FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1993.ptfa, 527 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768490 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0775+/-0.00511; mu= 9.3003+/- 0.342
 mean_var=163.8987+/-40.210, 0's: 0 Z-trim: 69  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1002

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
mKIAA0414  ( 491 res)   mbg10164                   ( 491)  622  102 1.2e-22
mKIAA0441  ( 699 res)   mbp07087                   ( 699)  375   66 8.1e-12
mKIAA1572  ( 463 res)   mfj40003                   ( 463)  310   57 4.2e-09
mKIAA1675  ( 707 res)   mia50030                   ( 707)  303   56 1.1e-08
mKIAA0924  ( 617 res)   mbp20088                   ( 617)  297   55 1.8e-08
mKIAA1020  ( 642 res)   mpm09294                   ( 642)  292   54 3.1e-08
mKIAA0326  ( 885 res)   mib10041                   ( 885)  289   54 5.1e-08
mKIAA0795  ( 588 res)   mfj41092                   ( 588)  283   53 7.3e-08
mKIAA4234  ( 105 res)   mph00083                   ( 105)  270   50 9.4e-08
mKIAA4205  ( 653 res)   mfj21207                   ( 653)  278   52 1.3e-07
mKIAA4196  ( 437 res)   mfj00049                   ( 437)  272   51 1.8e-07
mKIAA4237  ( 519 res)   mfj17080                   ( 519)  273   52 1.8e-07
mKIAA1954  ( 643 res)   mpj01436                   ( 643)  269   51 3.1e-07
mKIAA0048  ( 622 res)   mid07066                   ( 622)  267   51 3.8e-07
mKIAA4218  ( 601 res)   mpm12334                   ( 601)  265   50 4.5e-07
mKIAA3006  ( 617 res)   mbg05721                   ( 617)  265   50 4.6e-07
mKIAA1015  ( 831 res)   mbh00453                   ( 831)  262   50 7.4e-07
mKIAA4229  ( 450 res)   mfj48069                   ( 450)  257   49 8.4e-07
mFLJ00107  ( 1371 res)   mfj24090                  (1371)  263   51 9.1e-07
mKIAA4227  ( 539 res)   mng13251                   ( 539)  257   49 9.4e-07
mFLJ00187  ( 488 res)   mbg06919                   ( 488)  255   49 1.1e-06
mKIAA1431  ( 833 res)   mfj27243                   ( 833)  257   49 1.2e-06
mKIAA0760  ( 1400 res)   mbg03730                  (1400)  259   50 1.4e-06
mKIAA1710  ( 461 res)   mbg19468                   ( 461)  252   48 1.4e-06
mKIAA0426  ( 508 res)   mpm11025                   ( 508)  252   48 1.5e-06
mKIAA1559  ( 504 res)   mbp01052                   ( 504)  249   48   2e-06
mKIAA1874  ( 435 res)   mbg02924                   ( 435)  248   48   2e-06
mKIAA1141  ( 886 res)   mef00011                   ( 886)  252   49 2.1e-06
mKIAA1852  ( 736 res)   mej02019                   ( 736)  250   48 2.3e-06
mKIAA1396  ( 481 res)   mfj16154                   ( 481)  247   48 2.4e-06
mKIAA1611  ( 558 res)   mph00982                   ( 558)  245   48 3.2e-06
mKIAA1588  ( 617 res)   mbp00262                   ( 617)  245   48 3.4e-06
mKIAA4236  ( 919 res)   mfj05191                   ( 919)  246   48 3.9e-06
mKIAA0628  ( 508 res)   msj08164                   ( 508)  242   47 4.1e-06
mKIAA1948  ( 463 res)   mph00578                   ( 463)  238   46 5.7e-06
mKIAA0569  ( 1248 res)   mbg07960                  (1248)  237   47 1.2e-05
mKIAA0961  ( 486 res)   mph04182                   ( 486)  228   45 1.6e-05
mKIAA0132  ( 637 res)   mfk00029                   ( 637)  224   45 2.8e-05
mKIAA0352  ( 686 res)   meh01314                   ( 686)  224   45   3e-05
mKIAA0354  ( 674 res)   mph01349                   ( 674)  223   44 3.2e-05
mFLJ00127  ( 641 res)   msk07274                   ( 641)  217   44 5.7e-05
mKIAA1900  ( 546 res)   mbg06467                   ( 546)  216   43 5.7e-05
mKIAA0469  ( 604 res)   mpg00435                   ( 604)  213   43 8.2e-05
mFLJ00416  ( 522 res)   msj08249                   ( 522)  210   42  0.0001
mKIAA1354  ( 679 res)   mbh01247                   ( 679)  208   42 0.00015
mKIAA4181  ( 591 res)   mfj29222                   ( 591)  205   42 0.00018
mKIAA4222  ( 543 res)   mkg04188                   ( 543)  203   41 0.00021
mKIAA0236  ( 1852 res)   mbg02771                  (1852)  210   43 0.00022
mKIAA4249  ( 609 res)   mfj01240                   ( 609)  203   41 0.00023
mKIAA1227  ( 1074 res)   mbg20753                  (1074)  206   42 0.00024


>>mKIAA0414  ( 491 res)   mbg10164                        (491 aa)
 initn: 796 init1: 412 opt: 622  Z-score: 499.2  bits: 101.9 E(): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 629;  29.920% identity (33.864% ungapped) in 498 aa overlap (24-492:21-489)

               10        20         30        40        50         
mKIAA1 WLFSVDVAGMESTLEECNSRLRFVSGEMD-NSSFIQFDVPEHSSTVLSQLNELRLQGKLC
                              .. ::. ... .: . :. :::.:..::. : ::.::
mKIAA0    WPWHKEHYPGNTALLLALNKIGDEMEPGTNSFQVEFPDFSSTILQKLNQQRQQGQLC
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      60        70        80        90       100       110         
mKIAA1 DIIVHIQGQPFRAHKAVLAASSPYFRDHSALSTMSGLSISVIKNPSVFEQLLSFCYTGRM
       :. . .::. :.::::::::::::: :.  :..   . .  . :: :::..: : ::::.
mKIAA0 DVSIVVQGHIFQAHKAVLAASSPYFCDQVLLKNSRRIVLPDVMNPRVFENILLFSYTGRL
        60        70        80        90       100       110       

     120       130       140       150       160        170        
mKIAA1 SLQLKDVVSFLTAASFLQMQCVIDKCTQILESIHSKISVGDVDSVTIGAE-ENPESRN--
        .   ..::.:::::::::  :.::::..::.  . .     .... :.. ..: : :  
mKIAA0 VMPAPEIVSYLTAASFLQMWHVVDKCTEVLEGNPTVLC----QKLNHGSDHQSPSSSNYN
       120       130       140       150           160       170   

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mKIAA1 GVKDGSFFTNPVEISPPYCPQVR-----QPPVSSDLRMETTPNKALRS-------RLQEE
       :. ..  . .  . . :   ..:     .  ....:  ..: .. : :       ::. :
mKIAA0 GLVESFELGSGGHTDFPKAQELRDGENEEESTKDELSSQVTEHEYLPSNSSTEHDRLSTE
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          230       240       250       260          270        280
mKIAA1 GHSDRGSSGSVSEYEIQIEGDHEQGDLLVRESQITE---VKVKMEKSDRP-SCSDSSSLG
         :. :  :. .  :.     :    :  . : ...   ..:: :. ..  .  :  .  
mKIAA0 MASQDGEEGTNDSTEF-----HYTRPLYSKPSIMAHRRWIHVKPERLEQAWDGMDVHAAY
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              290         300          310       320         330   
mKIAA1 DDGYHTEMVDGEQV--VAVNVGA---YGSVLQHAYPYSQTASQPSSVPEA--FGGQTNSS
       :.   :: :.  :.   :   ::   .  : ...    .  .. ::  :   : :..   
mKIAA0 DEHQVTESVNTMQTDHSAQPSGAEEEFQIVEKKVEVEFDEQAEGSSYDEQVDFYGSSMEE
      290       300       310       320       330       340        

           340         350       360       370       380       390 
mKIAA1 PSRSMLSCFRGR--GARQKRALSVHLHSDLQGVVQGSDSEAMMNNPGYESSPRERSARGY
        :   :.   :   : .:. ::..    ... ...:   ::  .. :.       ::   
mKIAA0 FSGEKLG---GNLIGHKQEAALAAGYSENIE-MAMGIKEEA--SHLGF-------SATDK
      350          360       370        380         390            

             400       410       420       430       440       450 
mKIAA1 WYPYNERLICIYCGKSFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVCKFCGKKYTRKDQLEYHIRGHTD
        ::      :  :::::..:.. :::: .:.:. :. :. ::::.  : .:  :.. :: 
mKIAA0 LYP------C-QCGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCSVCGKKFKMKHHLVGHMKIHTG
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mKIAA1 DKPFRCEVCGKCFPFQGTLNQHLRKNHPGVTEGRGRMESPERTDMYVEQKLESDASASEM
        ::..:..:.: : .. ....:. .   .   ....... :                   
mKIAA0 IKPYECNICAKRFMWRDSFHRHVTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN                 
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             520       
mKIAA1 ALDSRLEMHTVSDAPD

>>mKIAA0441  ( 699 res)   mbp07087                        (699 aa)
 initn: 1057 init1: 246 opt: 375  Z-score: 304.6  bits: 66.4 E(): 8.1e-12
Smith-Waterman score: 435;  27.015% identity (30.170% ungapped) in 459 aa overlap (41-475:28-462)

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mKIAA1 ESTLEECNSRLRFVSGEMDNSSFIQFDVPEHSSTVLSQLNELRLQGKLCDIIVHIQGQPF
                                     ::.:::..:.. : .: :::: . ...  :
mKIAA0    KPLQSLLEKMADTTPEPCGQLMVHSDTHSDTVLASLEDQRKKGFLCDITLIVENVHF
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               80        90       100         110       120        
mKIAA1 RAHKAVLAASSPYFRDHSALSTMSGLSISVIKN--PSVFEQLLSFCYTGRMSLQLKDVVS
       :::::.::::: ::    :     : :: ....   ..:  :: : ::: .  . : . .
mKIAA0 RAHKALLAASSEYFSMMFAEEGEIGQSIYMLEGMVADTFGILLEFIYTGYLHASEKTTEQ
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      130       140       150            160       170             
mKIAA1 FLTAASFLQMQCVIDKCTQILESIHSK-----ISVGDVDSVTIGAEEN---------PES
       .:..:.::..  .. :    ... ::      ..   .  :.:. ..:         :..
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          180        190       200       210       220        230  
mKIAA1 RNGVKDG-SFFTNPVEISPPYCPQVRQPPVSSDLRMETTPNKALRSRLQEEGHSD-RGSS
        ::...: : ..   :..     .:..    ... ..   .  :  .  :. .:.  :  
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mKIAA1 GSVSEYEIQIEG--DHEQGDLLVRESQITEVKVKMEKSDRPSCSDSSSLGD--DGYHTEM
       ::: :   . .   : . ::   .:::    . ....: .   .: . :::  :   .. 
mKIAA0 GSVEEVPAEKDENFDPKAGDG--QESQSRCSRRRIRRSVK--LKDYKLLGDEDDQSTAKR
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mKIAA1 VDGEQVVAVNVGAYGSVLQHAYPYSQTASQPSSVPEAFGGQTNSSPSRSMLSCFRGRGAR
       . :..  . .  :  .  .... ::.  .  .        .:.  : .    :  :.:  
mKIAA0 LCGRKKRSSGPEARCKDCDRVFKYSHFLAIHQRR------HTGERPFKCN-EC--GKGFA
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       ::..:.::  .:.  .  .    ..:. .. .       .:..       . . :  :::
mKIAA0 QKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCGKALTTKHSLLEHMSLHSGQ-------KSFTCDQCGK
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mKIAA1 SFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVCKFCGKKYTRKDQLEYHIRGHTDDKPFRCEVCGKCFPF
        :.:: .:  :.:.: : .   :. : .:.   .::. :.: :: .::: ::.::: :  
mKIAA0 YFSQKRQLKSHYRVHTGHSLPECSHCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTA
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mKIAA1 QGTLNQHLRKNHPGVTEGRGRMESPERTDMYVEQKLESDASASEMALDSRLEMHTVSDAP
       ...:. :.:                                                   
mKIAA0 KSSLQTHIRIHRGEKPYSCSICGKCFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECGLQFARLDNL
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>>mKIAA1572  ( 463 res)   mfj40003                        (463 aa)
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                             ..:..: . :....:   ......:...:.:: ..:.:
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       :. : :.    ..:: :.::.::..::.  :.    ..::....  : .:::  ::.: .
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mKIAA1 SLQLKDVVSFLTAASFLQMQCVIDKCTQILESIHSKISVGDVDSVTIGAEENPESRNGVK
        .   ..:..:::::::::. ....::: : .. .  .  :    .     .:.:..  .
mKIAA1 EFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCTQALWKFIKPKQPMDSKEGSEPQSASPQSKE--Q
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mKIAA1 DGSFFTNPVEISPPYCPQVRQPPVSSDLRMETTPNKALRSRLQEEGHSDRGSSGSVSEYE
       .:.   .: .  :  : .    :  ... :: .  . .. .          : :.:::  
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mKIAA1 IQIEGDHEQGDLLVRESQITEVKVKMEKSDRPSCSDSSSLGDDGYHTEMVDGEQVVAVNV
            :. . :    :.:          :..:.   ::    .  :. ....     :: 
mKIAA1 -----DRSKKD----ENQYI--------SSEPTALHSS----EPQHS-LINSTVENRVNE
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          . . ..:  :. . .   .  ..::      :                         
mKIAA1 LDQSHLHNYALSYTGNDDIIMTSKDVFG------P-------------------------
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mKIAA1 DLQGVVQGSDSEAMMNNPGYESSPRERSARGYWYPYNERLICIYCGKSFNQKGSLDRHMR
       ...:: .:   .   . :      :.    .    ... ..:. :::.:.:::.: ::::
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mKIAA1 LHMGITPFVCKFCGKKYTRKDQLEYHIRGHTDDKPFRCEVCGKCFPFQGTLNQHLRKNHP
       .: :: :: ::.::: ...: .:. :.  :. ::: .:. :   :  . .: .::.. : 
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mKIAA1 GVTEGRGRMESPERTDMYVEQKLESDASASEMALDSRLEMHTVSDAPD            
                                                                   
mKIAA1 KNSFDNANERSVQDLTVDFDSFACTTVTDSNCQPQPDATQVLDAGKLTQAVLSLRSDSTC
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>>mKIAA1675  ( 707 res)   mia50030                        (707 aa)
 initn: 451 init1: 189 opt: 303  Z-score: 248.3  bits: 56.0 E(): 1.1e-08
Smith-Waterman score: 303;  35.345% identity (35.965% ungapped) in 116 aa overlap (367-480:351-466)

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       ::  : :::: : ....: ::.: : :  :. ::.: .... ...:. :.:. :. .:::
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       .:..:..::  : .:..::.:. : :.                                 
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       .   :    . . :..   .  .....: .:::.::.:  .:.::. : :  ::.:..::
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mKIAA1 KKYTRKDQLEYHIRGHTDDKPFRCEVCGKCFPFQGTLNQHLRKNHPGVTEGRGRMESPER
       :..: . ... : : :: .::. :.:::. : :.. :. : .:                 
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>>mKIAA1020  ( 642 res)   mpm09294                        (642 aa)
 initn: 514 init1: 292 opt: 292  Z-score: 240.1  bits: 54.4 E(): 3.1e-08
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       .. ::::: :::::: ::..    ... .:. ..... .::.:.:.: :::..  : : .
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         .  ..:::::.::.  .   : . :.   . .. : : .. ::               
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          : . : .:  :..:  :     . :.: ..:. :   :  ....:       .. .:
mKIAA1 FDRRETGSKGSCPGEEGEGTGDRVPNGVLASSAGGGGPSASYGEQSFPCKEEEENGKDGS
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mKIAA1 QPSSVPEAFGGQTNSSPSRSM-----------------LSCFRGRGARQKRALSVHLHSD
       . :.   . ::. ...    .                 . : .:  . ..    :. :..
mKIAA1 EDSGQSGSEGGSGHTGAHYVYRQEGYETVSYGDNVYVCIPCAKGFPSSEQLNAHVETHTE
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mKIAA1 LQGVVQ----------GSDSEAM-MNNPG--Y--ESSPRERSA--RGYWYPYNER-----
        .  ..          :.. ::  ...:.  :  .: : . :.  . :  : . :     
mKIAA1 EELFIKEEGAYETGSGGAEEEAEDLSTPSAAYTADSRPFKCSVCEKTYKDPATLRQHEKT
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mKIAA1 ------LICIYCGKSFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVCKFCGKKYTRKDQLEYHIRGHTDD
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mKIAA1 HWLTRPFPCNICGKMFTQRGTMTRHMRSHLGLKPFACDECGMRFTRQYRLTEHMRVHSGE
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mKIAA1 KPFRCEVCGKCFPFQGTLNQHLRKNHPGVTEGRGRMESPERTDMYVEQKLESDASASEMA
       ::..:..::  :  : .: .:::                                     
mKIAA1 KPYECQLCGGKFTQQRNLISHLRMHTSPS                               
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>>mKIAA0326  ( 885 res)   mib10041                        (885 aa)
 initn: 1260 init1: 283 opt: 289  Z-score: 236.3  bits: 54.1 E(): 5.1e-08
Smith-Waterman score: 289;  46.154% identity (48.837% ungapped) in 91 aa overlap (390-480:162-247)

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                                     :   ::    ::  :::::.: ..: ::.:
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       .: :  : .:. :::..:....:  : : :: .::..:  ::::: ....: :: : .: 
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mKIAA1 GVTEGRGRMESPERTDMYVEQKLESDASASEMALDSRLEMHTVSDAPD            
       :                                                           
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>>mKIAA0795  ( 588 res)   mfj41092                        (588 aa)
 initn: 285 init1: 140 opt: 283  Z-score: 233.5  bits: 53.0 E(): 7.3e-08
Smith-Waterman score: 283;  35.507% identity (36.567% ungapped) in 138 aa overlap (26-159:19-156)

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                                :  .  ....:.: :  :   . ..:.: ::::::
mKIAA0        SLLARPAQLRRPGKMVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCD
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       . ..:  . : ::. ::::: :::.   . . :   .  ..    .::..: :..: :.:
mKIAA0 VTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNG
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        .... ..: :.: .:::::.: . : :  .: : .: :  .:                 
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>>mKIAA4234  ( 105 res)   mph00083                        (105 aa)
 initn: 257 init1: 257 opt: 270  Z-score: 231.5  bits: 50.2 E(): 9.4e-08
Smith-Waterman score: 270;  45.000% identity (45.570% ungapped) in 80 aa overlap (401-480:26-104)

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mKIAA4      CEKSFSEKSKLTNHCRVHSRERPHACPECGKSFIRKHHLLEHRRIHTGERPYHCA
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mKIAA4 ECGKRFTQKHHLLEHQRAHTGERPYPCTHCAKCFRYKQSLKYHLR-THTGE         
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mKIAA1 PERTDMYVEQKLESDASASEMALDSRLEMHTVSDAPD

>>mKIAA4205  ( 653 res)   mfj21207                        (653 aa)
 initn: 1045 init1: 264 opt: 278  Z-score: 229.1  bits: 52.4 E(): 1.3e-07
Smith-Waterman score: 278;  42.500% identity (43.038% ungapped) in 80 aa overlap (401-480:520-598)

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mKIAA4 YKCKQCGKSFTQCSSLQKHQVIHTGEKPYRCAECGKSFTQNSTLSQHQRIHTGEKPYKCE
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        ::: .:. ..:. : : :: .::..:::::. :  ......: .. : :          
mKIAA4 ECGKAFTQCSSLRKHQRIHTGEKPYKCEVCGRAFNCRSSFTKH-KRIHTGEKPYKCKDCD
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      610       620       630       640       650   




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