# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/meh02165.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1679.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1679, 1608 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7915988 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7334+/-0.000189; mu= 17.4012+/- 0.011 mean_var=77.6575+/-14.644, 0's: 33 Z-trim: 58 B-trim: 34 in 1/66 Lambda= 0.145540 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81892208|sp|Q6P4U0.1|THS7B_MOUSE RecName: Full= (1607) 11830 2495.1 0 gi|109497820|ref|XP_222597.4| PREDICTED: similar t (1607) 11441 2413.4 0 gi|118574152|sp|Q9C0I4.2|THS7B_HUMAN RecName: Full (1608) 10385 2191.7 0 gi|122937257|ref|NP_001073896.1| thrombospondin, t (1577) 10148 2141.9 0 gi|194222198|ref|XP_001490296.2| PREDICTED: simila (1601) 10115 2135.0 0 gi|148707798|gb|EDL39745.1| mCG142630 [Mus musculu (1469) 9567 2019.9 0 gi|126326135|ref|XP_001364202.1| PREDICTED: simila 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