FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1964.ptfa, 801 aa vs ./tmplib.26680 library 1768216 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0452+/-0.0057; mu= 13.1322+/- 0.381 mean_var=157.7145+/-36.262, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1021 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1092 ( 889 res) mbg09321 ( 889) 1452 226 1.2e-59 mKIAA1069 ( 1289 res) mfj10223 (1289) 720 119 4.5e-27 mKIAA0450 ( 1592 res) mbg09026 (1592) 714 118 9.5e-27 mKIAA0581 ( 962 res) mbg02025 ( 962) 571 96 1.5e-20 mKIAA1516 ( 1364 res) mbg09342 (1364) 562 95 4.8e-20 mKIAA4098 ( 1048 res) mpg00558 (1048) 516 88 4.4e-18 >>mKIAA1092 ( 889 res) mbg09321 (889 aa) initn: 1279 init1: 922 opt: 1452 Z-score: 1163.1 bits: 226.2 E(): 1.2e-59 Smith-Waterman score: 1452; 38.776% identity (39.968% ungapped) in 637 aa overlap (175-800:16-644) 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 VREGHQSEGLRRFGGAFAPACCLTIAFKGRRKNLDLAAPTAEEAQR-WVRGLAKLRARLD ...::. . .. . :. . . . .: mKIAA1 ANIWVTGLRYLISYGKHTLDMLESSQDNMRTSWISQMFS-EIDVD 10 20 30 40 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 AMSQRERLDQSFKEIKSLLRMVNVDMNDMYAYRLFKECDHSNNERLEGAEIEAFLRRLLK .... : .. . :..: .... .. .: : :....: . ::.: ..: mKIAA1 GLGHIT-LCHAVQCIRNLNPGLKTSKIELKFKELHKSKDKAGTEITKEEFIEVF-HELCT 50 60 70 80 90 100 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 RPELEEIFRRYSGEDRVLSASELLEFLE-DQGEDGATLACAQQLIQTYELNETGEQHELM :::. .. ..:.. . :....:. ::: .:: . . ..:. :: .. :... . mKIAA1 RPEIYFLLVQFSSNKEFLDTKDLMMFLEAEQGVAHINEEISLEIIHKYEPSKEGQEKGWL 110 120 130 140 150 160 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 TLDGFMMYLLSPEGAALNVAHTCVFQDMGQPLAHYFISSSHNTYLTDSQIGGTSSTEAYI ..::: ::.::. .. : : ::: :::.::::.::::::: ..:. : :. .:: mKIAA1 SIDGFTNYLMSPDCYIFDPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTYLIEDQFRGPSDITGYI 170 180 190 200 210 220 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 RAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVIQAVRDHAFTSSPYPVILSLE ::. .::: :::: :.:: .::::: :::.::.:.::.::. . .:: .: ::.:: :: mKIAA1 RALKMGCRSVELDVWDGPDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDIINKYAFFASEYPLILCLE 230 240 250 260 270 280 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 NHCGLEQQAVMARHLRSILGDMLVTQALDSQNPEE--LPSPEQQLKGRILVKGKKLPAAR :::...:: ::..:...:::: : : : : :: ::::. :::.::.:.::: . mKIAA1 NHCSIKQQKVMVQHMKKILGDKLYTT---SPNMEESYLPSPDV-LKGKILIKAKKLSSNC 290 300 310 320 330 510 520 530 540 550 mKIAA1 SE-DGRILSDREEEEEEEEEAEEALEAAEQRSRAK-QISPELSALAVYCCATRLRTLDPS : .: . .. : : .. ..: .: .. . :. ::: :. : ..... .. : mKIAA1 SGVEGDVTDEDEGAEMSQRMGKENVEQPNHVPVKRFQLCKELSELVSICKSVQFKEFQVS 340 350 360 370 380 390 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 PGPPQSCTVGSLSERKARKFTREAGTSFVRHNTQQLTRVYPLGLRMNSANYNPQEMWNSG . : :..: : :.. : .:: .: . :.::.: .:..:.:.:::..:. : mKIAA1 FQVQKYWEVCSFNEVLASKYANENPGDFVNYNKRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDFWKCG 400 410 420 430 440 450 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 CQLVALNFQTPGYEMDLNTGRFLINGQCGYVLKPAYLRQLNTTFDPEC----PGPPRTTL ::.::.:::::: ::::.: : ::.:::::.:: .:. . :. . :: : mKIAA1 CQIVAMNFQTPGLMMDLNVGWFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVSPQLL 460 470 480 490 500 510 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 AIQVLTAQQLPK-LNAEKPSSIVDPLVRVEIHGVPEDCAQKETDYVLNNGFNPCWEQTLQ :.....:..:: .. ...::: : :::::.: :::...: : .:: : ...... mKIAA1 HIKIISGQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVNQNGDAPIFDESFE 520 530 540 550 560 570 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 FRLRAPELVLVRFVVEDYDTTSPNDFVGQSTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLAPATLF :.. :::..::::: : : . ..:.:: :.:. :. ::::. : : : :: :.:: mKIAA1 FQINLPELAMVRFVVLDDDYIG-DEFIGQYTIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAHASLF 580 590 600 610 620 630 800 mKIAA1 VHIRIQNS ::. : : mKIAA1 VHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVFKNAQPPIRDATDLRE 640 650 660 670 680 690 >>mKIAA1069 ( 1289 res) mfj10223 (1289 aa) initn: 739 init1: 306 opt: 720 Z-score: 578.4 bits: 118.6 E(): 4.5e-27 Smith-Waterman score: 730; 33.951% identity (47.414% ungapped) in 486 aa overlap (435-798:14-483) 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 VIYHGHTLTSKILFRDVIQAVRDHAFTSSPYPVILSLENHCGLEQQAVMARHLRSILGDM .:::::.::::...:: .:..:..:: : mKIAA1 AIDRPWLCCCSLRFPVILSIENHCSIQQQRKIAQYLKGILQDK 10 20 30 40 470 480 490 500 510 mKIAA1 LVTQALDSQNPEELPSPEQQLKGRILVKGKKLP---AARSEDGRILSDREEEEEEEEE-- : ...:. . ..:::: :.:::.::::::::: . .:.:.. ::.. .: :.: mKIAA1 LDLSSVDTGECRQLPSP-QSLKGKILVKGKKLPYHLGDDAEEGEV-SDEDSADEIEDECK 50 60 70 80 90 100 520 mKIAA1 ------------------------------------------------AEEALEAAEQ-- ..:.:.: . mKIAA1 FKLHYSNGTTEHQVESFIRKKLESLLKESQIRDKEDPDSFTVRALLKATDEGLNAHLKQN 110 120 130 140 150 160 530 mKIAA1 --------------------------RSRAKQIS----------P--------------- .::.:. : : mKIAA1 LDVKESGKKSHGRSLMANFGKHKKATKSRSKSYSTDDEDDSLQNPGKEGGQLYRLGRRRR 170 180 190 200 210 220 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 ------ELSALAVYCCATRLRTL--DPSPGPPQSCTVGSLSERKARKFTREAGTSFVRHN ::: :.:: .. . . : . : .: :.:: .:.. ... . .:. .: mKIAA1 TMKLCRELSDLVVYTNSVAAQDIVDDGTTG-----NVLSFSETRAHQVVQQKSEQFMIYN 230 240 250 260 270 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 TQQLTRVYPLGLRMNSANYNPQEMWNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNTGRFLINGQCGYVL .::::.:: . :..:.:.:: .::.::::::::.:. : :..: ..: ::.:::.: mKIAA1 QKQLTRIYPSAYRIDSSNFNPLPYWNAGCQLVALNYQSEGRMMQINRAKFKANGNCGYIL 280 290 300 310 320 330 660 670 680 690 700 mKIAA1 KPAYLRQLNTTFDP----ECPGPPRTTLAIQVLTAQQLPK----LNAEKPSSIVDPLVRV :: . . ::.: :. :. : ..:...::::: . ... . :.::.:.: mKIAA1 KPQQMCK--GTFNPFSGDPLPANPKKQLILKVISGQQLPKPPDSMFGDR-GEIIDPFVEV 340 350 360 370 380 390 710 720 730 740 750 760 mKIAA1 EIHGVPEDCAQKETDYVLNNGFNPCWEQTLQFRLRAPELVLVRFVVEDYDTTSPNDFVGQ :: :.: :: . .: : .::::: ::.:: : .. ::..::::.: :.: . ::::: mKIAA1 EIIGLPVDCCKDQTRVVDDNGFNPVWEETLTFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIG-RDFVGQ 400 410 420 430 440 450 770 780 790 800 mKIAA1 STLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLAPATLFVHIRIQNS :. .::: ::::..: .: :. :..:::: :. mKIAA1 RTVTFSSLVPGYRHVYL---EG--LTEASIFVHITINEIFGKNRQLQGLKGLFNKNPRHA 460 470 480 490 500 mKIAA1 SSENNSHYVRKRSIGDRILRRTASAPAKGRKKSKVGFQEMVEIKDSVSEASRDQDGVLRR 510 520 530 540 550 560 >>mKIAA0450 ( 1592 res) mbg09026 (1592 aa) initn: 1404 init1: 594 opt: 714 Z-score: 572.6 bits: 117.8 E(): 9.5e-27 Smith-Waterman score: 1495; 34.199% identity (42.857% ungapped) in 886 aa overlap (83-800:10-884) 60 70 80 90 100 mKIAA1 QVAAPLAFPPSPASSDSSTKRPGLRALKKMGLTEDE---DVQAMLRGSRLLKIRSRTWHK ::..:. ..:: .:....:.:. . mKIAA0 AMEEPGPPGGLSQDQVERCMSAMQEGTQMVKLRGSSKGL 10 20 30 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 ERLYRLQEDGLSV-WFQRRIPRAASKHIFFVQHIEAVREGHQSEGLRRF-GGAFAPACCL :.: :.: . : : : : . .. :. : ::.::: ..:. ..: : ::. mKIAA0 VRFYYLDEHRSCLRW---RPSRKNEKAKISIDSIQEVSEGRQSEIFQRYPDSSFDPNCCF 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 mKIAA1 TIAFKGRRKNLDLAAPTAEEAQRWVRGLAKLRARL---DAMSQRER-----LDQSF---- .: ..:..:::..:..:::. :: :: : : . :....:.: : :.: mKIAA0 SIYHGSHRESLDLVSPSSEEARTWVTGLRYLMAGISDEDSLARRQRTRDQWLKQTFDEAD 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 mKIAA1 ---------KEIKSLLRMVNVDMNDMYAYRLFKECDHSNNERLEG-AEIEAFLRRLLKRP .:. .::. .::.. . . ..:.: : .... : :. :: . . : mKIAA0 KNGDGSLSISEVLQLLHKLNVNLPRQRVKQMFREADTDDHQGTLGFEEFCAFYKMMSTRR 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 ELEEIFRRYSGEDRVLSASELLEFLE-DQGEDGATLACAQQLIQTYELNETGEQHELMTL .: .. ::.. :.::.: .::: .: .:.:: :..:. .: .... .. . mKIAA0 DLYLLMLTYSNHKDHLDASDLQRFLEVEQKMNGVTLESCQNIIEQFEPCLENKSKGMLGI 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 mKIAA1 DG--------------------FMMYLLSPEGAALNVAHTCVFQDMGQPLAHYFISSSHN :: : : :: : .: :. : ::: :::.::::.:::: mKIAA0 DGSREPSPVMEIHHGAPVYTAGFTNYTRSPAGDIFNPEHNRVHQDMTQPLSHYFITSSHN 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 TYLTDSQIGGTSSTEAYIRAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVIQA :::. .:. . : .. : .. ::::::.:::.:: :::...::.::::::::.:::.. mKIAA0 TYLVGDQLMSQSRVDMYAWVLQAGCRCVEVDCWDGPDGEPIVHHGYTLTSKILFKDVIET 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 VRDHAFTSSPYPVILSLENHCGLEQQAVMARHLRSILGDMLVTQALDSQNPEELPSPEQQ . .:: .. ::::::.::::.. :: ::..: .:::: : ....:.. :::: :. mKIAA0 INKYAFIKNEYPVILSIENHCSVVQQKKMAQYLTDILGDKLDLSSVSSEDATMLPSP-QM 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 mKIAA1 LKGRILVKGKKLPAARSED---GRILSDREEEEEEEEEAEE-ALEAAEQRSRAKQISPE- :::.:::::::::: ::: :.. ::.. .: :.. . .:. .:.:...:. . mKIAA0 LKGKILVKGKKLPANISEDAEEGEV-SDEDSADEMEDDCKLLNGDASTNRKRVENIAKKK 460 470 480 490 500 510 540 550 mKIAA1 LSALA----VYCCAT----RLRTLDPS--------------------------------- :..: . : . ::.:: mKIAA0 LDSLIKESKIRDCEDPNDFSVSTLSPSGKLGRKAEAKKGQSKVEEDVEAGEDSGVSRQNS 520 530 540 550 560 570 560 mKIAA1 --------------------------------PGPPQSCT-------------------- :: . : mKIAA0 RLFMSSFSKRKKKGSKIKKVASVEEGDETLDSPGSQSRGTARQKKTMKLSRALSDLVKYT 580 590 600 610 620 630 570 580 590 600 mKIAA1 -----------------VGSLSERKARKFTREAGTSFVRHNTQQLTRVYPLGLRMNSANY :.:.:: ::... .. :...: : .::.:.:: . :..:.:: mKIAA0 KSVGTHDVEIEVVSSWQVSSFSETKAHQILQQKPTQYLRFNQHQLSRIYPSSYRVDSSNY 640 650 660 670 680 690 610 620 630 640 650 660 mKIAA1 NPQEMWNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNTGRFLINGQCGYVLKPAYLRQ--LNTTFDPECP ::: .::.:::.::::.:. : ..:: ..: ::.::::::: . : .: . . : mKIAA0 NPQPFWNAGCQMVALNYQSEGRMLQLNRAKFSANGDCGYVLKPQCMCQGVFNPNSEDPLP 700 710 720 730 740 750 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 GPPRTTLAIQVLTAQQLPKLNAE---KPSSIVDPLVRVEIHGVPEDCAQKETDYVLNNGF : . ::......::::: . :.::.:.::. :.: ::....: : .::: mKIAA0 GQLKKQLALRIISGQQLPKPRDSVLGDRGEIIDPFVEVEVIGLPVDCSKEQTRVVDDNGF 760 770 780 790 800 810 730 740 750 760 770 780 mKIAA1 NPCWEQTLQFRLRAPELVLVRFVVEDYDTTSPNDFVGQSTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDG :: ::.:: : .. ::..::::.: :.: . ::.:: :: .::. ::::..: .: mKIAA0 NPMWEETLVFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIG-RDFIGQRTLAFSSIMPGYRHVYL---EG 820 830 840 850 860 870 790 800 mKIAA1 ASLAPATLFVHIRIQNS . :..:::. ... mKIAA0 --MEEASIFVHVAVSDISGKVKQTLGLKGLFLRGTKPGSLDSHAAGQPLPRPSVSQRLLR 880 890 900 910 920 >>mKIAA0581 ( 962 res) mbg02025 (962 aa) initn: 878 init1: 323 opt: 571 Z-score: 461.2 bits: 96.5 E(): 1.5e-20 Smith-Waterman score: 984; 34.444% identity (38.509% ungapped) in 540 aa overlap (304-800:16-541) 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 YSGEDRVLSASELLEFLEDQGEDGATLACAQQLIQTYELNETGEQHELMTLDGFMMYLLS : ::. :: : . .. :..:::: :: . mKIAA0 RLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNSSLAKKGQMSVDGFMRYLSG 10 20 30 40 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 PEGAALNVAHTCVFQDMGQPLAHYFISSSHNTYLTDSQIGGTSSTEAYIRAFAQGCRCVE :..... . . .::.:::.::::.:::::::: .:..:.::.: : ... .:::::: mKIAA0 EENGVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTYLTAGQLAGNSSVEMYRQVLLSGCRCVE 50 60 70 80 90 100 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 LDCWEGPGGE--PVIYHGHTLTSKILFRDVIQAVRDHAFTSSPYPVILSLENHC-GLEQQ ::::.: .: ::: :: :.:..: :..::.:. . :: .::.:..::.::: . .:: mKIAA0 LDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEISFKEVIEAIAECAFKTSPFPILLSFENHVDSPKQQ 110 120 130 140 150 160 460 470 480 490 500 mKIAA1 AVMARHLRSILGDMLVTQALDSQNPEE----LPSPEQQLKGRILVKGKKLPAARSED--- : ::.. : :.:: :. . :. . : : :::: ..: .::::.:: :: mKIAA0 AKMAEYCRLIFGDALLMEPLE-KYPLESGVPLPSP-MDLMYKILVKNKKKSHKSSEGSGK 170 180 190 200 210 220 510 520 530 mKIAA1 -------------------------GRILSDREEEEEEEEEAEEALEAAEQRSRAKQISP :. .. ........ . ... . :.: . . mKIAA0 KKLSEQASNTYSDSSSVFEPSSPGAGEADTESDDDDDDDDCKKSSMDEGTAGSEA-MATE 230 240 250 260 270 280 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 ELSALAVYCCATRLRTLDPSPGPPQSCTVGSLSERKARKFTREAGTSFVRHNTQQLTRVY :.: :. : ....... : .: ..:. : :. . .. . ::..: .::.:.: mKIAA0 EMSNLVNYIQPVKFESFEISKKRNKSFEMSSFVETKGLEQLTKSPVEFVEYNKMQLSRIY 290 300 310 320 330 340 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 PLGLRMNSANYNPQEMWNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNTGRFLINGQCGYVLKPAYLRQL : : :..:.:: :: .::.:::.::::::: :..: : . ::. :: ::: ..:. mKIAA0 PKGTRVDSSNYMPQLFWNAGCQMVALNFQTVDLAMQINMGMYEYNGKSGYRLKPEFMRRP 350 360 370 380 390 400 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 NTTFDPECPGP----PRTTLAIQVLTAQQLPKLNAEKPSSIVDPLVRVEIHGVPEDCAQK . ::: : .::.......: : ..: : :.:.. :.: : .: mKIAA0 DKHFDPFTEGIVDGIVANTLSVKIISGQFL----SDKK---VGTYVEVDMFGLPVDTRRK 410 420 430 440 450 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 --ETDYVLNNGFNPCWEQT-LQFR-LRAPELVLVRFVVEDYDTTSPNDFVGQSTLPLSSL .: .:. :: ::. . :. . : :. .: . :. . :.:. ::.... mKIAA0 AFKTKTSQGNAVNPVWEEEPIVFKKVVLPSLACLR--IAAYEEGGK--FIGHRILPVQAI 460 470 480 490 500 510 780 790 800 mKIAA1 KQGYRHIHLLSKDGASLAPATLFVHIRIQNS . ::..: : .. . :. ..::.:.... mKIAA0 RPGYHYICLRNERNQPLTLPAVFVYIEVKDYVPDTYADVIEALSNPIRYVNLMEQRAKQL 520 530 540 550 560 570 >>mKIAA1516 ( 1364 res) mbg09342 (1364 aa) initn: 932 init1: 459 opt: 562 Z-score: 452.3 bits: 95.3 E(): 4.8e-20 Smith-Waterman score: 851; 30.551% identity (41.000% ungapped) in 671 aa overlap (285-797:391-1048) 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 EAFLRRLLKRPELEEIFRRYSGEDRVLSASELLEFLED-QGEDGATLACAQQLIQTYELN .: .:: . ::: : ..:: .: . mKIAA1 ISDAIAAASIVTNGTGIESTSLGIFGVGILQLNDFLVNCQGEH-CTYDEILSIIQKFEPS 370 380 390 400 410 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 ETGEQHELMTLDGFMMYLLSPEG-AALNVAHTCVFQDMGQPLAHYFISSSHNTYLTDSQI . .. :....:: .:.. .. :. : ... ::..:.: :::::::: :. mKIAA1 VSMCHQGLLSFEGFARFLMDKDNFASKNDESRENKKELQLPLSYYYIESSHNTYLTGHQL 420 430 440 450 460 470 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 GGTSSTEAYIRAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVIQAVRDHAFTS : ::.: : ... :::: .:::::.: : :.::::::::.:: :..:..:. :: . mKIAA1 KGESSVELYSQVLLQGCRSIELDCWDGDDGMPIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAFIT 480 490 500 510 520 530 440 450 460 470 480 mKIAA1 SPYPVILSLENHCGLEQQAVMARHLRSILGDMLVTQAL---DSQNPEELPSPEQQLKGRI : :.:.:.::::.: :: ::. ..:..:. ::.. : : .. ::::.: :. .. mKIAA1 SDLPIIISIENHCSLPQQRKMAEIFKSVFGEKLVAKFLFETDFSDDPMLPSPDQ-LRRKV 540 550 560 570 580 590 490 500 mKIAA1 LVKGKKL---------------------------------PAARSE-------------- :.:.::: ::. : mKIAA1 LLKNKKLKAHQTPVDILKQKAHQLASMQAQAFTGGNANPPPASNEEEEDEEDEYDYDYES 600 610 620 630 640 650 510 520 530 mKIAA1 --DGRILSDREEEE--------EEEEEAEEALEAAEQRS--------------------- : :: :: :.. : .::. . .. :.. : mKIAA1 LSDDNILEDRPENKSCADKLQFEYNEEVPKRIKKADNSSGNKGKVYDMELGEEFYLPQNK 660 670 680 690 700 710 540 550 560 mKIAA1 -RAKQISPELSALAVYCCATR---LRTLDPS------------------PG---PPQ--- ...::.:::: :..:: :.. : ::. : :: : . mKIAA1 KESRQIAPELSDLVIYCQAVKFPGLSTLNSSGSSRGKERKSRKSIFGNNPGRMSPGETAP 720 730 740 750 760 770 570 580 mKIAA1 --------SCT-----------------------------VGSLSERKARKFTREAGTSF :: ..::.: :... :... .. mKIAA1 FNRTSGKGSCEGMRHTWEESSPLSPSTSLSAIIRTPKCYHISSLNENAAKRLCRRGSQKL 780 790 800 810 820 830 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 VRHNTQQLTRVYPLGLRMNSANYNPQEMWNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNTGRFLINGQC ..:.. :: :.:: . :..:.: :: .: : ::::::.:: . ::.. : :: : mKIAA1 IQHTAYQLLRTYPAATRIDSSNPNPIMFWLHGIQLVALNYQTDDLPLHLNAAMFEANGGC 840 850 860 870 880 890 650 660 670 680 690 mKIAA1 GYVLKPAYLRQLNTTFDPECP-----GPPRTTL-----AIQVLTAQQLPKLNAEKPSSIV :::::: : .: :: .: . : :: :: . :. .: mKIAA1 GYVLKPPVL------WDKSCPMYQKFSPLERDLDNLDPAIYSLTI--ISGQNVCPSNSTG 900 910 920 930 940 950 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 DPLVRVEIHGVPEDCAQKETDYVLNNGFNPCWEQTLQFRLRAPELVLVRFVVEDYDTTSP .: ..:.. :.: : . .: . : .:: :.. . ::.. .::..::.: . .... mKIAA1 SPCIEVDVLGMPLDSCHFRTKPIHRNTLNPMWNEQFLFRVHFEDLVFLRFAVVENNSSA- 960 970 980 990 1000 760 770 780 790 800 mKIAA1 NDFVGQSTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLAPATLFVHIRIQNS ...: .:: .::.::::..: . . : ..::.. : mKIAA1 --ITAQRIIPLRALKRGYRHLQLRNLHNEILEISSLFINSRRMEENPSGSSMPASLMFNT 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA1 EERKCSQTHKVTVHGVPGPEPFAVFTINEGTKAKQLLQQVLAVDQDTKCTATDYFLMEEK 1070 1080 1090 1100 1110 1120 >>mKIAA4098 ( 1048 res) mpg00558 (1048 aa) initn: 982 init1: 380 opt: 516 Z-score: 416.9 bits: 88.4 E(): 4.4e-18 Smith-Waterman score: 974; 32.456% identity (39.643% ungapped) in 684 aa overlap (218-792:207-875) 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 AQRWVRGLAKLRARLDAMSQRERLDQSFKEIKSLLRMVNVDMNDMYAYRLFKEC--DHSN .:..:.: ..: . . . .. : . . mKIAA4 ILAQNASRNTFLRKAYTKLKLQVNQDGRIPVKNILKMFSADKKRVETA--LESCGLNFNR 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 mKIAA1 NERLEGAE-----IEAFLRRLLKRPELEEIFRRYSGEDR-VLSASELLEFLEDQGED--- .: .. : .: :: .: ::....:. . ... . :. .:..:.... .: mKIAA4 SESIRPDEFPLEIFERFLNKLCLRPDIDKILLEIGAKGKPYLTLEQLMDFINQKQRDPRL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 GATL------ACAQQLIQTYELNETGEQHELMTLDGFMMYLLSPEGAALNVAHTCVFQDM . .: . :. ::. :: :. ... :...:: :: . :.. : . . .:: mKIAA4 NEVLYPPLRSSQARLLIEKYETNKQFLERDQMSMEGFSRYLGGEENGILPLEALDLSMDM 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 GQPLAHYFISSSHNTYLTDSQIGGTSSTEAYIRAFAQGCRCVELDCWEG--PGGEPVIYH :::. :::.:::::::: .:..: ::.: : .:. :::::::: :.: : :: : : mKIAA4 TQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGPSSVEMYRQALLWGCRCVELDVWKGRPPEEEPFITH 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 GHTLTSKILFRDVIQAVRDHAFTSSPYPVILSLENHC-GLEQQAVMARHLRSILGDMLVT : :.:... .:::..:. . :: .::::::::.::: . .::: ::.. :::.:: :. mKIAA4 GFTMTTEVPLRDVLEAIAEAAFKTSPYPVILSFENHVDSAKQQAKMAEYCRSIFGDALLI 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 mKIAA1 QALDSQNPE----ELPSPEQQLKGRILVKGKKL--PAARSEDGRI-----------LS-- . :: . : :::: :.: ::::::.:: :.. :. . :: mKIAA4 DPLD-KYPLSAGIPLPSP-QDLMGRILVKNKKRHRPSTGVPDSSVRKRPLEQSNSALSES 480 490 500 510 520 530 510 mKIAA1 ---------------------------------------------------------DRE ::: mKIAA4 SAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVGLEKTSLEPQKSLGEESLSREPNVPMPDRDRE 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 mKIAA1 EEEEEEEEAEEA---LEAAEQRSRAKQI--SPELSALAVYCCATRLRTLDPSPGPPQSCT .:::.::: : . .... . .... . :.:.:. : ....... . . mKIAA4 DEEEDEEEEETTDPKKPTTDEGTASSEVNATEEMSTLVNYVEPVKFKSFEAARKRNKCFE 600 610 620 630 640 650 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 VGSLSERKARKFTREAGTSFVRHNTQQLTRVYPLGLRMNSANYNPQEMWNSGCQLVALNF ..:. : :: . .. ::..: :::.:.:: : :..:.:: :: .:: ::::::::: mKIAA4 MSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLSRIYPKGTRVDSSNYMPQLFWNVGCQLVALNF 660 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 QTPGYEMDLNTGRFLINGQCGYVLKPAYLRQLNTTFDPECP----GPPRTTLAIQVLTAQ :: :.::.: : ::. ::.::: ..:. . .::: : ..: ..:...: mKIAA4 QTLDLPMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFMRRPDKSFDPFTEVIVDGIVANALRVKVISGQ 720 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 mKIAA1 QLPKLNAEKPSSIVDPLVRVEIHGVPEDCAQK-ETDYVLNNGFNPCW-EQTLQF-RLRAP : ..: .: :.:.. :.: : .: .: .:.::: : :. ..: .. : mKIAA4 FL----SDKKVGIY---VEVDMFGLPVDTRRKYRTRTSQGNSFNPVWDEEPFDFPKVVLP 780 790 800 810 820 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 ELVLVRFVVEDYDTTSPNDFVGQSTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLA-PATLFVHIRI :. .:... . . :::. ::.:....::... : .. . : :: :. mKIAA4 TLASLRIAAFEEG----GKFVGHRILPVSAIRSGYHYVCLRNEANQPLCLPALLIYTEAS 830 840 850 860 870 880 800 mKIAA1 QNS mKIAA4 DYIPDDHQDYAEALINPIKHVSLMDQRAKQLAALIGESEAQASTETYQETPCQQPGSQLP 890 900 910 920 930 940 801 residues in 1 query sequences 1768216 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:56:39 2006 done: Mon Mar 27 10:56:40 2006 Scan time: 0.900 Display time: 0.340 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]