHPGLSQEEGKSALEGQDSNP--SSSNSSQDSLHK :... . . : :: : . :: : :: :: .: .. .:. .: mKIAA1 --DRSSTPSDINSPRH-RTHSLCNGDSPGPVQ---KSL-----HNPIVQSLEDLEDQKRK 370 380 390 400 410 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 GAKRKGIKSSIGRLF--GKKEKGRLIQLSRDATGHVLLTDSELSLQEPMVPAKLGTQAEK :.: .::.:.: ::..:. : :. .. : :::.: . . mKIAA1 KKKEKMGFGSISRVFARGKQRKSLDPGLFDDSDSQCSPTRHSLSLSEG--------EEQM 420 430 440 450 460 780 790 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... : .. .: : :.... .. : mKIAA1 FMGSLRALH----LVEDLRGLLEMMETDEKEGLRCQIPDSTAEVLIEWLQNQMTNGHLPG 60 70 80 90 100 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 KEDM-EERITTLE--KRYLAAQREATSIHDLNDKLENELANKESLHRQCEEKARHLQELL . :. .::.. :: :. :. : .:. :.:..: . . ..:. : :. : : : mKIAA1 NGDVYQERLARLENDKESLVLQ---VSV--LTDQVEAQGEKIRDLEF-CLEEHR---EKL 110 120 130 140 150 320 330 340 350 360 mKIAA0 EVAEQKLQQTMRKAETLP----EVEAELSQRIAALTKAEERHGNIEEHLRQLEGQLEEKN ...:. ::: . . .: :. ::.:. :: .:. . . :...:. :: ..: : mKIAA1 NATEEMLQQELLSRTSLETQKLELMAEISNLKLKLTAVEKDRLDYEDRFRDTEGLIQEIN 160 170 180 190 200 210 370 380 390 400 410 mKIAA0 QELARVRQREKMNEDHNKRLSDTVDRLLS-----ESNE----RLQLHL--KERMAALEEK . .: . . ...:.:..: :.: : : .: ::: .: : . ..: mKIAA1 DLRLKVNEMDGERLQYEKKLKSTKDELASLKEQLEEKECEVKRLQERLVCKAKGEGIEVL 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 GRLSEEIEKLRQ---EVDQLKGRGGPFVDGIHSRSHVGSAADVRFSLSTATHAPPGLHRR : . .::.. ::...: .. . . . . . :.: :: : mKIAA1 DRDENIKKKLKEKNIEVQKMKKAVESLMAANEEKER--KIEDLRQCLS-----------R 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