FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0648.ptfa, 1122 aa vs ./tmplib.26680 library 1767895 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8982+/-0.00456; mu= 16.4541+/- 0.304 mean_var=94.0404+/-22.076, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.1323 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0979 ( 1191 res) mbx00002 (1191) 4472 865 0 >>mKIAA0979 ( 1191 res) mbx00002 (1191 aa) initn: 4472 init1: 4472 opt: 4472 Z-score: 4608.8 bits: 864.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 4472; 75.943% identity (75.943% ungapped) in 848 aa overlap (275-1122:1-848) 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 VQTIEACIANFFNQVLVLGRSSVSDLSEHVFDLIQELFAIDPQLLLSVMPQLEFKLKSND :::: ::. :: .:::::.::::::::::: mKIAA0 FDLILELYNIDSHLLLSVLPQLEFKLKSND 10 20 30 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 GEERLAVVRLLAKLFGSKDSDLATQNRPLWQCFLGRFNDIHVPVRLESVKFASHCLMNHP .:::: ::.::::.::.:::.::.::.:::::.::::::::::.::: :::::::::::: mKIAA0 NEERLQVVKLLAKMFGAKDSELASQNKPLWQCYLGRFNDIHVPIRLECVKFASHCLMNHP 40 50 60 70 80 90 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 DLAKDLTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVTIITAAKRDLALVNDQLLGFVRERTLDKRWRVR :::::::::::::::::::::::::::.:.::::.:. ::::.::.:::::::::::::: mKIAA0 DLAKDLTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVSIVTAAKKDILLVNDHLLNFVRERTLDKRWRVR 100 110 120 130 140 150 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 KEAMMGLAQLYKKYCLHGEAGKEAAEKVSWIKDKLLHIYYQNSIDDKLLVEKIFAQYLVP :::::::::.:::: :.. :::.::...::.:::::::::::::::.::::.:::::.:: mKIAA0 KEAMMGLAQIYKKYSLQSAAGKDAAKQISWVKDKLLHIYYQNSIDDRLLVERIFAQYMVP 160 170 180 190 200 210 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 HNLETEERMKCLYYLYASLDPNAVKALNEMWKCQNMLRSHVRELLDLHKQPTSEANCSAM ::::: :::::::::::.:: ::::::::::::::.:: .:..:::: ::: ..:. .:. mKIAA0 HNLETTERMKCLYYLYATLDLNAVKALNEMWKCQNLLRHQVKDLLDLIKQPKTDASVKAI 220 230 240 250 260 270 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 FGKLMTIAKNLPDPGKAQDFVKEFNQVLGDDEKLRSQLELLISPTCSCKQADVCVREIAR :.:.:.:..:::::::::::.:.:.::: ::::.:.::: :.:::::::::. :::::.. mKIAA0 FSKVMVITRNLPDPGKAQDFMKKFTQVLEDDEKIRKQLEALVSPTCSCKQAEGCVREITK 280 290 300 310 320 330 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 KLANPKQPTNPFLEMVKFLLERIAPVHIDSEAISALVKLMNKSIEGTADDEEEGVSPDSA ::.::::::::::::.:::::::::::::.:.::::.: .::::.::::::.::: :.: mKIAA0 KLGNPKQPTNPFLEMIKFLLERIAPVHIDTESISALIKQVNKSIDGTADDEDEGVPTDQA 340 350 360 370 380 390 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 IRSGLELLKVLSFTHPTSFHSAETYESLLQCLRMEDDKVAEAAIQIFRNTGHKIETDLPQ ::.::::::::::::: :::::::.:::: ::.:.:.::::::.:::.::: ::: :.:. mKIAA0 IRAGLELLKVLSFTHPISFHSAETFESLLACLKMDDEKVAEAALQIFKNTGSKIEEDFPH 400 410 420 430 440 450 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 IRSTLIPILHQKAKRGTPHQAKQAVHCIHAIFSNKEVQLAQIFEPLSRSLNADVPEQLIT :::.:.:.::.:.:.: :.::: :.::::::::.::.:.::::::: .::. . :.::: mKIAA0 IRSALLPVLHHKSKKGPPRQAKYAIHCIHAIFSSKETQFAQIFEPLHKSLDPSNLEHLIT 460 470 480 490 500 510 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 PLVSLGHISMLAPDQFASPMKSVVANFIVKDLLMNDRSTGEKNGKLWSPDEEVSPEVLAK :::..:::..:::::::.:.::.::.::::::::::: :.:. ::: ::::::::...: mKIAA0 PLVTIGHIALLAPDQFAAPLKSLVATFIVKDLLMNDRLPGKKTTKLWVPDEEVSPETMVK 520 530 540 550 560 570 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 VYLLRLLVRWLLGMKNNQSKSANSTLRLLSAMLVSEGDLTEQKRISKSDMSRLRLAAGSA . ....::::::::::.:::..::::::...: :.:::::: .::: :::::::::::: mKIAA0 IQAIKMMVRWLLGMKNNHSKSGTSTLRLLTTILHSDGDLTEQGKISKPDMSRLRLAAGSA 580 590 600 610 620 630 910 920 930 940 950 960 mKIAA0 IMKLAQEPCYHEIITPEQFQLCALVINDECYQVRQIFAQKLHKALVKLLLPLEYMAIFAL :.::::::::::::: ::.:::::.::::::::::.:::::::.: .: :::::::: :: mKIAA0 IVKLAQEPCYHEIITLEQYQLCALAINDECYQVRQVFAQKLHKGLSRLRLPLEYMAICAL 640 650 660 670 680 690 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA0 CAKDPVKERRAHARQCLLKNISIRREYIKQNPMATEKLLSLLPEYVVPYMIHLLAHDPDF :::::::::::::::::.:::..::::.::. ..:::::::::::::: :::::::::. mKIAA0 CAKDPVKERRAHARQCLVKNITVRREYLKQHAAVSEKLLSLLPEYVVPYTIHLLAHDPDY 700 710 720 730 740 750 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA0 TRSQDVDQLRDIKECLWFMLEVLMTKNENNSHAFMKKMAENIKLTRDAQSPDESKTNEKL .. ::..::.:.::::::.::.::.:::::::::..::.:::: :.:::.::..: :::: mKIAA0 VKVQDIEQLKDVKECLWFVLEILMAKNENNSHAFIRKMVENIKQTKDAQGPDDTKMNEKL 760 770 780 790 800 810 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 YTVCDVALCVINSKSALCNADSPKDPVLPMKFFTQPEK :::::::. .: :::. . .:::::::: .:::::.: mKIAA0 YTVCDVAMNIIMSKSTTYSLESPKDPVLPARFFTQPDKNFSNTKNYLPPEMKSFFTPGKP 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 KTANVLGAVNKPLSSAGKQSQTKSSRMETVSNASSSSNPSSPGRIKGRLDSSEMDHSENE 880 890 900 910 920 930 1122 residues in 1 query sequences 1767895 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:25:21 2006 done: Mon Mar 27 10:25:23 2006 Scan time: 1.080 Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]